| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP043523 | = 1441041 | 542 (1.060) | 464 (0.910) +CTTG |
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| ? | CP043523 | 1441042 = | 563 (1.080) | intergenic (‑30/+75) | FTN78_chr1454/FTN78_chr1455 | Oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide‑binding protein OppA/Oligopeptide transport system permease protein OppC | |||||
Only 100 of 503 total aligned reads displayed.
ATTCCCCGCTTTTAATTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑TTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP043523/1440893‑1441041‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTACTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTCCGATAAAGATAATGGCAAGCACCACA > CP043523/1441042‑1441189 |||| ATTCCCCGCTTTTAATTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑TTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTTC > 1:1874550/1‑150 TTCCCCGCTTTTAATTTTTTTGTACTTGTACTTGAGCTTTGATTAGAACCACAAGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑TTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTC < 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2:4052829/1‑150 TAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTGCTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGTGCATTTCCGATAAAG > 2:1943163/1‑150 TAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTGCTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGGCTTAGTGCATTTGCGATAAAG > 1:3853328/1‑150 ATTTCTTTTTATTTCTTGCTTGCTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTAGTGTTTGTTCAGCCACTCGTCTAAGTGCAGTTGCGATAAAGAT > 1:4375050/1‑150 TTCTTTTTATTTCTTGCTTGCTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGTGCATTTCCGATAAAGATAA < 1:3497506/150‑1 TCTTTTTATTTCTTGCTTGCTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGTGCATTTCCGATAAAGATAAT < 1:1798142/150‑1 TTTTTATTTCTTGCTTGCTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGTGCATTTCCGATAAAGATAATag > 1:50923/1‑148 TTTTATTTCTTGCTTGCTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGTGCATTTCCGATAAAGATAATAGC > 2:3967356/1‑150 TTATTTCTTGCTTGCTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGTGCATTTCCGATAAAGATAATAGCAA > 1:228425/1‑150 tatTTCTTGCTTGCTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGTGCATTTCCGATAAAGATAATAGCAAG > 2:2052618/4‑150 tatTTCTTGCTTGCTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGTGCATTTCCGATAAAGATAATAGCAAG > 2:1334762/4‑150 tatTTCTTGCTTGCTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGTGCATTTCCGATAAAGATAATAGCAAG > 1:603617/4‑150 tTTCTTGCTTGCTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGTGCATTTCCGATAAAGATAATAGCAAGCA > 2:3261821/2‑150 TCTTGCTTGCTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGTGCATTTCCGATAAAGATAATAGCAAGCACC < 1:2215849/150‑1 TCTTGCTTGCTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGTGCATTTCCGATAAAGATAATAGCAAGCACC > 1:1962855/1‑150 TTGCTTGCTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGTGCATTTCCGATAAAGATAATAGCAAGCACCAC < 2:869178/150‑1 TGCTTGCTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGTGCATTTCCGATAAAGATAATAGCAAGCACCACA > 2:1778554/1‑150 |||| ATTCCCCGCTTTTAATTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑TTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP043523/1440893‑1441041‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTACTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTCCGATAAAGATAATGGCAAGCACCACA > CP043523/1441042‑1441189 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |