New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP043523 | 1867496 = | 0 (0.000) | 497 (0.980) +GTGA |
210/290 | 0.3 | 69.3% | intergenic (‑292/‑29) | FTN78_chr1913/FTN78_chr1914 | hypothetical protein/Site‑specific recombinase, DNA invertase Pin related protein |
? | CP043523 | 1958190 = | 452 (0.860) | intergenic (‑52/‑59) | FTN78_chr2011/FTN78_chr2012 | hypothetical protein/Mobile element protein |
Only 100 of 519 total aligned reads displayed.
TACACAAACATCTTTTGTAAAAAGCCTTTTTTCTGTTCTTTCAACAAATCTAACTTACGTTGATGAAGAGAGATAATAAAGAGCTCAAAACTTAACAGTTGTGAGCTCTTTTTTTGTGTGTTAAAATTAAAGGAGAAAGAACGGCTCGTAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAGAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAATTTACGGGGACTACAGTT > CP043523/1867347‑1867644 | tctttagacagctgggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcaca > 2:1420560‑M1/150‑150 (MQ=255) tttagacagctgggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgggtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAAc > 1:2814190‑M1/148‑150 (MQ=255) tttagacagctgggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAAc < 1:2184525‑M1/3‑1 (MQ=255) ttagacagctgggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACt > 1:2587282‑M1/147‑150 (MQ=255) tagacagctgggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACtt < 1:3602948‑M1/5‑1 (MQ=255) agacagctgggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTa > 2:2096264‑M1/145‑150 (MQ=255) agacagctgggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTa > 2:4301172‑M1/145‑150 (MQ=255) gacagctgggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAg > 1:3824413‑M1/144‑150 (MQ=255) gacagctgggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAg > 1:2887876‑M1/144‑150 (MQ=255) ctgggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttgaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGtta > 2:4462120‑M1/139‑150 (MQ=255) gggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGttatt > 1:4040113‑M1/137‑150 (MQ=255) ggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGttatta > 1:2108106‑M1/136‑150 (MQ=255) ggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGttatta > 1:1003577‑M1/136‑150 (MQ=255) tgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAAt > 2:2840177‑M1/134‑150 (MQ=255) gacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATa < 1:780544‑M1/18‑1 (MQ=255) cggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATaga < 2:2125988‑M1/20‑1 (MQ=255) cggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATaga < 1:3130509‑M1/20‑1 (MQ=255) gattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttctgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAATTTAGGGTTATTAATAGAgg > 2:4138706‑M1/129‑150 (MQ=255) attgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGt < 1:617899‑M1/23‑1 (MQ=255) ttgaccagaatgataggaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTc > 1:2432481‑M1/127‑150 (MQ=255) tgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCa < 1:2059393‑M1/25‑1 (MQ=255) accagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCaaa > 1:1175024‑M1/124‑150 (MQ=255) cagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAat > 2:3059951‑M1/122‑150 (MQ=255) agaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcacccacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAata < 1:850332‑M1/30‑1 (MQ=255) gaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAatat > 2:4339586‑M1/120‑150 (MQ=255) gaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAatat > 1:4265474‑M1/120‑150 (MQ=255) aatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATg < 1:1375541‑M1/32‑1 (MQ=255) aatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATg > 1:366200‑M1/119‑150 (MQ=255) aatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttctcccttgtctgaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATg > 2:4111275‑M1/119‑150 (MQ=255) ggatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgattagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGaa > 2:3471917‑M1/117‑150 (MQ=255) gatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGaaa < 1:4110057‑M1/35‑1 (MQ=255) gaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTg > 2:2360804‑M1/112‑150 (MQ=255) gaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTg < 2:2539109‑M1/39‑1 (MQ=255) ggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGt < 2:3304323‑M1/42‑1 (MQ=255) ggcgataacggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttctgccctttgtctaaattatacaatagtgagtctaagatttaaggataacattactcacAACTTAGGCTTATTAATAGAGGTCAAAATATTAAAATTGGGt > 2:4374522‑M1/109‑150 (MQ=255) ngataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttttcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTAt < 2:949949‑M1/44‑1 (MQ=255) cgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTAt < 1:3082325‑M1/44‑1 (MQ=255) taagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCa > 1:4541470‑M1/104‑150 (MQ=255) aagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttttcttttgtttaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCAc < 2:162980‑M1/48‑1 (MQ=255) agggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACg > 1:1762325‑M1/102‑150 (MQ=255) gtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACgtgt > 2:1056429‑M1/99‑150 (MQ=255) gtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACgtgt < 1:1078968‑M1/52‑1 (MQ=255) ctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGt > 1:97778‑M1/95‑150 (MQ=255) tttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTa < 1:568651‑M1/57‑1 (MQ=255) ttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTAc < 2:741879‑M1/58‑1 (MQ=255) taaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACt > 1:3418375‑M1/92‑150 (MQ=255) aaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACtt > 2:3357395‑M1/91‑150 (MQ=255) tcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGa < 1:348165‑M1/64‑1 (MQ=255) tcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGa > 2:1325486‑M1/87‑150 (MQ=255) ttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAAc < 2:676601‑M1/66‑1 (MQ=255) ttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAAc > 2:535403‑M1/85‑150 (MQ=255) ttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAAc > 1:886655‑M1/85‑150 (MQ=255) ttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAAc > 1:1285509‑M1/85‑150 (MQ=255) ttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAAcaa > 1:472864‑M1/83‑149 (MQ=255) ttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAAcaa < 1:1957415‑M1/68‑2 (MQ=255) gagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGaacaaaa > 2:3777074‑M1/81‑147 (MQ=255) gagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGaacaaaa > 2:2918370‑M1/81‑147 (MQ=255) tagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAAtt > 1:4312490‑M1/78‑150 (MQ=255) gtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGaa < 1:3273402‑M1/77‑1 (MQ=255) gtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattataaaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcaaAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTGAGTACTTTTGAACAAAAATTAGaa < 1:301704‑M1/77‑1 (MQ=255) tttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAAt < 1:951798‑M1/78‑1 (MQ=255) ttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAAtctc > 2:176538‑M1/70‑150 (MQ=255) tgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggattacatcactcacTAATTATGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTAAACAAAAATTAGAATCTCa < 2:3720288‑M1/82‑1 (MQ=255) tgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCa > 2:3249585‑M1/69‑150 (MQ=255) tgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCa > 2:3154405‑M1/69‑150 (MQ=255) gcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCaa < 2:2006139‑M1/83‑1 (MQ=255) tgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAAtt > 1:1709921‑M1/65‑150 (MQ=255) tgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAAtt < 1:2501655‑M1/86‑1 (MQ=255) gtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTg < 2:4590922‑M1/87‑1 (MQ=255) ttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGaa > 2:2263159‑M1/62‑150 (MQ=255) tcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCt > 1:2310132‑M1/57‑150 (MQ=255) tgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAaag > 1:3754772‑M1/52‑150 (MQ=255) ctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAaagaag > 2:923960‑M1/49‑150 (MQ=255) aattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAg < 2:3012548‑M1/105‑1 (MQ=255) gttatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAgg < 2:1565237‑M1/106‑1 (MQ=255) atacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGc > 2:3408535‑M1/42‑150 (MQ=255) agtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAgaagaa > 2:1266164‑M1/35‑150 (MQ=255) agtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAgaagaa > 1:1580732‑M1/35‑150 (MQ=255) actctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAagtat < 2:1831343‑M1/120‑3 (MQ=255) ctctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGtttt < 2:1097265‑M1/121‑1 (MQ=255) ctctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGtttt > 2:820647‑M1/30‑150 (MQ=255) tctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGCGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTc < 2:4266146‑M1/122‑1 (MQ=255) aagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCaa < 2:1205598‑M1/125‑1 (MQ=255) agatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAg < 1:4482593‑M1/126‑1 (MQ=255) tttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGaaa > 2:2613532‑M1/22‑150 (MQ=255) ttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGaaaa > 2:3607767‑M1/21‑150 (MQ=255) aggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCaagaaaagtt < 1:4154974‑M1/133‑4 (MQ=255) gataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTa > 1:2931602‑M1/16‑150 (MQ=255) ataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTAc < 1:2377206‑M1/136‑1 (MQ=255) ataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTAc > 2:3943049‑M1/15‑150 (MQ=255) taacatcactcatAACTTAGTGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTact > 2:4519219‑M1/14‑149 (MQ=255) atcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAgtttactggaa > 1:3620906‑M1/10‑145 (MQ=255) atcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAgtttactggaa > 2:2184525‑M1/10‑145 (MQ=255) tcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAagtttactggaac > 2:4013479‑M1/9‑144 (MQ=255) cactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAaagtttactggaact < 1:2678952‑M1/143‑8 (MQ=255) ctcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTAc > 1:1469568‑M1/6‑150 (MQ=255) tcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACa < 2:4172599‑M1/146‑1 (MQ=255) cacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCTAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAg < 1:3985881‑M1/147‑1 (MQ=255) acAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAGt > 1:1808410‑M1/3‑150 (MQ=255) cAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTAAAATAAAAAAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTACAgtc > 2:2425767‑M1/2‑149 (MQ=255) | TACACAAACATCTTTTGTAAAAAGCCTTTTTTCTGTTCTTTCAACAAATCTAACTTACGTTGATGAAGAGAGATAATAAAGAGCTCAAAACTTAACAGTTGTGAGCTCTTTTTTTGTGTGTTAAAATTAAAGGAGAAAGAACGGCTCGTAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAGAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAATTTACGGGGACTACAGTT > CP043523/1867347‑1867644 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |