| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP043523 | 838360 = | 497 (0.950) | 267 (0.540) +CACCGAG |
110/284 | 10.5 | 36.1% | intergenic (‑66/+92) | FTN78_chr0888/FTN78_chr0889 | hypothetical protein/General stress protein, Gls24 family |
| ? | CP043523 | 847992 = | NA (NA) | coding (239/255 nt) | FTN78_chr0898 | Mobile element protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 294 total aligned reads displayed.
GATAAAGTAAAAGACAAAGTAGAAGACAGTACAGATAAAGAAGCTAGAGTTAAATAAATTTCTAGATAAATCCTGATGAACAAAGGCCTCTATTGTGAGGCTTTTTTAGTAAGTTACTTCAATTGTATAGTTTTTTATTTAGATAGAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP043523/838508‑838360‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAAATGTCCATG > CP043523/847992‑848140 ||||||| TAAAGTAAAAGACAAAGTAGAAGACAATACAGATAAAGAAGCTAGAGTTAAATAAATTTCTAGATAAATCGTGAGAAATAAATGCCTCTATTATGAGGC‑TTTTTAGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACC < 2:3819618/150‑1 AAAGTAAAAGACAAAGTAGAAGACAATACAGATAAAGAAGCTAGAGTTAAATAAATTTCTAGATAAATCGTGAGAAATAAATGCCTCTATTATGAGGC‑TTTTTAGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCG < 1:892324/150‑1 AAGACAAAGTAGAAGACAATACAGATAAAGAAGCTAGAGTTAAATAAATTTCTAGATAAATCGTGAGAAATAAATGCCTCTATTATGAGGC‑TTTTTAGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAA > 1:2326539/1‑150 CAAAGTAGAAGACAATACAGATAAAGAAGCTAGAGTTAAATAAATTTCTAGATAAATCGTGAGAAATAAATGCCTCTATTATGAGGC‑TTTTTAGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGA < 1:4197572/150‑1 GTAGAAGACAATACAGATAAAGAAGCTAGAGTTAAATAAATTTCTAGATAAATCGTGAGAAATAAATGCCTCTATTATGAGGC‑TTTTTAGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAG < 2:1887272/150‑1 TACAGATAAAGAAGCTAGAGTTAAATAAATTTCTAGATAAATCGTGAGAAATAAATGCCTCTATTATGAGGC‑TTTTTAGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATAC > 1:1009273/1‑150 ATAAAGAAGCTAGAGTTAAATAAATTTCTAGATAAATCGTGAGAAATAAATGCCTCTATTATGAGGC‑TTTTTAGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAA < 2:809602/150‑1 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< 2:2056547/150‑1 TCTAGATAAATCGTGAGAAATAAATGCCTCTATTATGAGGC‑TTTTTAGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTAT < 2:3256991/150‑1 TAAATCGTGAGAAATAAATGCCTCTATTATGAGGC‑TTTTTAGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGG < 1:162714/150‑1 gaaatAAATGCCTCTATTATGAGGC‑TTTTTAGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTA < 1:2610034/145‑1 gaaatAAATGCCTCTATTATGAGGC‑TTTTTAGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTA < 1:4444256/145‑1 tAAATGCCTCTATTATGAGGC‑TTTTTAGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAG > 2:2754373/2‑150 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< 2:2708772/150‑1 ttaTGAGGC‑TTTTTAGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGA < 2:2279732/147‑1 ttaTGAGGC‑TTTTTAGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGA < 1:75827/147‑1 ttaTGAGGC‑TTTTTAGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGA > 1:1074193/4‑150 taTGAGGC‑TTTTTAGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGAT > 2:444009/3‑150 TGAGGC‑TTTTTAGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAG < 1:3273546/150‑1 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1:4067155/147‑1 gcTTTTTAGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTT < 1:2959065/148‑1 TTTTTAGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCT < 1:519004/150‑1 TTTTTAGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATCATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCT < 1:3077714/150‑1 TTTTAGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTT < 2:4168103/150‑1 TTTTAGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTT < 1:249694/150‑1 TTAGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCA < 1:2886161/150‑1 AGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATATAATCTCCTAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAA > 2:3686107/1‑150 AGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAA < 1:2010736/150‑1 AGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAA < 1:607596/150‑1 AGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAA > 2:1367221/1‑150 AGTAAGTGAGTTCATTTATATAGTTTTTTATTTAGATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACGTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAA < 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GATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTT < 2:4526760/150‑1 GATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTT < 1:3127517/150‑1 ATAGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTT > 2:3432012/1‑150 AGAAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTT < 2:3494128/150‑1 AAGCACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAA > 1:3512415/1‑150 CACCGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAAATG > 1:1302325/1‑150 CGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAAATGTCC > 2:1175116/1‑150 CGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAAATGTCC < 2:640632/150‑1 CGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAAATGTCC < 2:658137/150‑1 CGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAAATGTCC < 1:43708/150‑1 CGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAAATGTCC > 1:4146071/1‑150 CGAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAAATGTCC < 1:3178983/150‑1 GAGTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAAATGTCCA > 1:2229736/1‑150 GTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAAATGTCCATG < 2:2424132/150‑1 GTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAAATGTCCATG > 2:2172242/1‑150 GTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGGTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAAATGTCCATG < 1:2817760/150‑1 ||||||| GATAAAGTAAAAGACAAAGTAGAAGACAGTACAGATAAAGAAGCTAGAGTTAAATAAATTTCTAGATAAATCCTGATGAACAAAGGCCTCTATTGTGAGGCTTTTTTAGTAAGTTACTTCAATTGTATAGTTTTTTATTTAGATAGAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP043523/838508‑838360‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAAAATACTCTGATAGGCTTCTTCAAAGTTCTTATATTTAAATTGATACACCCACTCTCTTTTTAAATGTCCATG > CP043523/847992‑848140 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |