New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002745 | = 1691151 | NA (NA) | 19 (0.070) | 10/464 | 8.9 | NA | pseudogene (535/540 nt) | radC | DNA repair protein RadC |
? | NC_002745 | 2671111 = | NA (NA) | intergenic (‑4/+228) | SA_RS13640/SA_RS13645 | serine protease/class I SAM‑dependent methyltransferase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
TACTGGTTCTATTAGCTGGTATTCTTTATCTAGTAATAAATACAATGGATACGGCTTATTCTCCACTTCTATCCTTTGAACCTTCACATGTTCCCACCTCTTTAAATACTTTAACTACTACAAATTATAAACCTTGTTAATTTTTATTTAAAGTAAAATATCCCTTTAATATCTCCTCTTAAACTACTTTAACTACTATTATTTATTATACTATGGTTAATACATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002745/1690926‑1691151 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTATCAAGAGTAAATTACAAAAGAATCATTTAAATCAATACTTTCACTTTGAATACATGTATTTGAAGTGGAAGGTACTTATTTCAAAAATAGTAAAACCTGTATCTTAAATTACTTAATAGTAACATAAGATACAGGCTGATTTTTTATTCATTGTTATTTATACTAAAGCACCCGATAGCTCTGAAAACAATCACAAATTCAACTTTTCAAAGCCACAGCTTTAAGTTATT > NC_002745/2671111‑2671343 TACTGGTTCTATTAGCTGGTATTCTTTATCTAGTAATAAATACAATGGATACGGCTTATTCTCCACTTCTATCCTTTGAACCTTCACATGTTCCCACCTCTTTAAATACTTTAACTACTACAAATTATAAACCTTGTTAATTTTTATTTAAAGTAAAATATCCCTTTAATATCTCCTCTTAAACTACTTTAACTACTATTATTTATTATACTATGGTTAATACATCTTATCAAG < 1:385939/234‑1 CTATTAGCTGGTATTCTTTATCTAGTAATAAATACAATGGATACGGCTTATTCTCCACTTCTATCCTTTGAACCTTCACATGTTCCCACCTCTTTAAATACTTTAACTACTACAAATTATAAACCTTGTTAATTTTTATTTAAAGTAAAATATCCCTTTAATATCTCCTCTTAAACTACTTTAACTACTATTATTTATTATACTATGGTTAATACATCTTATCAAGAGTAAATT > 1:247824/1‑234 TTCTCCACTTCTATCCTTTGAACCTTCACATGTTCCCACCTCTTTAAATACTTTAACTACTACAAATTATAAACCTTGTTAATTTTTATTTAAAGTAAAATATCCCTTTAATATCTCCTCTTAAACTACTTTAACTACTATTATTTATTATACTATGGTTAATACATCTTATCAAGAGTAAATTACAAAAGAATCATTTAAATCAATACTTTCACTTTGAATACATGTATTTGA < 2:247824/234‑1 ACCTTCACATGTTCCCACCTCTTTAAATACTTTAACTACTACAAATTATAAACCTTGTTAATTTTTATTTAAAGTAAAATATCCCTTTAATATCTCCTCTTAAACTACTTTAACTACTATTATTTATTATACTATGGTTAATACATCTTATCAAGAGTAAATTACAAAAGAATCATTTAAATCAATACTTTCACTTTGAATACATGTATTTGAAGTGGAAGGTACTTATTTCAA > 2:1530840/1‑234 TTTAAATACTTTAACTACTACAAATTATAAACCTTGTTAATTTTTATTTAAAGTAAAATATCCCTTTAATATCTCCTCTTAAACTACTTTAACTACTATTATTTATTATACTATGGTTAATACATCTTATCAAGAGTAAATTACAAAAGAATCATTTAAATCAATACTTTCACTTTGAATACATGTATTTGAAGTGGAAGGTACTTATTTCAAAAATAGTAAAACCTGTATCTT > 2:595390/1‑234 AAATACTTTAACTACTACAAATTATAAACCTTGTTAATTTTTATTTAAAGTAAAATATCCCTTTAATATCTCCTCTTAAACTACTTTAACTACTATTATTTATTATACTATGGTTAATACATCTTATCAAGAGTAAATTACAAAAGAATCATTTAAATCAATACTTTCACTTTGAATACATGTATTTGAAGTGGAAGGTACTTATTTCAAAAATAGTAAAACCTGTATCTTAAA > 2:1651596/1‑234 ACTACTACAAATTATAAACCTTGTTAATTTTTATTTAAAGTAAAATATCCCTTTAATATCTCCTCTTAAACTACTTTAACTACTATTATTTATTATACTATGGTTAATACATCTTATCAAGAGTAAATTACAAAAGAATCATTTAAATCAATACTTTCACTTTGAATACATGTATTTGAAGTGGAAGGTACTTATTTCAAAAATAGTAAAACCTGTATCTTAAATT > 1:820895/1‑226 ACTACTACAAATTATAAACCTTGTTAATTTTTATTTAAAGTAAAATATCCCTTTAATATCTCCTCTTAAACTACTTTAACTACTATTATTTATTATACTATGGTTAATACATCTTATCAAGAGTAAATTACAAAAGAATCATTTAAATCAATACTTTCACTTTGAATACATGTATTTGAAGTGGAAGGTACTTATTTCAAAAATAGTAAAACCTGTATCTTAAATT < 2:820895/226‑1 TTTTTATTTAAAGTAAAATATCCCTTTAATATCTCCTCTTAAACTACTTTAACTACTATTATTTATTATACTATGGTTAATACATCTTATCAAGAGTAAATTACAAAAGAATCATTTAAATCAATACTTTCACTTTGAATACATGTATTTGAAGTGGAAGGTACTTATTTCAAAAATAGTAAAACCTGTATCTTAAATTACTTAATAGTAACATAAGATACAGGCTGATTTTTT < 1:595390/234‑1 TATTTAAAGTAAAATATCCCTTTAATATCTCCTCTTAAACTACTTTAACTACTATTATTTATTATACTATGGTTAATACATCTTATCAAGAGTAAATTACAAAAGAATCATTTAAATCAATACTTTCACTTTGAATACATGTATTTGAAGTGGAAGGTACTTATTTCAAAAATAGTAAAACCTGTATCTTAAATTACTTAATAGTAACATAAGATACAGGCTGATTTTTTATTC < 1:1530840/234‑1 AATACATCTTATCAAGAGTAAATTACAAAAGAATCATTTAAATCAATACTTTCACTTTGAATACATGTATTTGAAGTGGAAGGTACTTATTTCAAAAATAGTAAAACCTGTATCTTAAATTACTTAATAGTAACATAAGATACAGGCTGATTTTTTATTCATTGTTATTTATACTAAAGCACCCGATAGCTCTGAAAACAATCACAAATTCAACTTTTCAAAGCCACAGCTTTA > 2:1438801/1‑234 TACATCTTATCAAGAGTAAATTACAAAAGAATCATTTAAATCAATACTTTCACTTTGAATACATGTATTTGAAGTGGAAGGTACTTATTTCAAAAATAGTAAAACCTGTATCTTAAATTACTTAATAGTAACATAAGATACAGGCTGATTTTTTATTCATTGTTATTTATACTAAAGCACCCGATAGCTCTGAAAACAATCACAAATTCAACTTTTCAAAGCCACAGCTTTAAG > 2:1171814/1‑234 ACATCTTATCAAGAGTAAATTACAAAAGAATCATTTAAATCAATACTTTCACTTTGAATACATGTATTTGAAGTGGAAGGTACTTATTTCAAAAATAGTAAAACCTGTATCTTAAATTACTTAATAGTAACATAAGATACAGGCTGA‑TTTTTATTCATTGTTATTTATACTAAAGCACCCGATAGCTCTGAAAACAATCACAAATTCAACTTTTCAAAGCCACAGCTTTAAGTT < 1:1607350/234‑1 CATCTTATCAAGAGTAAATTACAAAAGAATCATTTAAATCAATACTTTCACTTTGAATACATGTATTTGAAGTGGAAGGTACTTATTTCAAAAATAGTAAAACCTGTATCTTAAATTACTTAATAGTAACATAAGATACAGGCTGATTTTTTATTCATTGTTATTTATACTAAAGCACCCGATAGCTCTGAAAACAATCACAAATTCAACTTTTCAAAGCCACAGCTTTAAGTT < 1:1636234/234‑1 CATCTTATCAAGAGTAAATTACAAAAGAATCATTTAAATCAATACTTTCACTTTGAATACATGTATTTGAAGTGGAAGGTACTTATTTCAAAAATAGTAAAACCTGTATCTTAAATTACTTAATAGTAACATAAGATACAGGCTGATTTTTTATTCATTGTTATTTATACTAAAGCACCCGATAGCTCTGAAAACAATCACAAATTCAACTTTTCAAAGCCACAGCTTTAAGTT < 1:1556083/234‑1 CATCTTATCAAGAGTAAATTACAAAAGAATCATTTAAATCAATACTTTCACTTTGAATACATGTATTTGAAGTGGAAGGTACTTATTTCAAAAATAGTAAAACCTGTAGCTTAAATTACTTAATAGTAACATAAGATACAGGCTGATTTTTTATTCATTGTTATTTATACTAAAGCACCCGATAGCTCTGAAAACAATCACAAATTCAACTTTTCAAAGCCACAGCTTTAAGTT < 1:332399/234‑1 ATCTTATCAAGAGTAAATTACAAAAGAATCATTTAAATCAATACTTTCACTTTGAATACATGTATTTGAAGTGGAAGGTACTTATTTCAAAAATAGTAAACCCTGTATCTTAAATTACTTAATAGTAACATAAGATACAGGCTGATTTTTTATTCATTGTTATTTATACTAAAGCACCCGATAGCTCTGAAAACAATCACAAATTCAACTTTTCAAAGCCACAGCTTTAAGTTA > 2:419070/1‑234 ATCTTATCAAGAGTAAATTACAAAAGAATCATTTAAATCAATACTTTCACTTTGAATACATGTATTTGAAGTGGAAGGTACTTATTTCAAAAATAGTAAAACCTGTATCTTAAATTACTTAATAGTAACATAAGATACAGGCTGATTTTTTATTCATTGTTATTTATACTAAAGCACCCGATAGCTCTGAAAACAATCACAAATTCAACTTTTCAAAGCCACAGCTTTAAGTTA > 2:1673146/1‑234 CTTATCAAGAGTAAATTACAAAAGAATCATTTAAATCAATACTTTCACTTTGAATACATGTATTTGAAGTGGAAGGTACTTATTTCAAAAATAGTAAAACCTGTATCTTAAATTACTTAATAGTAACATAAGATACAGGCTGATTTTTTATTCATTGTTATTTATACTAAAGCACCCGATAGCTCTGAAAACAATCACAAATTCAACTTTTCAAAGCCACAGCTCTAAGTTATT > 1:145029/1‑234 TACTGGTTCTATTAGCTGGTATTCTTTATCTAGTAATAAATACAATGGATACGGCTTATTCTCCACTTCTATCCTTTGAACCTTCACATGTTCCCACCTCTTTAAATACTTTAACTACTACAAATTATAAACCTTGTTAATTTTTATTTAAAGTAAAATATCCCTTTAATATCTCCTCTTAAACTACTTTAACTACTATTATTTATTATACTATGGTTAATACATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002745/1690926‑1691151 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTATCAAGAGTAAATTACAAAAGAATCATTTAAATCAATACTTTCACTTTGAATACATGTATTTGAAGTGGAAGGTACTTATTTCAAAAATAGTAAAACCTGTATCTTAAATTACTTAATAGTAACATAAGATACAGGCTGATTTTTTATTCATTGTTATTTATACTAAAGCACCCGATAGCTCTGAAAACAATCACAAATTCAACTTTTCAAAGCCACAGCTTTAAGTTATT > NC_002745/2671111‑2671343 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |