New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP043523 | = 795292 | 491 (0.920) | 233 (0.460) +CTCGGTG |
88/280 | 17.2 | 32.0% | coding (395/411 nt) | FTN78_chr0848 | Mobile element protein |
? | CP043523 | 838360 = | 548 (1.030) | intergenic (‑66/+92) | FTN78_chr0888/FTN78_chr0889 | hypothetical protein/General stress protein, Gls24 family | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
TGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP043523/795169‑795292 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTCTATCTAAATAAAAAACTATACAATTGAAGTAACTTACTAAAAAAGCCTCACAATAGAGGCCTTTGTTCATCAGGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGTACTGTCTTCTACTTTGTCTTTTACTTT > CP043523/838360‑838505 ||||||| CAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTA < 1:3870141/148‑1 CAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTA < 2:1670807/148‑1 AATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTAT < 2:4642169/148‑1 AATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTAT < 1:2022548/148‑1 AATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTAT > 1:3692172/1‑148 AATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTAT < 1:1431361/148‑1 ATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATA > 1:904115/1‑148 ATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATA < 1:4558011/148‑1 TTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATAt > 1:4022339/1‑147 TTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTATAGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTAAAAAAAAAAAAAAAACTATAt < 2:4415011/148‑2 TTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATAta > 2:2167285/1‑146 TTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATAta > 2:2759233/1‑146 TTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATAta < 1:4282434/148‑3 AAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATAtaaa < 1:1330197/148‑5 AAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATAtaaa < 1:2531837/148‑5 ATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATAtaaatg < 2:1801803/148‑7 ATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATAtaaatg < 2:3421032/148‑7 ATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATAtaaatg < 1:3270024/148‑7 ATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATAtaaatg > 1:1060625/1‑142 ATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATAtaaatg > 1:1357081/1‑142 ATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAA > 1:2961470/1‑148 TAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAAc < 1:3565404/148‑2 AAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAAct > 1:1141285/1‑146 AAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAAct > 1:139839/1‑146 AAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATACAAATGAAct > 1:3999015/1‑146 AGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAActc > 2:2593955/1‑145 AGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAActc < 2:1200727/148‑4 GAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAActca > 2:3460644/1‑144 GAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAActca < 1:2714830/148‑5 GAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAAatca > 2:1039908/1‑144 AACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAActcac < 1:1514311/148‑6 AACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTAGAAAAGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAActcac < 2:4227202/148‑6 ACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAActcact > 1:2225208/1‑142 TTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTA < 1:1584463/148‑1 TTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTAC < 1:713457/148‑1 TGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT < 1:1987749/148‑1 GAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTA > 1:2040305/1‑148 GAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTA > 2:222995/1‑148 GAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAA < 2:337619/148‑1 GAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAA > 2:2735612/1‑148 AAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAA < 1:848567/148‑1 AAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCAAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAA < 2:2396692/148‑1 AGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCCATCCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAATAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAAg < 1:4240460/148‑2 AGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAAg < 1:3919632/148‑2 AGCCTATAAGAGTATTTTCTGGTAAATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTAAACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAAg < 2:2001020/148‑2 GCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAAgc > 2:403086/1‑146 GCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAAgc < 2:119140/148‑3 CCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAAgcc < 1:1016342/148‑4 CCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAAgcc < 1:1758746/148‑4 CTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAAgcct < 1:1854905/148‑5 AGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATA < 1:1227136/148‑1 AGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATA > 2:4589174/1‑148 AGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATA < 1:110396/148‑1 AGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATA < 2:121805/148‑1 AGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATA > 2:3543300/1‑148 GTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAG < 1:4405188/148‑1 GTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAG < 1:427223/148‑1 TATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGA < 2:4276869/148‑1 ATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAG < 2:3294348/148‑1 TTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGC < 2:3714108/148‑1 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2:3627510/1‑145 TGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTT < 1:1950582/148‑1 TGGTACATCGAAGCCATTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTCATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTT < 2:1571805/148‑1 GGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTa < 1:1228239/148‑2 GGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCATCATAATAGAGGCATTTa < 2:144174/148‑2 GTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCTAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTat < 2:4204928/148‑3 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1:2419979/148‑7 ATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTatttct < 2:1356015/148‑7 TCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTatttctc < 1:3433839/148‑8 CTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTT > 2:2811036/1‑148 CAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATT < 2:1933537/148‑1 GAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTA > 1:495233/1‑148 AATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAA < 1:1375910/148‑1 TCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACT > 1:3735418/1‑148 CCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTC < 2:336856/148‑1 CCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTC > 2:4482262/1‑148 TCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAG < 1:2076728/148‑1 AAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCT < 2:478140/148‑1 TTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTGTATCTGAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTT > 2:902240/1‑148 TAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTA < 2:1535819/148‑1 GGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCT > 1:720177/1‑148 GGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCT > 2:4350192/1‑148 TATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGT < 2:257057/148‑1 CACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGACCTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGTATTGTCT < 2:2530751/148‑1 CACCTAATCAATTTGACTCGGTGCGTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGTATTGTCT < 2:2631183/148‑1 TTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGTATTGTCTTCTACTTTGTC > 2:2520245/1‑148 TGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGTATTGTCTTCTACTTTGTCTT > 2:1992069/1‑148 ACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAAAGCCTCACAATAGAGGCCTTTGTTCATCAGGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGTACTGTCTTCTACTTTGTCTTT > 2:779810/1‑148 GGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGTATTGTCTTCTACTTTGTCTTTTACTT < 1:163448/148‑1 GTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGTATTGTCTTCTACTTTGTCTTTTACTTT < 1:2390758/148‑1 ||||||| TGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP043523/795169‑795292 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTCTATCTAAATAAAAAACTATACAATTGAAGTAACTTACTAAAAAAGCCTCACAATAGAGGCCTTTGTTCATCAGGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGTACTGTCTTCTACTTTGTCTTTTACTTT > CP043523/838360‑838505 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |