| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP043523 | = 1895196 | 18 (0.040) | 473 (0.960) +TGAGTGAG |
165/270 | 2.1 | 96.4% | coding (316/891 nt) | FTN78_chr1944 | Mobile element protein |
| ? | CP043523 | 1895197 = | NA (NA) | coding (317/891 nt) | FTN78_chr1944 | Mobile element protein | |||||
Only 100 of 488 total aligned reads displayed.
TAGTGAAACACTTAAAGCTAAGCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP043523/1895048‑1895196‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCATTCCTTTGTGTCAGTCGATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCTACAAAGGGACAG > CP043523/1895197‑1895312 |||||||| TAGTGAAACACTTAAAGCAAAGCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAAT > 1:1485565/1‑150TAGTGAAACACTTAAAGCAAAGCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAAT < 1:4243933/150‑1 AGTGAAACACTTAAAGCAAAGCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATG > 1:326054/1‑150 AGTGAAACACTTAAAGCAAAGCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATG > 1:4042050/1‑150 AGTGAAACACTTAAAGCAAAGCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCATAATTTCCTAGAATATTATCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATG > 2:2791463/1‑150 GTGAAACACTTAAAGCAAAGCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGA < 1:553484/150‑1 TGAAACACTTAAAGCAAAGCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAG < 2:502834/150‑1 AAACACTTAAAGCAAAGCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTG > 2:1711853/1‑150 ACACTTAAAGCAAAGCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAG < 2:2092977/150‑1 CACTTAAAGCAAAGCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGT < 1:2155960/150‑1 CTTAAAGCAAAGCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGA > 1:3066980/1‑150 CTTAAAGCAAAGCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGA > 1:1986967/1‑150 TAAAGCAAAGCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGT < 2:860469/150‑1 AAAGCAAAGCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTG < 2:1203554/150‑1 AAGCAAAGCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGT < 1:2761435/150‑1 caAAGCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATC < 1:2837500/148‑1 AAGCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCA > 2:2971193/1‑150 AAGCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCA > 2:658734/1‑150 AGCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCAT < 1:2634981/150‑1 GCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTACAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATT > 1:3798352/1‑150 GCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATT < 2:309426/150‑1 ACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTAT < 2:1162951/150‑1 ACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTAT > 2:466470/1‑150 ATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGAC < 1:2424620/150‑1 ATTGGATCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGAC < 2:3179543/150‑1 GGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGC > 2:3366459/1‑150 GCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCT < 2:1897340/150‑1 GCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCT > 1:773288/1‑150 CTCCAAGTTTATTTCCTAATTTCCTCGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACCGCTT > 2:3809688/1‑150 CTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTT < 1:1794992/150‑1 CTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTT > 1:229281/1‑150 TCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTC > 1:4263629/1‑150 CAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCC < 1:2333540/150‑1 AAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCC < 1:510210/150‑1 AAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCC < 1:3229101/150‑1 TATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCC > 1:1939938/1‑150 ATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCT > 2:2845359/1‑150 ATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCT > 2:2699167/1‑150 TTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTT < 2:4042050/150‑1 TTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTT < 1:1889707/150‑1 CCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGT > 2:2004390/1‑150 CCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGT < 1:2098622/150‑1 CCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGT > 2:2569836/1‑150 CTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTG < 2:1464409/150‑1 TAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGT > 1:1159689/1‑150 TTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTTACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGc > 2:3925443/1‑149 TTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGc > 1:33196/1‑149 CCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCCCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGcct < 1:4429368/150‑4 CTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGccta > 2:1397637/1‑146 GAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGcctattc > 2:622504/1‑143 ATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGT > 1:254685/1‑150 TATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTA > 1:827396/1‑150 ATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAA > 1:1299291/1‑150 CTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTT < 2:1751543/150‑1 GCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAG < 1:922018/150‑1 CTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGA > 1:217133/1‑150 CTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGA > 2:1569816/1‑150 TTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAG < 2:581921/150‑1 TTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAG < 1:2695117/150‑1 TGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGC < 2:197419/150‑1 TCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAA > 2:1364101/1‑150 CGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAG < 2:2395704/150‑1 GCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGT > 1:3648656/1‑150 CCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTT > 2:4271757/1‑150 CGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTC > 2:2517289/1‑150 GTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGG < 2:2760899/150‑1 TAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGA > 1:1390859/1‑150 AATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCTCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAG < 2:4100639/150‑1 AATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAG < 1:2320841/150‑1 GCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATT > 1:4522496/1‑150 GCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATT < 1:3373155/150‑1 CCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTA > 2:3670421/1‑150 CCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTA < 1:1614455/150‑1 CTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCA < 1:3759247/150‑1 GAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTT < 2:797730/150‑1 AGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTG > 2:3498195/1‑150 AGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCATCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTG < 2:3734205/150‑1 TATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGC < 2:1023812/150‑1 CCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTAC > 1:2790338/1‑150 CCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTAC > 2:3248964/1‑150 CAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACA > 2:452815/1‑150 AGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAAT > 1:3526231/1‑150 AGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAAT < 1:4085768/150‑1 AGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTA > 2:4207985/1‑146 AGTCATTCGCCAACCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTA < 1:4207985/146‑1 GTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATG < 2:1956825/150‑1 GTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATG < 2:2283609/150‑1 GTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATG < 1:2905309/150‑1 TCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGC < 2:1090025/150‑1 TCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGC < 1:391311/150‑1 CATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCT < 2:2147399/150‑1 TTCGCCAAGCGCTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGAAATGAGTGAGTGCGCGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTATGTGTCAGCCTATTCGTAATGTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCTAC > 2:4381039/1‑150 TTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGGAAATGTTGGCTAGAATGCTAC > 1:3845589/1‑150 TCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCTACA < 1:1668648/150‑1 nGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCTACAA > 1:1012785/2‑150 CAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCTACAAAGG < 1:3137025/150‑1 AAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCTACAAAGGG < 1:2881858/150‑1 AGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCTACAAAGGGA < 1:105538/150‑1 CACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCTACAAAGGGACA < 1:658734/150‑1 CACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCTACAAAGGGACA > 1:3964223/1‑150 |||||||| TAGTGAAACACTTAAAGCTAAGCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP043523/1895048‑1895196‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCATTCCTTTGTGTCAGTCGATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCTACAAAGGGACAG > CP043523/1895197‑1895312 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |