| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP043523 | = 795292 | 491 (0.920) | 233 (0.460) +CTCGGTG |
88/280 | 17.2 | 32.0% | coding (395/411 nt) | FTN78_chr0848 | Mobile element protein |
| ? | CP043523 | 838360 = | 548 (1.030) | intergenic (‑66/+92) | FTN78_chr0888/FTN78_chr0889 | hypothetical protein/General stress protein, Gls24 family | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 497 total aligned reads displayed.
ATGGACATTTAAAAAGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAACGTCAGTTTTTTTTAGATATCTCTTTTTATAAAAATAGTATGGAAAGATTTTAAGACTATCTTTCCAATTGTATACTTTTAA > CP043523/795145‑795439 | aTGGACATTTAAAAAGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGa > 2:669426/1‑148 (MQ=32) tGGACATTTAAAAAGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGaa > 2:1087936/1‑148 (MQ=32) gACATTTAAAAAGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGaaaa > 1:558491/1‑148 (MQ=32) aCATTTAAAAAGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAg < 1:3457393/148‑1 (MQ=32) cATTTAAAAAGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACTAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAgg < 2:1216179/148‑1 (MQ=17) cATTTAAAAAGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAgg < 2:1800880/148‑1 (MQ=32) tAAAAAGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAg < 2:2143204/148‑1 (MQ=32) tAAAAAGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAg < 1:2558766/148‑1 (MQ=32) aaaaaGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGt < 2:451626/148‑1 (MQ=32) aaaaGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTg > 2:3078921/1‑148 (MQ=32) aaaaGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTg > 1:991251/1‑148 (MQ=32) aaGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCt < 2:1338195/148‑1 (MQ=32) aaGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCt < 1:4648014/148‑1 (MQ=32) gagagTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTa > 1:2893038/1‑148 (MQ=32) agagTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTaa < 1:4357012/148‑1 (MQ=32) gagTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTaaa > 1:1687306/1‑148 (MQ=32) agTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTaaaa > 2:2574350/1‑148 (MQ=32) tgtACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAaataaata > 2:1892866/1‑148 (MQ=32) gtACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAg < 2:569996/148‑1 (MQ=32) 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ccAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGAtt > 2:4683912/1‑148 (MQ=11) ccAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGAtt > 1:2460719/1‑148 (MQ=11) gagTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTa < 1:633275/148‑1 (MQ=32) agTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTaa < 2:900874/148‑1 (MQ=32) tATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAACg > 1:3174858/1‑148 (MQ=32) tATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAACg > 1:3101901/1‑148 (MQ=32) tATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAACg > 1:4506831/1‑148 (MQ=32) tttCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAACGTCa > 2:2531342/1‑148 (MQ=32) tCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAACGTCAGt > 2:4647340/1‑148 (MQ=34) cTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAACGTCAGtt < 1:1810830/148‑1 (MQ=35) 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gAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAACGTCAGTTTTTTTTAGATATCTCTTTTTATAAAAATAGTATGGAAAGATTTTAAGACTATCTTTCCAATTGTATACTTTTa > 2:3405180/1‑148 (MQ=255) | ATGGACATTTAAAAAGAGAGTGGGTGTACCAATTTAAATATAAGAACTTTGAAGAAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGAAAAGGTAAGTGCTTAAAATAAATAGATTAAAATTCTACGTTTGTTACTCTAAAAACTTGACGTAACGTCAGTTTTTTTTAGATATCTCTTTTTATAAAAATAGTATGGAAAGATTTTAAGACTATCTTTCCAATTGTATACTTTTAA > CP043523/795145‑795439 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |