New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? CP043523 838360 =497 (0.950)267 (0.540)
+CACCGAG		 110/284 10.5 36.1% intergenic (‑66/+92) FTN78_chr0888/FTN78_chr0889 hypothetical protein/General stress protein, Gls24 family
?CP043523 847992 = NA (NA)coding (239/255 nt) FTN78_chr0898 Mobile element protein
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff.

Only 100 of 245 total aligned reads displayed.

CAATATTCACAGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAA  >  CP043523/847843‑848068
                                                                                                                                                     |                                                                            
cAATATTCACAGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCtttt                                                                              >  2:4009079/1‑150 (MQ=255)
cAATATTCACAGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCtttt                                                                              <  1:151704/150‑1 (MQ=255)
 aaTATTCACCGCTGTTCCTCTTTTTCTATATTACTATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTCAGCACTTCCCTTTTc                                                                             <  2:2188026/150‑1 (MQ=25)
  atatTCACAGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTTTTTTTTTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCTCTTACCTTTTCa                                                                            >  2:846527/1‑150 (MQ=25)
   tatTCACAGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCaa                                                                           <  2:3376932/150‑1 (MQ=255)
    atTCACAGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCaaa                                                                          >  2:74292/1‑150 (MQ=255)
    atTCACAGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTCTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTGATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCaaa                                                                          >  2:4212975/1‑150 (MQ=255)
     ttCACAGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAAt                                                                         >  2:328998/1‑150 (MQ=255)
     ttCACAGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAAt                                                                         >  2:348795/1‑150 (MQ=255)
     ttCACAGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAAt                                                                         >  1:2271696/1‑150 (MQ=255)
      tCACAGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAAtt                                                                        <  2:31291/150‑1 (MQ=255)
        acaGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGa                                                                      <  2:3000104/150‑1 (MQ=255)
         caGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGAt                                                                     >  2:276090/1‑150 (MQ=255)
          aGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGAtt                                                                    >  1:3692048/1‑150 (MQ=255)
          aGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGAtt                                                                    <  1:67323/150‑1 (MQ=255)
           gCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTa                                                                   >  1:4391369/1‑150 (MQ=255)
           gCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTa                                                                   >  2:2656567/1‑150 (MQ=255)
           gCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTa                                                                   <  1:3918095/150‑1 (MQ=255)
            cTGTTCCTCTTGTTCTGAATGATTATGTTTTGGAGGATTTTTCATATTGTCATTCTCTTTTTTCACTTGGCGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACATACGTAGCGTTTTAAGCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAg                                                                  <  2:3607691/150‑1 (MQ=18)
             tGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAgg                                                                 >  2:1602319/1‑150 (MQ=255)
             tGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAgg                                                                 >  1:4305320/1‑150 (MQ=255)
              gTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGgt                                                                <  1:1203168/150‑1 (MQ=255)
              gTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGgt                                                                >  2:1893100/1‑150 (MQ=255)
               ttCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGgtg                                                               <  1:281685/150‑1 (MQ=255)
                 ccTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTa                                                             <  2:1825671/150‑1 (MQ=255)
                 ccTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTa                                                             >  1:3414089/1‑150 (MQ=255)
                  ctctTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTaa                                                            >  1:300706/1‑150 (MQ=255)
                  ctctTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTaa                                                            <  2:2979843/150‑1 (MQ=255)
                   tctTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAg                                                           <  1:2732703/150‑1 (MQ=255)
                   nctTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAg                                                           >  2:3764506/2‑150 (MQ=255)
                    ctTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGa                                                          <  2:2437110/150‑1 (MQ=255)
                     tttttCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGAt                                                         <  2:4428252/150‑1 (MQ=255)
                     tttttCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGAt                                                         <  2:1186110/150‑1 (MQ=255)
                     tttttCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGAt                                                         <  1:2002429/150‑1 (MQ=255)
                       tttCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATAc                                                       >  1:1487812/1‑150 (MQ=255)
                          cTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCt                                                    <  2:1794029/150‑1 (MQ=255)
                          cTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCt                                                    <  1:1608157/150‑1 (MQ=255)
                           tAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTa                                                   >  1:2864029/1‑150 (MQ=255)
                            aaaTTAATATTTTTTTTTTTTTTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTaa                                                  >  2:3030875/1‑150 (MQ=17)
                            aaaTTAATATTTTTTGTAGTTTTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTaa                                                  >  2:3031527/1‑150 (MQ=255)
                             aaTTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTaaa                                                 >  1:1782082/1‑150 (MQ=255)
                              aTTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCACATTCTATCTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTCACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAAc                                                >  2:3996033/1‑150 (MQ=255)
                               ttAATATTTTTTTTTTTTTTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACt                                               >  2:4470468/1‑150 (MQ=17)
                               ttAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACt                                               <  2:1866948/150‑1 (MQ=255)
                               ttAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACt                                               <  1:2074736/150‑1 (MQ=255)
                               ttAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACt                                               >  2:1441583/1‑150 (MQ=255)
                                tAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACtt                                              <  1:1616756/150‑1 (MQ=255)
                                 aaTATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACttt                                             >  2:2501114/1‑150 (MQ=255)
                                 aaTATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACttt                                             >  2:573300/1‑150 (MQ=255)
                                 aaTATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAAGCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACttt                                             <  1:2986573/150‑1 (MQ=255)
                                   tatTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGa                                           <  1:4212855/150‑1 (MQ=255)
                                    atTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGAt                                          >  2:2114531/1‑150 (MQ=255)
                                      tttttGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATgg                                        <  2:2319390/150‑1 (MQ=255)
                                      tttttGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATgg                                        >  1:253643/1‑150 (MQ=255)
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                                        tttGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGAt                                      >  2:409336/1‑150 (MQ=255)
                                         ttGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGAtt                                     >  2:1283880/1‑150 (MQ=255)
                                         ttGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGAtt                                     <  2:3223084/150‑1 (MQ=255)
                                          tGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTc                                    <  2:1393141/150‑1 (MQ=255)
                                          tGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTc                                    <  1:1282075/150‑1 (MQ=255)
                                           gTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCg                                   >  1:3357689/1‑150 (MQ=255)
                                            tAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGt                                  <  1:1139978/150‑1 (MQ=255)
                                            tAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGt                                  <  2:333099/150‑1 (MQ=255)
                                            tAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGt                                  >  2:1686564/1‑150 (MQ=255)
                                             aGGAGTTTTCATATTCTCCTTCCATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGtt                                 <  2:4238885/150‑1 (MQ=255)
                                             aGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGtt                                 <  1:2046694/150‑1 (MQ=255)
                                              ggAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGttt                                <  1:2466989/150‑1 (MQ=255)
                                                aGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGTACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTg                              <  1:1069648/150‑1 (MQ=255)
                                                  ttttCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGaa                            <  1:2274673/150‑1 (MQ=255)
                                                  ttttCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGaa                            >  2:3786118/1‑150 (MQ=255)
                                                   tttCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAAt                           <  2:113149/150‑1 (MQ=255)
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                                                        tatTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATaa                      >  2:1482627/1‑150 (MQ=255)
                                                         atTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATaaa                     <  2:2679514/150‑1 (MQ=255)
                                                         atTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGGGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTCGAATTATaaa                     >  1:4395543/1‑150 (MQ=255)
                                                          ttCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATaaaa                    >  1:1334390/1‑150 (MQ=255)
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                                                            ctcATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGACACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAgg                  >  1:4491561/1‑150 (MQ=255)
                                                             tcATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGc                 >  1:572807/1‑150 (MQ=255)
                                                              cATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCt                >  2:3655211/1‑150 (MQ=255)
                                                              cATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCt                <  1:171104/150‑1 (MQ=255)
                                                               aTTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCtt               <  2:2557718/150‑1 (MQ=255)
                                                                 tCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCg             >  2:2571118/1‑150 (MQ=40)
                                                                  cTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGa            <  1:3764506/150‑1 (MQ=39)
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                                                                  cTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGa            >  2:2022361/1‑150 (MQ=39)
                                                                   tATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGAt           >  2:3634178/1‑150 (MQ=38)
                                                                    aTTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATg          <  1:3570008/150‑1 (MQ=38)
                                                                    aTTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATg          >  1:3197077/1‑150 (MQ=38)
                                                                    aTTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATg          <  2:4563927/150‑1 (MQ=38)
                                                                     ttttATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGt         >  1:201684/1‑150 (MQ=37)
                                                                     ttttATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGt         >  1:179368/1‑150 (MQ=37)
                                                                     ttataacACTTGACGGTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACATAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCAATTAGATTTTCAAATTGATTAGGAGGAATATACCTTAAACTTTGAGAGGATCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCTATGt         >  2:2137178/7‑150 (MQ=11)
                                                                      tttATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTa        <  2:94355/150‑1 (MQ=35)
                                                                        tATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTAcc      >  2:2038218/1‑150 (MQ=34)
                                                                         aTCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCa     <  2:2790962/150‑1 (MQ=33)
                                                                           cACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAGTTGATTAGGTGTAAGATACCCGAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGa   <  1:4239450/150‑1 (MQ=17)
                                                                            aCTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGaa  <  1:3141648/150‑1 (MQ=31)
                                                                            aCTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGaa  >  1:3923660/1‑150 (MQ=31)
                                                                                                                                                     |                                                                            
CAATATTCACAGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGAA  >  CP043523/847843‑848068

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.