| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP043523 | 838360 = | 497 (0.950) | 267 (0.540) +CACCGAG |
110/284 | 10.5 | 36.1% | intergenic (‑66/+92) | FTN78_chr0888/FTN78_chr0889 | hypothetical protein/General stress protein, Gls24 family |
| ? | CP043523 | 847992 = | NA (NA) | coding (239/255 nt) | FTN78_chr0898 | Mobile element protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 532 total aligned reads displayed.
AAAAGGCAACTTGAGATTTCCCCAAAACCCGTAAGTAATTGTTGGTATTGTTAAGACAATGGTAAGCTCAGTTAATATTTTCATAATATTATTCGACTGCTTCGATATAGTCTATCATGAAAGATTTCCTTAGACCTATTGACTTGATACTTCTATCTAAATAAAAAACTATACAATTGAAGTAACTTACTAAAAAAGCCTCACAATAGAGGCCTTTGTTCATCAGGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGTACTGTCTTCTACTTTGTCTTTTACTTTATCAA > CP043523/838211‑838510 | aaaaGTCAACTTGAGATTTCCCCAAAACCCGTAAGTAATTGTTGGTATTGTTAAGACAATGTTAAGCTCAGTTAATATTTTCATAATATTATTCCACTGCTTCGATATAGTCTATCATGAAAGATTTCCTTAGACCTATTGACTTGATAc < 2:1261101/150‑1 (MQ=255)aaaaGGCAACTTGAGATTTCCCCAAAACCCGTAAGTAATTGTTGGTATTGTTAAGACAATGGTAAGCTCAGTTAATATTTTCATAATATTATTCGACTGCTTCGATATAGTCTATCATGAAAGATTTCCTTAGACCTATTGACTTGATAc < 2:3212482/150‑1 (MQ=255) aGGCAACTTGAGATTTCCCCAAAACCCGTAAGTAATTGTTGGTATTGTTAAGACAATGGTAAGCTCAGTTAATATTTTCATAATATTATTCGACTGCTTCGATATAGTCTATCATGAAAGATTTCCTTAGACCTATTGACTTGATACTtc < 2:1729004/150‑1 (MQ=255) aCTTGAGATTTCCCCAAAACCCGTAAGTAATTGTTGGTATTGTTAAGACAATGGTAAGCTCAGTTAATATTTTCATAATATTATTCGACTGCTTCGATATAGTCTATCATGAAAGATTTCCTTAGACCTATTGACTTGATACTtctatct < 2:3373708/150‑1 (MQ=255) cTTGAGATTTCCCCAAAACCCGTAAGTAATTGTTGGTATTGTTAAGACAATGGTAAGCTCAGTTAATATTTTCATAATATTATTCGACTGCTTCGATATAGTCTATCATGAAAGATTTCCTTAGACCTATTGACTTGATACTtctatcta < 1:1913755/150‑1 (MQ=255) gaTTTCCCCAAAACCCGTAAGTAATTGTTGGTATTGTTAAGACAATGGTAAGCTCAGTTAATATTTTCATAATATTATTCGACTGCTTCGATATAGTCTATCATGAAAGATTTCCTTAGACCTATTGACTTGATACTTCTATCtaaataa > 2:2386161/1‑150 (MQ=255) gaTTTCCCCAAAACCCGTAAGTAATTGTTGGTATTGTTAAGACAATGGTAAGCTCAGTTAATATTTTCATAATATTATTCGACTGCTTCGATATAGTCTATCATGAAAGATTTCCTTAGACCTATTGACTTGATACTTCTATCtaaataa < 1:284806/150‑1 (MQ=255) gaTTTCCCCAAAACCCGTAAGTAATTGTTGGTATTGTTAAGACAATGGTAAGCTCAGTTAATATTTTCATAATATTATTCGACTGCTTCGATATAGTCTATCATGAAAGATTTCCTTAGACCTATTGACTTGATACTTCTATCtaaataa < 1:276075/150‑1 (MQ=255) tttCCCCAAAACCCGTAAGTAATTGTTGGTATTGTTAAGACAATGGTAAGCTCAGTTAATATTTTCATAATATTATTCGACTGCTTCGATATAGTCTATCATGAAAGATTTCCTTAGACCTATTGACTTGATACTTCTATCTAAATaaaa > 2:3751155/1‑150 (MQ=255) tCCCCAAAACCCGTAAGTAATTGTTGGTATTGTTAAGACAATGGTAAGCTCAGTTAATATTTTCATAATATTATTCGACTGCTTCGATATAGTCTATCATGAAAGATTTCCTTAGACCTATTGACTTGATACTTCTATCTAAATaaaaaa < 1:3123826/150‑1 (MQ=255) tCCCCAAAACCCGTAAGTAATTGTTGGTATTGTTAAGACAATGGTAAGCTCAGTTAATATTTTCATAATATTATTCGACTGCTTCGATATAGTCTATCATGAAAGATTTCCTTAGACCTATTGACTTGATACTTCTATCTAAATaaaaaa < 1:300730/150‑1 (MQ=255) tCCCCAAAACCCGTAAGTAAGTGTTGGTATTGTTAAGACAATGGTAAGCTCAGTTAATATTTTCATAATATTATTCGACTGCTTCGATATAGTCTATCATGAAAGATTTCCTTAGACCTATTGACTTGATACTTCTATCTAAATaaaaaa < 2:174608/150‑1 (MQ=255) aaaCCCGTAAGTAATTGTTGGTATTGTTAAGACAATGGTAAGCTCAGTTAATATTTTCATAATATTATTCGACTGCTTCGATATAGTCTATCATGAAAGATTTCCTTAGACCTATTGACTTGATACTTCTATCTAAATAAAAAACTATAc > 1:527969/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |