| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP043523 | = 849146 | NA (NA) | 598 (1.130) | 221/294 | 0.3 | 50.2% | coding (622/624 nt) | FTN78_chr0901 | hypothetical protein |
| ? | CP043523 | 2058604 = | 592 (1.110) | intergenic (+38/‑88) | FTN78_chr2131/FTN78_chr2132 | SAM‑dependent methyltransferase, MraW methylase family/Putative sugar uptake protein | |||||
Only 100 of 570 total aligned reads displayed.
TATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATAAAGTAATATTGAAATATCTAAACTGGCACATTT > CP043523/849000‑849293 | tATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAc < 1:4301325/148‑1 (MQ=11)tATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCAc < 1:1532524/148‑1 (MQ=11) aTTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACt < 1:2966528/148‑1 (MQ=31) aTTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACt < 1:916360/148‑1 (MQ=31) ttCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGCCCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATGCAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTg < 1:4107463/148‑1 (MQ=17) ttCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTg < 1:4498626/148‑1 (MQ=32) ttCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTg < 2:3199188/148‑1 (MQ=32) cTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGt > 1:4400520/1‑148 (MQ=33) tttAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGtt < 1:2825756/148‑1 (MQ=34) ttAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGttt < 2:2892574/148‑1 (MQ=35) aGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTc > 2:1640883/1‑148 (MQ=37) gACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCt < 1:3134478/148‑1 (MQ=38) gACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCt > 2:3420279/1‑148 (MQ=38) gCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCa > 1:808483/1‑148 (MQ=40) cTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCAt > 2:3753911/1‑148 (MQ=255) tGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATa < 2:3312381/148‑1 (MQ=255) ggTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAAt > 2:2339476/1‑148 (MQ=255) ggTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAAt > 2:3940676/1‑148 (MQ=255) ggTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAAt > 2:2474404/1‑148 (MQ=255) cGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCaa < 2:1866026/148‑1 (MQ=255) aTTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGaa > 2:1132805/1‑148 (MQ=255) gACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATAc < 2:4374819/148‑1 (MQ=255) ccAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTTATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCa > 2:3054966/1‑148 (MQ=255) aaTGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTAc < 1:2590024/148‑1 (MQ=255) aTGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACt > 1:2389701/1‑148 (MQ=255) aTGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACt > 2:1155839/1‑148 (MQ=255) tGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTa < 1:3695265/148‑1 (MQ=255) aTAGGAGGCGATTAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCTTGTTTTTGTTCTTTGTTTATATTATACAATAGTGACTCTAAGACTTAAGGATAACATCTCTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGATTactattactatt < 2:1708023/148‑1 (MQ=17) aTAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTatt > 1:503465/1‑148 (MQ=255) aGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTattaa > 2:423419/1‑148 (MQ=18) gAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTattaat < 2:2418795/148‑1 (MQ=255) aGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTattaatta < 1:2708999/148‑1 (MQ=255) gCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAg < 2:1502202/148‑1 (MQ=255) gATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGaa < 1:3193392/148‑1 (MQ=255) tAAGGGTTTCTTTAATTTCTTTTGAGTAGTGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTTAgttct < 2:4283941/148‑5 (MQ=255) tAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAAct > 1:1423536/1‑148 (MQ=255) aaGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAActc < 1:2071389/148‑1 (MQ=255) aGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAActct < 1:740432/148‑1 (MQ=255) gTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTaaa > 1:3272356/1‑148 (MQ=255) tttCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATTTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTaaaa > 2:4611491/1‑148 (MQ=255) tCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAAt < 2:3477799/148‑1 (MQ=255) cTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAAtt < 1:2300981/148‑1 (MQ=255) cTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAAtt > 1:292998/1‑148 (MQ=255) cTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTGTATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAATGACTCTAGGATTTTAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAAtt < 2:3819721/148‑1 (MQ=18) ttAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAAtttt < 2:4041286/148‑1 (MQ=255) ttAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAAtttt < 1:305231/148‑1 (MQ=255) tAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTg < 2:367770/148‑1 (MQ=255) aaaTTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTgg < 1:3769043/148‑1 (MQ=255) aaaTTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTgg < 1:634536/148‑1 (MQ=255) ttCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATa > 1:1321559/1‑148 (MQ=255) cTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAgg > 2:620834/1‑148 (MQ=255) ttttGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAggg > 1:4212216/1‑148 (MQ=255) tttGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGt < 2:1438776/148‑1 (MQ=255) aGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAat < 1:3973599/148‑1 (MQ=255) tAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAatat < 2:500918/148‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCt < 1:1791638/148‑1 (MQ=255) gTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCtt < 2:228967/148‑1 (MQ=255) tttttCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTa > 1:4684348/1‑148 (MQ=255) tttttCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTa > 1:3874439/1‑148 (MQ=255) tttttCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTa < 1:3620331/148‑1 (MQ=255) cATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTAttttt > 2:3995717/1‑148 (MQ=255) aTGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTa < 2:572977/148‑1 (MQ=255) tGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTaa < 2:3876728/148‑1 (MQ=255) ttttGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAAc > 1:1033839/1‑148 (MQ=255) ttGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCt > 1:348697/1‑148 (MQ=255) tGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCtt < 2:2742033/148‑1 (MQ=255) ccTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCttttt > 2:3117289/1‑148 (MQ=255) cTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTtc > 1:3243361/1‑148 (MQ=255) cTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTtc < 1:770571/148‑1 (MQ=255) ttGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTtctc < 2:671864/148‑1 (MQ=255) ttGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTtctc > 2:2977360/1‑148 (MQ=255) tGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTcc > 1:1008515/1‑148 (MQ=255) tCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTACAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAGATGTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAACACCTTTTTCTCCAt > 2:1347111/1‑148 (MQ=255) cTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCAtt > 1:3556068/1‑148 (MQ=255) ttATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGa > 2:4513274/1‑148 (MQ=255) ttATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCAATTAATGa > 2:847922/1‑148 (MQ=255) aaTAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATaaa > 1:3402788/1‑148 (MQ=255) aaTAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATaaa < 2:4687127/148‑1 (MQ=255) tAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATTATTTCTAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATAACGt < 2:1417405/148‑1 (MQ=255) aGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATAAAGTa < 2:3169418/148‑1 (MQ=255) gACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATAAAGTAata < 2:4095339/148‑1 (MQ=255) tctAAGATTTAAGGATATCATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATCCCATTACTATTAATTAAGACCTCTACAAATTTTGGATTGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAGCCTTTTTCTCCATTAATGATATAAAGTAATATTg < 2:4444368/148‑1 (MQ=255) tctAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATAAAGTAATATTg > 1:841880/1‑148 (MQ=255) tctAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATAAAGTAATATTg < 2:1766349/148‑1 (MQ=255) ctAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATAAAGTAATATTGa < 1:2518339/148‑1 (MQ=255) ctAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATAAAGTAATATTGa > 1:1225912/1‑148 (MQ=255) ctAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATAAAGTAATATTGa < 1:1998451/148‑1 (MQ=255) tAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATAAAGTAATATTGaa > 2:2677388/1‑148 (MQ=255) aaGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATAAAGTAATATTGaaa > 1:4342999/1‑148 (MQ=255) aGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATAAAGTAATATTGAAat < 2:728531/148‑1 (MQ=255) aTTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATAAAGTAATATTGAAatat > 1:1649636/1‑148 (MQ=255) aTTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATACTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATAAAGTAATATTGAAatat < 1:2141299/148‑1 (MQ=255) tttAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATAAAGTAATATTGAAATATc > 2:3547188/1‑148 (MQ=255) tttAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATAAAGTAATATTGAAATATc < 1:148851/148‑1 (MQ=255) tttAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATAAAGTAATATTGAAATATc > 2:3376373/1‑148 (MQ=255) ttAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATAAAGTAATATTGAAATATCt < 1:1920786/148‑1 (MQ=255) aaCATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATAAAGTAATATTGAAATATCTAAACTGGc > 2:1225741/1‑148 (MQ=255) aaCATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATAAAGTAATATTGAAATATCTAAACTGGc > 2:2171959/1‑148 (MQ=255) tCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATAAAGTAATATTGAAATATCTAAACTGGCACAt > 1:137992/1‑148 (MQ=255) cACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATAAAGTAATATTGAAATATCTAAACTGGCACAtt > 2:2061343/1‑148 (MQ=255) | TATTCTTTAGACAGCTGGGTGACGGATTGACCAGAATGATAGAAGGCGATAAGGGTTTCTTTAAATTCTTTTGAGTAGCGTTTTTTCATGTTTTTGTCCTTTGTCTAAATTATACAATAGTGACTCTAAGATTTAAGGATAACATCACTGGTTTTCTTGCATAATTTCAAGAATACCATTACTATTAATTAAGAACTCTAAAAATTTTGGATAGGGTAAATATCCTTTATTTTTAAAACCTTTTTCTCCATTAATGATATAAAGTAATATTGAAATATCTAAACTGGCACATTT > CP043523/849000‑849293 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |