New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | CP043523 | = 1998587 | 622 (1.170) | intergenic (‑79/‑166) | FTN78_chr2059/FTN78_chr2060 | Mobile element protein/Sulfate permease |
Only 100 of 662 total aligned reads displayed.
ACTCAAGAAATATTTAAATACATTGAGACCTATTACAATACAAAAAGGATGCATTCAGGTCTTGATTACAAGTCTCCAAAAGACTTTGAAAAATATAATTCTTAAATTCTCTTAACTCCGTGTCTAGTTTTTCGTTGACTTTCCATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP043523/234849‑234703 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTCAATAGAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGTATGAAGCTGTGGCAAG < CP043523/1998587‑1998441 |||||||||||||| CTCAAGAAATATTTAAATACATTGAGACCTATTACAATACAAAAAGGATGCATTCAGGTCTTGATTACAAGTCTCCAAAAGACTTTGAAAAATATAATTCTTAAATTCTCTTAACTCCGTGTCTAGTTTTTCGTTGACTTTCCATTCG > 2:824643/1‑148 CAAGAAATATTTAAATACATTGAGACCTATTACAATACAAAAAGGATGCATTCAGGTCTTGATTACAAGTCTCCAAAAGACTTTGAAAAATATAATTCTTAAATTCTCTTAACTCCGTGTCTAGTTTTTCGTTGACTTTCCATTCGGA 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> 2:4616111/1‑148 CTTTCCATTCGGAGGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATT > 1:2856447/1‑148 TTTCCATTCGGAGGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTT > 2:4334580/1‑148 TTCCATTCGGAGGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTA > 2:1988947/1‑148 TCCATTCGGAGGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAA > 2:4068852/1‑148 ATTCGGAGGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGT < 1:3462084/148‑1 TTCGGAGGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGTA > 1:737330/1‑148 TCGGAGGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGTAT > 1:2274230/1‑148 CGGAGGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGTATG < 2:3733596/148‑1 GGAGGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGTATGA > 1:3901732/1‑148 GAGGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGTATGAA > 2:3975467/1‑148 GGTCTTTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGTATGAAGC < 1:3785722/148‑1 TTTCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGTATGAAGCTGTGG > 2:2986904/1‑148 TCTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGTATGAAGCTGTGGCA > 2:145450/1‑148 CTTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTAAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGTATGAAGCTGTGGCAA < 2:3861465/148‑1 |||||||||||||| ACTCAAGAAATATTTAAATACATTGAGACCTATTACAATACAAAAAGGATGCATTCAGGTCTTGATTACAAGTCTCCAAAAGACTTTGAAAAATATAATTCTTAAATTCTCTTAACTCCGTGTCTAGTTTTTCGTTGACTTTCCATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP043523/234849‑234703 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTCAATAGAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGTATGAAGCTGTGGCAAG < CP043523/1998587‑1998441 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |