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AATTCCCCGCTTTTAATTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑TTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTTC‑‑‑‑TTACTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTCCGATAAAGATAATGGCAAGCACCACAA > CP043523/1440892‑1441190 | aTTCCCCGCTTTTAATTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑TTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTTc < 1:1911680‑M1/150‑2 (MQ=255) ttCCCCGCTTTTAATTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑TTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTTct > 1:2974699‑M1/1‑148 (MQ=255) ccGCTTTTAATTTTTTTGTACTTGTACTTGAGCTTTGATTAGAACCACAAGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑TTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTcttgc < 2:268628‑M1/150‑6 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |