| New junction evidence | |||||||||||
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| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
GCCATTCCTGTTGCTGTAATTATGCTTTTAATTGGCGTTACCTATGCGTCAATCCTAACTTATTTACAAGCATTTGCTTTAGAGCGACACCTAGTCACTGCAGCAAGCTATTTCTTTATTTGCTATGCTATAGCATCGTTAATTACTAGACCTATTGCTGGTAGATTGATGGATGATAAAAATGAAAATATTATTGTCTATCCAGCATTTATCATGCTTTTCCTTTCATTTGTGTGCTTAATTTCAAGCTATCAAAGCTGGTTAATATTACTTGCTGGTGCTTGCCTAGGTTTAGGGTATGGAAATTTATCATCTGCAATGCAATCTATTGCGATAAAAGTCTCACCCCCGATTAAATATGGTATCGCGACATCTACTTTTTACGTTGGTCTAGATGCAGGTGTCGGCTTCGGTCCATCATTCCTTGGGTTATTTACTCATATGTTTTCATATAGTGAAATC > NC_002745/2325072‑2325533 | gCCATTCCTGTTGCTGTAATTATGCTTTTAATTGGCGTTACCTATGCGTCAATCCTAACTTATTTACAAGCATTTGCTTTAGAGCGACACCTAGTCACTGCAGCAAGCTATTTCTTTATTTGCTATGCTATAGCATCGTTAATTACTAGACCTATTGCTGGTAGATTGATGGATGATAAAAATGAAAATATTATTGTCTATCCAGCATTTATCATGCTTTTCCTTTCATTtgtg < 2:122444/234‑1 (MQ=255) tGTTGCTGTAATTATGCTTTTAATTGGCGTTACCTATGCGTCAATCCTAACTTATTTACAAGCATTTGCTTTAGAGCGACACCTAGTCACTGCAGCAAGCTATTTCTTTATTTGCTATGCTATAGCATCGTTAATTACTAGACCTATTGCTGGTAGATTGATGGATGATAAAAATGAAAATATTATTGTCTATCCAGCATTTATCATGCTTTTCCTTTCATTTGTGTGCTTAAt > 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gTAATTATGCTTTTAATTGGCGTCACCTATGCGTCAATCCTAACTTATTTACAAGCATTTGCTTTAGAGCGACACCTAGTCACTGCAGCAAGCTATTTCTTTATTTGCTATGCTATAGCATCGTTAATTACTAGACCTATTGCTGGTAGATTGATGGATGATAAAAATGAAAATATTATTGTCTATCCAGCATTTATCATGCTTTTCCTTTCATTTGTGTGCTTAATTTCAAGc > 2:1242595/1‑234 (MQ=255) tATGCTTTTAATTGGCGTTACCTATGCGTCAATCCTAACTTATTTACAAGCATTTGCTTTAGAGCGACACCTAGTCACTGCAGCAAGCTATTTCTTTATTTGCTATGCTATAGCATCGTTAATTACTAGACCTATTGCTGGTAGATTGATGGATGATAAAAATGAAAATATTATTGTCTATCCAGCATTTATCATGCTTTTCCTTTCATTTGTGTGCTTAATTTCAAGCTATCa < 1:1249685/234‑1 (MQ=255) tATGCGTTTAATTGGCGTTACCTATGCGTCAATCCTAGCTTATTTACAAGCATTTGCTTTAGAGCGACACCTAGTCACTGCAGCAAGCTATTTCTTTATTTGCTATGCTATAGCATCGTTAATTACTAGACCTATTGCTGGTAGATTGATGGATGATAAAAATGAAAATATTATTGTCTATCCAGCATTTATCATGCTTTTCCTTTCATTTGTGTGCTTAATTTCAAGCTATCa < 2:1202628/234‑1 (MQ=255) 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NC_002745/2325072‑2325533 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |