| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP043523 | 1867496 = | 0 (0.000) | 497 (0.980) +GTGA |
210/290 | 0.3 | 69.3% | intergenic (‑292/‑29) | FTN78_chr1913/FTN78_chr1914 | hypothetical protein/Site‑specific recombinase, DNA invertase Pin related protein |
| ? | CP043523 | 1958190 = | 452 (0.860) | intergenic (‑52/‑59) | FTN78_chr2011/FTN78_chr2012 | hypothetical protein/Mobile element protein | |||||
Only 100 of 524 total aligned reads displayed.
ACTGTAGTCCCCGTAAATTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTCTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP043523/1867643‑1867496‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACCCAGCTGTCTAAAGAATAC > CP043523/1958190‑1958338 |||| ACTGTAGTTCCAGTAAACTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGT > 1:1808410/1‑150ACTGTAGTTCCAGTAAACTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTCTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGT > 2:4301474/1‑150 CTGTAGTTCCAGTAAACTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTG < 2:3236975/150‑1 CTGTAGTTCCAGTAAACTTTTCTTAGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTG < 1:3985881/150‑1 TGTAGTTCCAGTAAACTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGA < 2:4172599/150‑1 GTAGTTCCAGTAAACTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAG > 1:1469568/1‑150 TAGTTCCGGTAAACTTTTCTTGGAAAACGTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCCTACCCAGTTTTCATATTTTGGCCTCTATTCATAACCCTAAGTTGTGAGT < 1:1744795/150‑1 agttccaGTAAACTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTG < 1:2678952/143‑1 gttccaGTAAACTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGA > 2:4013479/7‑150 ttccaGTAAACTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGAT > 1:3620906/6‑150 GTAAACTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTAT > 2:3943049/1‑150 GTAAACTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTAT < 1:2377206/150‑1 TAAACTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATC > 1:2931602/1‑150 aacTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCT < 2:577042/147‑1 aacTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACCGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTTATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCT < 2:1739872/147‑1 acTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTCAGTGATGTTATCCTT > 2:1320039/3‑150 TTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAA > 2:3607676/1‑150 TTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAA > 2:2613532/1‑150 CTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCT < 1:4482593/150‑1 TTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTT < 2:1205598/150‑1 TGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTA > 1:903540/1‑150 GAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACGCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGA < 2:4266146/150‑1 AAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAG > 1:1562454/1‑150 AAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAG > 2:820647/1‑150 atACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGT < 2:1831343/148‑1 AAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGT > 2:1099210/1‑150 CTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGT > 1:1680981/1‑150 GCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTAT > 2:3408535/1‑150 CCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAAc < 2:1565237/150‑2 CTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTACATCTTAGAGTCACTATTGTATAATT > 2:1085177/1‑150 CTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATT < 2:3012548/150‑1 CTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAG > 2:923960/1‑150 TTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAA > 2:41127/1‑150 AGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGA > 1:2310132/1‑150 TTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAA > 2:2263159/1‑150 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2:3154405/1‑150 ATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAA < 1:951798/150‑1 TTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTCACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTTTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTTTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAAC < 1:301704/150‑1 AATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTA > 1:4312490/1‑150 tttTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTC > 2:3777074/4‑150 tttTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCCAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTC < 1:1350823/147‑1 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TATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCT < 2:4543926/150‑1 TATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCT > 1:3158758/1‑150 ATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTG > 2:3059951/1‑150 TTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGT > 1:1175024/1‑150 TGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCA > 1:2058540/1‑150 ACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAAT < 1:617899/150‑1 CCTCTATTAATAACCCTAAATTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAGAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATC > 2:4138706/1‑150 CTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCC < 2:2420256/150‑1 TCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCG < 2:2125988/150‑1 TATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTC < 1:780544/150‑1 ATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCA > 1:853155/1‑150 TAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACC > 1:1003577/1‑150 AATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACCC > 1:4040113/1‑150 TAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTCAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACCCAG > 2:4462120/1‑150 TAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACCCAGCTGTCT > 2:2096264/1‑150 AAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACCCAGCTGTCTA < 1:3602912/150‑1 AGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACCCAGCTGTCTAA > 1:2587282/1‑150 GTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACCCAGCTGTCTAAA < 1:2184525/150‑1 GTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACCCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACCCAGCTGTCTAAA > 1:2814190/1‑150 TGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACCCAGCTGTCTAAAGA > 2:1420560/1‑150 TGAGTGATGTTATCCTTAAATCCTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACCCAGCTGTCTAAAGAAT < 1:3408535/150‑1 |||| ACTGTAGTCCCCGTAAATTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTCTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP043523/1867643‑1867496‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACCCAGCTGTCTAAAGAATAC > CP043523/1958190‑1958338 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |