| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP043523 | = 849146 | NA (NA) | 598 (1.130) | 221/294 | 0.3 | 50.2% | coding (622/624 nt) | FTN78_chr0901 | hypothetical protein |
| ? | CP043523 | 2058604 = | 592 (1.110) | intergenic (+38/‑88) | FTN78_chr2131/FTN78_chr2132 | SAM‑dependent methyltransferase, MraW methylase family/Putative sugar uptake protein | |||||
Only 100 of 598 total aligned reads displayed.
TATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP043523/849000‑849146‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATCTCTTGTTTTTTCCAAAAAAAAGAGTAAAATAGAGAAATGCTTATTTTTTTAAGTAAAAAAATATTTTAAAGAGGTAAATATACACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGGTTCTATCGGATTTGT > CP043523/2058604‑2058750 TATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAA > 1:407965/1‑148TATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAA > 2:1863072/1‑148 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TTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTtt < 2:2455459/148‑3 TTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTtt > 2:3937700/1‑146 TTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTtt < 1:539886/148‑3 AGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGT > 1:1143762/1‑148 AGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGT < 1:1064242/148‑1 CTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTC < 2:1700634/148‑1 CTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTC > 2:1466452/1‑148 CTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTC > 1:739769/1‑148 GGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCc > 2:4577550/1‑147 GTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCcga > 2:2533743/1‑145 TGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCcgaa > 1:292222/1‑144 GATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAG < 2:2945556/148‑1 ATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGA > 2:4375522/1‑148 TTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAG < 1:4622650/148‑1 TGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGT < 1:4687621/148‑1 ACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCTTAAAATTGAGTAA > 2:1162946/1‑148 CCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAAt > 2:627272/1‑147 CAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAAta < 1:4004784/148‑3 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AAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTT > 2:3305037/1‑148 AGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGACATGTTTAATTTTT < 2:4137041/148‑1 GGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTT > 1:4199219/1‑148 GTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAA < 1:2396444/148‑1 TTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAG < 1:2336259/148‑1 TTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAATAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGT > 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> 1:224438/1‑148 TGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAA < 1:100819/148‑1 GTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAA < 2:137774/148‑1 TTTTTCATGTATTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAATATCAATCTCTTGTTAGATCCCAAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAAT > 2:1001971/1‑148 TTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATA < 2:2888373/148‑1 TTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATA < 1:1833504/148‑1 TTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATA < 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> 2:19585/1‑148 TTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGC < 2:2717835/148‑1 TTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGC > 1:4374674/1‑148 TTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGC < 2:1495479/148‑1 TATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCTTAATAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCT > 2:2050446/1‑148 ATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTT < 1:1466452/148‑1 ACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGT < 1:939432/148‑1 CAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTT < 2:4065414/148‑1 ATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCC > 2:4444300/1‑148 ATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCC < 2:3977642/148‑1 TGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATG > 2:2145192/1‑148 ACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTT < 2:3800191/148‑1 CTCTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTT > 1:4122955/1‑148 CTAAGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGC > 1:137503/1‑148 AGATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTG > 2:3882651/1‑148 ATTTAAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGG < 1:3437806/148‑1 AAGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGGTTC > 1:3383113/1‑148 AGGATAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGGTTCT > 1:1197068/1‑148 TAACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGGTTCTATCG < 2:4681338/148‑1 AACATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGGTTCTATCGG < 1:3712782/148‑1 CATCAATCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGGTTCTATCGGAT > 2:3724899/1‑148 TATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP043523/849000‑849146‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATCTCTTGTTTTTTCCAAAAAAAAGAGTAAAATAGAGAAATGCTTATTTTTTTAAGTAAAAAAATATTTTAAAGAGGTAAATATACACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGGTTCTATCGGATTTGT > CP043523/2058604‑2058750 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |