| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP043523 | = 234705 | 451 (0.860) | 181 (0.360) | 57/290 | 24.3 | 29.2% | intergenic (+79/+40) | FTN78_chr0290/FTN78_chr0291 | Transcription elongation factor GreA/Mobile element protein |
| ? | CP043523 | 235954 = | NA (NA) | intergenic (‑62/+12) | FTN78_chr0292/FTN78_chr0293 | Transposase/Putative transposase InsK for insertion sequence element IS150 | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 328 total aligned reads displayed.
AAAAGTTGGAGACATCGTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP043523/234554‑234705‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaatACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAATAACCTGTTCAAGTTCTTCGAAAGACGAGAAGATATGTC > CP043523/235954‑236102 AAGTTGGAGACATCGTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAAT < 1:2853086/150‑1 AAGTTGGAGACATCGTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAAT > 1:3456942/1‑150 cgttaacTGATGTGTACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATC > 1:120830/8‑150 cgttaacTGATGTGTACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATC < 2:337449/143‑1 gttaacTGATGTGTACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCC > 1:3100970/7‑150 gttaacTGATGTGTACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCC > 1:444874/7‑150 ttaacTGATGTGTACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGGAATACTTGGACTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCA < 2:4417832/145‑1 taacTGATGTGTACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAG < 2:4015322/146‑1 taacTGATGTGTACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAG < 1:1848030/146‑1 acTGATGTGTACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGAT < 1:912809/148‑1 GTGTACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAAT > 2:158919/1‑150 tgtACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAATg < 1:3396224/147‑2 gtACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAATAA < 2:3939027/148‑1 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1:1241590/150‑1 GTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAATAACCTGTTCAAGT < 1:245490/150‑1 GTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGATTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAGTAACCTGTTCAAGT > 1:3865332/1‑150 TTAGGCTTTTTATCCAAGTAGAAATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAATAACCTGTTCAAGTT < 1:3507210/150‑1 TTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAATAACCTGTTCAAGTT < 2:436557/150‑1 TTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAATAACCTGTTCAAGTT < 1:3775186/150‑1 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1:811562/1‑150 ACTTTTTATCCAAGTAGAAATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAATAACCTGTTCAAGTTCTTC < 2:779102/150‑1 CTTTTTATCCAAGTAGAAATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAATAACCTGTTCAAGTTCTTCG < 2:127754/150‑1 CTTTTTATCCAAGTAGAAATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAATAACCTGTTCAAGTTCTTCG < 2:656400/150‑1 TTTTTATCCAAGTAGAAATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAATAACCTGTTCAAGTTCTTCGA < 1:2014141/150‑1 TTTTATCCAAGTAGAAATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAATAACCTGTTCAAGTTCTTCGAA > 1:2198240/1‑150 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2:3771348/1‑148 ATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAATAACCTGTTCAAGTTCTTCGAAAGACGAGAAGATATGT > 1:4289495/1‑150 ATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAATAACCTGTTCAAGTTCTTCGAAAGACGAGAAGATATGT < 2:467645/150‑1 ATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAATAACCTGTTCAAGTTCTTCGAAAGACGAGAAGATATGT < 2:2640158/150‑1 ATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAATAACCTGTTCAAGTTCTTCGAAAGACGAGAAGATATGT > 2:2722332/1‑150 ATACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAATAACCTGTTCAAGTTCTTCGAAAGACGAGAAGATATGT < 2:3438001/150‑1 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2:3061696/1‑150 TACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAATAACCTGTTCAAGTTCTTCGAAAGACGAGAAGATATGTC > 1:2110752/1‑150 TACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAATAACCTGTTCAAGTTCTTCGAAAGACGAGAAGATATGTC < 1:3965142/150‑1 TACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAATAACCTGTTCAAGTTCTTCGAAAGACGAGAAGATATGTC < 2:3164355/150‑1 TACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAATAACCTGTTCAAGTTCTTCGAAAGACGAGAAGATATGTC < 1:1655941/150‑1 AAAAGTTGGAGACATCGTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP043523/234554‑234705‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaatACTTGGATTTTTTTAATTGTTTTGGTAATTCAAGCGAAATTGAATTGGACTCATCCAGTTCAATTTTTGTTTGATTCGTTTTGTATTATAGTACCTAATCCAGATTACAATAACCTGTTCAAGTTCTTCGAAAGACGAGAAGATATGTC > CP043523/235954‑236102 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |