| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP043523 | = 234705 | 451 (0.860) | 181 (0.360) | 57/290 | 24.3 | 29.2% | intergenic (+79/+40) | FTN78_chr0290/FTN78_chr0291 | Transcription elongation factor GreA/Mobile element protein |
| ? | CP043523 | 235954 = | NA (NA) | intergenic (‑62/+12) | FTN78_chr0292/FTN78_chr0293 | Transposase/Putative transposase InsK for insertion sequence element IS150 | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 454 total aligned reads displayed.
AAGTTGGAGACATCGTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATGTATTTAAATATTTCTTGAGTAGC > CP043523/234556‑234852 | gTTGGAGACATCGTAAATGTACCACTTGCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATgg > 2:755164/1‑150 (MQ=255) gagaCATCGTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAg > 1:3077235/1‑150 (MQ=255) gaCATCGTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTc < 1:819426/150‑1 (MQ=255) gaCATCGTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTc < 1:913516/150‑1 (MQ=255) gaCATCGTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTc > 1:1598365/1‑150 (MQ=255) cATCGTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCaa > 1:1764764/1‑150 (MQ=255) cGTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGa > 1:991673/1‑150 (MQ=255) gTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGaa < 1:1677270/150‑1 (MQ=255) tGTACCACATCCAGTTGGCGACATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACt < 1:3837479/150‑1 (MQ=255) gTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTa > 1:4094989/1‑150 (MQ=255) tACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAg < 1:341798/150‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGac < 1:2039202/150‑1 (MQ=255) aCTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGacac < 1:4604850/150‑1 (MQ=255) aCTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGacac < 1:1354776/150‑1 (MQ=255) cTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACg < 2:3139339/150‑1 (MQ=255) cTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACg < 2:1777735/150‑1 (MQ=255) ttCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACgg > 1:2120020/1‑150 (MQ=255) ccAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAg < 2:2649930/150‑1 (MQ=255) ttGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTaa > 2:1441674/1‑150 (MQ=255) gCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAagag > 2:397322/1‑150 (MQ=255) gAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGaa < 2:4215163/150‑1 (MQ=255) anTGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAAtt > 1:2998950/1‑150 (MQ=255) gACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTaa > 1:3020512/1‑150 (MQ=255) aCAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAg < 1:1182820/150‑1 (MQ=255) cAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGa > 1:1302319/1‑150 (MQ=255) aGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGaa > 1:2425936/1‑150 (MQ=255) aGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGaa > 2:226325/1‑150 (MQ=255) aGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATATTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGaa < 2:3584524/150‑1 (MQ=255) gTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGAGGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAAt > 2:4162187/1‑150 (MQ=255) ttAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAAtt > 1:4265326/1‑150 (MQ=255) aaaaTTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAGTATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATtat < 1:4140729/150‑1 (MQ=255) ttGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATAttt > 2:94517/1‑150 (MQ=255) ttGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATAttt < 1:148156/150‑1 (MQ=255) gTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATAttttt > 1:2234403/1‑150 (MQ=255) gTAAAAATTGAGTAATTCATTTAGAATATAACAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATATGCACACAAAAAGTTAGACTTTTGATCCAAGTAGAAATGGAAAAAAAAAAAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATAttttt < 2:749664/150‑1 (MQ=18) tAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTc < 2:3370920/150‑1 (MQ=255) tAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTc > 2:33069/1‑150 (MQ=255) tAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTc > 2:3211432/1‑150 (MQ=255) tAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTc > 1:2929377/1‑150 (MQ=255) tAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTc < 1:233594/150‑1 (MQ=255) aaaGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCaa > 1:338520/1‑150 (MQ=255) aaGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCaaa < 1:649963/150‑1 (MQ=255) aGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAg < 2:3491402/150‑1 (MQ=255) gTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGt < 2:1722430/150‑1 (MQ=255) ttGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTc > 2:2750931/1‑150 (MQ=255) tGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCt < 2:39294/150‑1 (MQ=255) tGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCt < 2:216659/150‑1 (MQ=255) tGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCt > 1:2309036/1‑150 (MQ=255) 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aaaTGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATGTATTTAAATATTTCTTGAGTan < 2:2998950/150‑2 (MQ=14) aaaTGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATGTATTTAAATATTTCTTGAGTAg < 2:3658946/150‑1 (MQ=31) | AAGTTGGAGACATCGTAAATGTACCACTTCCAGTTGGCGAAATGACAGTTAAAATTGTAAAAGTTGACTAATTATTTTAGAATATAATAAGTAAAAAAGCCGTCAGTTGATGTGCACCCCAAAAGTTAGACTTTTTATCCAAGTAGAAATGGAAAGTCAACGAAAAACTAGACACGGAGTTAAGAGAATTTAAGAATTATATTTTTCAAAGTCTTTTGGAGACTTGTAATCAAGACCTGAATGCATCCTTTTTGTATTGTAATAGGTCTCAATGTATTTAAATATTTCTTGAGTAGC > CP043523/234556‑234852 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |