| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP043523 | 1867496 = | 0 (0.000) | 497 (0.980) +GTGA |
210/290 | 0.3 | 69.3% | intergenic (‑292/‑29) | FTN78_chr1913/FTN78_chr1914 | hypothetical protein/Site‑specific recombinase, DNA invertase Pin related protein |
| ? | CP043523 | 1958190 = | 452 (0.860) | intergenic (‑52/‑59) | FTN78_chr2011/FTN78_chr2012 | hypothetical protein/Mobile element protein | |||||
Only 100 of 962 total aligned reads displayed.
TTATTCGGATATAATAATAAACCAACTTTCAATAGTTCATTGGCTTTGTCGTAGTTTTTCCACAAAATTAAATATGAAATATACTTTTCCAGTAGCATTTTAGTATATTTATGAATTTTTAAATTCCCTATCCGTTTTGAATATTTATTGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACCCAGCTGTCTAAAGAATACG > CP043523/1958041‑1958339 | ttattCGGATATAATAATAAACCAACTTTCAATAGTTCATTGGCTTTGTCGTAGTTTTTCCACAAAATTAAATATGAAATATACTTTTCCAGTAGCATTTTAGTATATTTATGAATTTTTAAATTCCCTATCCGTTTTGAATATTTATtg < 2:2784841/150‑1 (MQ=255)ttattCGGATATAATAATAAACCAACTTTCAATAGTTCATTGGCTTTGTCGTAGTTATTCCACAAAATTAAATATGAAATATACTTTTCCAGTAGCATTTTAGTATATTTATGAATTTTTAAATTCCCTATCCGTTTTGAATATTTATtg > 1:383597/1‑150 (MQ=255) ttCGGATATAATAATAAACCAACTTTCAATAGTTCATTGGCTTTGTCGTAGTTTTTCCACAAAATTAAATATGAAATATACTTTTCCAGTAGCATTTTAGTATATTTATGAATTTTTAAATTCCCTATCCGTTTTGAATATTTATTGTGa > 1:3295078/1‑150 (MQ=255) 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tttcttggaaaacttcttctgctcctgcttctttcagaacttcaatttgagattctaatttttgttcaaaagtactgacacgtgcatacccaattttcatattttgacctctattaataaccctaagttgtgaGTGATGTTATCCTTaaa < 1:2146253‑M2/17‑1 (MQ=255) aaCCAACTTTCAATAGTTCATTGGCTTTGTCGTAGTTTTTCCACAAAATTAAATATGAAATATACTTTTCCAGTAGCATTTTAGTATATTTATGAATTTTTAAATTCCCTATCCGTTTTGAATATTTATTGTGATGTTATCCTTAAATCt < 2:761264/150‑1 (MQ=255) aCCAACTTTCAATAGTTCATTGGCTTTGTCGTAGTTTTTCCACAAAATTAAATATGAAATATACTTTTCCAGTAGCATTTTAGTATATTTATGAATTTTTAAATTCCCTATCCGTTTTGAATATTTATTGTGATGTTATCCTTAAATCtt < 1:1954959/150‑1 (MQ=255) gaaaacttcttctgctcctgcttctttcagaacttcaatttgagattctaatttttgttcaaaagtactgacacgtgcatacccaattttcatattctgacctctattaataaccctaagttgtgaGTGATGTTATCCTTAAATCTTaga < 1:4479785‑M2/24‑1 (MQ=255) aaaacttcttctgctcctgcttctttcagaacttcaatttgagattctaatttttgttcaaaagtactgacacgtgcatacccaattttcatattttgacctctattaataaccctaagttgtgaGTGATGTTATCCTTAAATCTTagag > 2:820647‑M2/126‑150 (MQ=255) 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cATTGGCTTTGTCGTAGTTTTTCCACAAAATTAAATATGAAATATACTTTTCCAGTAGCATTTTAGTATATTTATGAATTTTTAAATTCCCTATCCGTTTTGAATATTTATTGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGtata > 2:2263288/1‑150 (MQ=255) aTTGGCTTTGTCGTAGTTTTTCCACAAAATTAAATATGAAATATACTTTTCCAGTAGCATTTTAGTATATTTATGAATTTTTAAATTCCCTATCCGTTTTGAATATTTATTGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATaa < 2:4530401/150‑1 (MQ=255) tGGCTTTGTCGTAGTTTTTCCACAAAATTAAATATGAAATATACTTTTCCAGTAGCATTTTAGTATATTTATGAATTTTTAAATTCCCTATCCGTTTTGAATATTTATTGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAAtt > 2:2128692/1‑150 (MQ=255) ctgcttctttcagaacttcaatttgagattctaatttttgttcaaaagtactgacacgtgcatacccaattttcatattttgacctctattaataaccctaagttgtgaGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAAtt < 2:2366786‑M2/41‑1 (MQ=255) tgcttctttcagaacttcaatttgagattctaatttttgttcaaaagtactgacacgtgcatacccaattttcatattttgacctctattaataaccctaagttgtgaGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAAttt < 2:1847572‑M2/42‑1 (MQ=255) 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ttGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACCCAGCTGTCTAAAGAATa < 2:3380218/150‑1 (MQ=33) tgtgATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACCCAGCTGTCTAAAGAATac < 2:918011/150‑1 (MQ=32) | TTATTCGGATATAATAATAAACCAACTTTCAATAGTTCATTGGCTTTGTCGTAGTTTTTCCACAAAATTAAATATGAAATATACTTTTCCAGTAGCATTTTAGTATATTTATGAATTTTTAAATTCCCTATCCGTTTTGAATATTTATTGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACCCAGCTGTCTAAAGAATACG > CP043523/1958041‑1958339 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |