New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002745 | 2671111 = | NA (NA) | intergenic (‑4/+228) | SA_RS13640/SA_RS13645 | serine protease/class I SAM‑dependent methyltransferase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
TCATTACTGGTTCTATTAGCTGGTATTCTTTATCTAGTAATAAATACAATGGATACGGCTTATTCTCCACTTCTATCCTTTGAACCTTCACATGTTCCCACCTCTTTAAATACTTTAACTACTACAAATTATAAACCTTGTTAATTTTTATTTAAAGTAAAATATCCCTTTAATATCTCCTCTTAAACTACTTTAACTACTATTATTTATTATACTATGGTTAATACATCACCGGATGGATGATTATGAACTGCGATGATTGCATTGGCATTTTCTCTCACCGCAATACTAAAAATTTCACGTGGATGTACAATCGAACTATTTAATGTACCTTTAAAAACACAGGTTTCTTTAATCACTACATTTTTTGAATTTAACAATAAAATGACAAAATGTTCTTGTGTTAAATCTTTCATTGTTGGAATCATATAATCAGCAACATCACTTGGTTGCGTTATTTTT > NC_002745/1690922‑1691383 | tCATTACTGGTTCTATTAGCTGGTATTCTTTATCTAGTAATAAATACAATGGATACGGCTTATTCTCCACTTCTATCCTTTGAACCTTCACATGTTCCCACCTCTTTAAATACTTTAACTACTACAAATTATAAACCTTGTTAATTTTTATTTAAAGTAAAATATCCCTTTAATATCTCCTCTTAAACTACTTTAACTACTATTATTTATTATACTATGGTTAATACATCACCg > 1:479003/1‑234 (MQ=31) ttACTGGTTCTATTAGCTGGTATTCTTTATCTAGTAATAAATACAATGGATACGGCTTATTCTCCACTTCTATCCTTTGAACCTTCACATGTTCCCACCTCTTTAAATACTTTAACTACTACAAATTATAAACCTTGTTAATTTTTATTTAAAGTAAAATATCCCTTTAATATCTCCTCTTAAACTACTTTAACTACTATTATTTATTATACTATGGTTAATACATCACCggat < 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |