| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 361152 | 5814 (18.630) | 6 (0.020) +CCAT |
6/270 | NT | 0.11% | coding (592/1083 nt) | lacI | DNA‑binding transcriptional repressor |
| ? | CP009273 | 361153 = | 5814 (18.630) | coding (591/1083 nt) | lacI | DNA‑binding transcriptional repressor | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 15926 total aligned reads displayed.
GTTGGCAACCAGCATCGCAGTGGGAACGATGCCCTCATTCAGCATTTGCATGGTTTGTTGAAAACCGGACATGGCACTCCAGTCGCCTTCCCGTTCCGCTATCGGCTGAATTTGATTGCGAGTGAGATAT‑TT‑‑‑ATGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCTGGTGACCCAATGCGACCAGATGCTCCACGCCCAGTCGCGTACCGTCTTCATGGGAGAAAATAATACTGTTGATGGGTGTCTGGTCAGAGACATCAA > CP009273/361006‑361301 | tGGCAACCAGCATCGCAGTGGGAACGATGCCCTCATTCAGCATTTGCATGGTTTGTTGAAAACCGGACATGGCACTCCAGTCGCCTTCCCGTTCCGCTATCGGCTGAATTTGATTGCGAGTGAGATAT‑TT‑‑‑ATGCCAGCCAGCcagacgca > 1:54603/1‑150 (MQ=255) caaccagcatcgcagtgggaacgatgccctcattcagcatttgcatggtttgttgaaaaccggacatggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCcagacgc > 2:101430‑M2/134‑150 (MQ=255) cAACCAGCATCGCAGTGGGAACGATGCCCTCATTCAGCATTTGCATGGTTTGTTGAAAACCGGACATGGCACTCCAGTCGCCTTCCCGTTCCGCTATCGGCTGAATTTGATTGCGAGTGAGATAT‑TT‑‑‑ATGCCAGCCAGCcagacgcagac > 2:2937005/1‑150 (MQ=255) aaccagcatcgcagtgggaacgatgccctcattcagcatttgcatggtttgttgaaaaccggacatggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCcagacgca > 1:3848757‑M2/133‑150 (MQ=255) ccagcatcgcagtgggaacgatgccctcattcagcatttgcatggtttgttgaaaaccggacatggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCcagacgcaga > 2:1095346‑M2/131‑150 (MQ=255) gCATCGCAGTGGGAACGATGCCCTCATTCAGCATTTGCATGGTTTGTTGAAAACCGGACATGGCACTCCAGTCGCCTTCCCGTTCCGCTATCGGCTGAATTTGATTGCGAGTGAGATAT‑TT‑‑‑ATGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCg < 1:3939504/150‑1 (MQ=255) tcgcagtgggaaagttgccctcattcagcatgtgcttggtttgttgaaaaccggacatgtcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgtatttgattgcgagtgagatatttatgcaaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGcc < 1:1191488‑M2/26‑1 (MQ=255) agtgggaacgatgccctcattcagcatttgcatggtttgttgaaaaccggacatggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCgaga > 1:818336‑M2/121‑150 (MQ=255) gtgggaacgatgccctcattcagcatttgcatggtttgttgaaaaccggacatggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGAc > 1:4940736‑M2/120‑150 (MQ=255) gggaacgatgccctcattcagcatttgcatggtttgttgaaaaccggacatggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAg < 2:3688612‑M2/33‑1 (MQ=255) aCGATGCCCTCATTCAGCATTTGCATGGTTTGTTGAAAACCGGACATGGCACTCCAGTCGCCTTCCCGTTCCGCTATCGGCTGAATTTGATTGCGAGTGAGATAT‑TT‑‑‑ATGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAAt < 1:2863832/150‑1 (MQ=255) gATGCCCTCATTCAGCATTTGCATGGTTTGTTGAAAACCGGACATGGCACTCCAGTCGCCTTCCCGTTCCGCTATCGGCTGAATTTGATTGCGAGTGAGATAT‑TT‑‑‑ATGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATgg < 1:4467901/150‑1 (MQ=255) gATGCCCTCATTCAGCATTTGCATGGTTTGTTGAAAACCGGACATGGCACTCCAGTCGCCTTCCCGTTCCGCTATCGGCTGAATTTGATTGCGAGTGAGATAT‑TT‑‑‑ATGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATgg > 2:2367876/1‑150 (MQ=255) atgccctcattcagcatttgcatggtttgttgaaaaacggacattgcactccagtcgccttcccgttccgctatcgtctgaattttattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCATACGCGCCGAGACAGAACTTaa > 2:3897846‑M2/111‑150 (MQ=255) ccctcattcagcatttgcatggtttgttgaaaaccggacatggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATgg < 2:1183562‑M2/43‑1 (MQ=255) aTTCAGCATTTGCATGGTTTGTTGAAAACCGGACATGGCACTCCAGTCGCCTTCCCGTTCCGCTATCGGCTGAATTTGATTGCGAGTGAGATAT‑TT‑‑‑ATGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTaa > 1:2183836/1‑150 (MQ=255) ttcagcatttgcatggtttgttgaaaaccggacatggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGc > 2:1978547‑M2/102‑150 (MQ=255) ttCAGCATTTGCATGGTTTGTTGAAAACCGGACATGGCACTCCAGTCGCCTTCCCGTTCCGCTATCGGCTGAATTTGATTGCGAGTGAGATAT‑TT‑‑‑ATGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAAc > 2:4818046/1‑150 (MQ=255) agcatttgcatggtttgttgaaaaccggacatggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTaa > 2:5134185‑M2/99‑150 (MQ=255) aGCATTTGCATGGTTTGTTGAAAACCGGACATGGCACTCCAGTCGCATACCAGATACGCTATCGGCGGAATATGATTGCGAGTGAGATCTGTTGGCCGGCCAGCCCGCCAGACGCCGCCGGGCCGTGACTGAACTTCATGGGCCCGCtcg > 1:1292227/1‑148 (MQ=255) atttgcatggtttgttgaaaaccggacatggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAg > 1:4672315‑M2/96‑150 (MQ=255) gCATGGTTTGTTGAAAACCGGACATGGCACTCCAGTCGCCTTCCCGTTCCGCTATCGGCTGAATTTGATTGCGAGTGAGATAT‑TT‑‑‑ATGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGAttt > 2:1880801/1‑150 (MQ=255) catggtttgttgaaaaccggacatggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGa > 1:2570769‑M2/91‑150 (MQ=255) tGGTTTGTTGAAAACCGGACATGGCACTCCAGTCGCCTTCCCGTTCCGCTATCGGCTGAATTTGATTGCGAGTGAGATAT‑TT‑‑‑ATGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCt > 1:3534603/1‑150 (MQ=255) ggtttgttgaaaaccggacatggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGAttt > 2:80868‑M2/88‑150 (MQ=255) gtttgttgaaaaccggacatggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTg > 2:2749876‑M2/87‑150 (MQ=255) tttGTTGAAAACCGGACATGGCACTCCAGTCGCCTTCCCGTTCCGCTATCGGCTGAATTTGATTGCGAGTGAGATAT‑TT‑‑‑ATGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCTGGt > 1:1093266/1‑150 (MQ=255) ttgttgaaaaccggacatggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCt > 1:2383213‑M2/85‑150 (MQ=255) ttgttgaaaaccggacatggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCt < 1:198132‑M2/66‑1 (MQ=255) ttgttgAAAACCGGACATGGCACTCCAGTCGCCTTCCCGTTCCGCTATCGGCTGAATTTGATTGCGAGTGAGATAT‑TT‑‑‑ATGCCAGCCAGCCAGACGCAGGCGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCTGGTg > 2:1269004/1‑150 (MQ=255) gttgaaaaccggacatggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCTgg < 2:5319084‑M2/68‑1 (MQ=255) gttgaaaaccggacatggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCTgg > 1:5363427‑M2/83‑150 (MQ=255) aaaccggacatggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCTGGTGAcc < 1:1486260‑M2/73‑1 (MQ=255) aaaCCGGACATGGCACTCCAGTCGCCTTCCCGTTCCGCTATCGGCTGAATTTGATTGCGAGTGAGATAT‑TT‑‑‑ATGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCTGGTGACCCAAt > 1:4851659/1‑150 (MQ=255) aaccggacatggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCTGGTGAccc > 2:3114953‑M2/77‑150 (MQ=255) cggacatggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCTGGTGACCCAAt > 1:2953549‑M2/74‑150 (MQ=255) ggacatggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCTGGTGACCCAATg > 1:2666952‑M2/73‑150 (MQ=255) gacatggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCTGGTGACCCAATGc < 2:2076798‑M2/79‑1 (MQ=255) atggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCTGGTGACCCAATGCGAc < 2:4919580‑M2/82‑1 (MQ=255) ggcactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCTGGTGACCCAATGCGACCa < 2:3800615‑M2/84‑1 (MQ=255) cactccagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCTGGTGACCCAATGCGACCAGa < 2:1578292‑M2/86‑1 (MQ=255) ccAGTCGCCTTCCCGTTCCGCTATCGGCTGAATTTGATTGCGAGTGAGATAT‑TT‑‑‑ATGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCTGGTGACCCAATGCGACCAGATGCTCCAc > 1:714199/1‑150 (MQ=255) cagtcgccttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCTGGTGACCCAATGCGACCAGATGCTc < 1:2280244‑M2/91‑1 (MQ=255) cAGTCGCCTTCCCGTTCCGCTATCGGCTGAATTTGATTGCGAGTGAGATAT‑TT‑‑‑ATGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCTGGTGACCCAATGCGACCAGATGCTCCACg < 2:246695/150‑1 (MQ=255) ttcccgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCTGGTGACCCAATGCGACCAGATGCTCCACGCCCa < 1:4366360‑M2/99‑1 (MQ=255) cgttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCTGGTGACCCAATGCGACCAGATGCTCCACGCCCAGTcg < 1:4262689‑M2/103‑1 (MQ=255) ttccgctatcggctgaatttgattgcgagtgagatatttatgccaGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCTGGTGACCCAATGCGACCAGATGCTCCACGCCCAGTcgcg > 2:4397754‑M2/46‑150 (MQ=255) tCCGCTATCGGCTGAATTTGATTGCGAGTGAGATAT‑TT‑‑‑ATGCCAGCCAGCCAGACGCAGACGCGCCGAGACAGAACTTAATGGGCCCGCTAACAGCGCGATTTGCTGGTGACCCAATGCGACCAGATGCTCCACGCCCAGTCGCGTACCg < 2:719769/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |