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cACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAAtgagtgagtgagtgtatccattattgacagcttcccccttcctttgtgtcagcctattcgtaatttcagaagcaaagttcttggagattatgcaaatgttggctacaatgctacaaagggaca > 1:3964223‑M1/1‑27 (MQ=255) | TTAGTGAAACACTTAAAGCTAAGCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCATTCCTTTGTGTCAGTCGATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCTACAAAGGGACAGTACTTCT > CP043523/1895047‑1895319 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |