| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002745 | 2325304 = | 267 (1.130) | coding (893/1212 nt) | SA_RS11850 | MFS transporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 265 total aligned reads displayed.
AGAGGCCATTCCTGTTGCTGTAATTATGCTTTTAATTGGCGTTACCTATGCGTCAATCCTAACTTATTTACAAGCATTTGCTTTAGAGCGACACCTAGTCACTGCAGCAAGCTATTTCTTTATTTGCTATGCTATAGCATCGTTAATTACTAGACCTATTGCTGGTAGATTGATGGATGATAAAAATGAAAATATTATTGTCTATCCAGCATTTATCATGCTTTTCCTTTCATTTGTGTGCTTAATTTCAAGCTATCAAAGCTGGTTAATATTACTTGCTGGTGCTTGCCTAGGTTTAGGGTATGGAAATTTATCATCTGCAATGCAATCTATTGCGATAAAAGTCTCACCCCCGATTAAATATGGTATCGCGACATCTACTTTTTACGTTGGTCTAGATGCAGGTGTCGGCTTCGGTCCATCATTCCTTGGGTTATTTACTCATATGTTTTCATATAG > NC_002745/2325068‑2325526 | agagGCCATTCCTGTTGCTGTAATTATGCTTTTAATTGGCGTTACCTATGCGTCAATCCTAACTTATTTACAAGCATTTGCTTTAGAGCGACACCTAGTCACTGCAGCAAGCTATTTCTTTATTTGCTATGCTATAGCATCGTTAATTACTAGACCTATTGCTGGTAGATTGATGGATGATAAAAATGAAAATATTATTGTCTATCCAGCATTTATCATGCTTTTCCTTTCAtt < 1:390239/234‑1 (MQ=255)agagGCCATTCCTGTTGCTGTAATTATGCTTTTAATTGGCGTTACCTATGCGTCAATCCTAACTTATTTACAAGCATTTGCTTTAGAGCGACACCTAGTCACTGCAGCAAGCTATTTCTTTATTTGCTATGCTATAGCATCGTTAATTACTAGACCTATTGCTGGTAGATTGATGGATGATAAAAATGAAAATATTATTGTCTATCCAGCATTTATCATGCTTTTCCTTTCAtt < 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tGCTGTAATTATGCTTTTAATTGGCGTTACCTATGCGTCAATCCTAACTTATTTACAAGCATTTGCTTTAGAGCGACACCTAGTCACTGCAGCAAGCTATTTCTTTATTTGCTATGCTATAGCATCGTTAATTACTAGACCTATTGCTGGTAGATTGATGGATGATAAAAATGAAAATATTATTGTCTATCCAGCATTTATCATGCTTTTCCTTTCAtt < 2:1110043/219‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTATGCTTTTAATTGGCGTTACCTATGCGTCAATCCTAACTTATTTACAAGCATTTGCTTTAGAGCGACACCTAGTCACTGCAGCAAGCTATTTCTTTATTTGCTATGCTATAGCATCGTTAATTACTAGACCTATTGCTGGTAGATTGATGGATGATAAAAATGAAAATATTATTGTCTATCCAGCATTTATCATGCTTTTCCTTTCATTTGTGTGCTTAATTTc < 2:314191/234‑1 (MQ=255) tGCTGTAATTATGCTTTTAATTGGCGTTACCTATGCGTCAATCCTAACTTATTTACAAGCATTTGCTTTAGAGCGACACCTAGTCACTGCAGCAAGCTATTTCTTTATTTGCTATGCTATAGCATCGTTAATTACTAGACCTATTGCTGGTAGATTGATGGATGATAAAAATGAAAATATTATTGTCTATCCAGCATTTATCATGCTTTTCCTTTCATTTGTGTGCTTAATTTc < 1:906177/234‑1 (MQ=255) 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gTCAATCCTAACTTATTTACAAGCATTTGCTTTAGAGCGACACCTAGTCACTGCAGCAAGCTATTTCTTTATTTGCTATGCTATAGCATCGTTAATTACTAGACCTATTGCTGGTAGATTGATGGATGATAAAAATGAAAATATTATTGTCTATCCAGCATTTATCATGCTTTTCCTTTCATTTGTGTGCTTAATTTCAAGCTATCAAAGCTGGTTAATATTACTTGCTGGTGc > 1:1386227/1‑234 (MQ=255) cAATCCTAACTTATTTACAAGCATTTGCTTTAGAGCGACACCTAGTCACTGCAGCAAGCTATTTCTTTATTTGCTATGCTATAGCATCGTTAATTACTAGACCTATTGCTGGTAGATTGATGGATGATAAAAATGAAAATATTATTGTCTATCCAGCATTTATCATGCTTTTCCTTTCATTTGTGTGCTTAATTTCAAGCTATCAAAGCTGGTTAATATTACTTGCTGGTGCtt < 1:176192/234‑1 (MQ=255) ataTCCTAACTTATTTACAAGCATTTGCTTTAGAGCGACACCTAGTCACTGCAGCAAGCTATTTCTTTATTTGCTATGCTATAGCATCGTTAATTACTAGACCTATTGCTGGTAGATTGATGGATGATAAAAATGAAAATATTATTGTCTATCCAGCATTTATCATGCTTTTCCTTTCATTTGTGTGCTTAATTTCAAGCTATCAAAGCTGGTTAATATTACTTGCTGGTGCtt < 1:1000382/232‑1 (MQ=255) 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AGAGGCCATTCCTGTTGCTGTAATTATGCTTTTAATTGGCGTTACCTATGCGTCAATCCTAACTTATTTACAAGCATTTGCTTTAGAGCGACACCTAGTCACTGCAGCAAGCTATTTCTTTATTTGCTATGCTATAGCATCGTTAATTACTAGACCTATTGCTGGTAGATTGATGGATGATAAAAATGAAAATATTATTGTCTATCCAGCATTTATCATGCTTTTCCTTTCATTTGTGTGCTTAATTTCAAGCTATCAAAGCTGGTTAATATTACTTGCTGGTGCTTGCCTAGGTTTAGGGTATGGAAATTTATCATCTGCAATGCAATCTATTGCGATAAAAGTCTCACCCCCGATTAAATATGGTATCGCGACATCTACTTTTTACGTTGGTCTAGATGCAGGTGTCGGCTTCGGTCCATCATTCCTTGGGTTATTTACTCATATGTTTTCATATAG > NC_002745/2325068‑2325526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |