| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP043523 | = 849146 | NA (NA) | 598 (1.130) | 221/294 | 0.3 | 50.2% | coding (622/624 nt) | FTN78_chr0901 | hypothetical protein |
| ? | CP043523 | 2058604 = | 592 (1.110) | intergenic (+38/‑88) | FTN78_chr2131/FTN78_chr2132 | SAM‑dependent methyltransferase, MraW methylase family/Putative sugar uptake protein | |||||
Only 100 of 1198 total aligned reads displayed.
TTAAGTGGACTTCTAGTTTGCCACAAAAAGACTGGGAAGTGACTTCTTATGCACCTCTTAACCAAATTCATACGCCGCCAATTTTAGTTCTAATCGAAAAAAGAAAATAAATTTACTTGAATAGTTATGAATCTTATGTATTCTTTTATCTCTTGTTTTTTCCAAAAAAAAGAGTAAAATAGAGAAATGCTTATTTTTTTAAGTAAAAAAATATTTTAAAGAGGTAAATATACACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGGTTCTATCGGATTTGTA > CP043523/2058457‑2058751 | tattctttagacagctgggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgttttttcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcaa > 2:1863072‑M2/148‑148 (MQ=255) taAGTGGACTTCTAGTTTGCCACAAAAAGACTGGGAAGTGACTTCTTATGCACCTCTTAACCAAATTCATACGCCGCCAATTTTAGTTCTAATCGAAAAAAGAAAATAAATTTACTTGAATAGTTATGAATCTTATGTATTCTTTTAt > 1:4042675/1‑148 (MQ=255) ttctttagacagctgggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgttttttcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcaAtc > 1:807097‑M2/146‑148 (MQ=255) agacagctgggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgttttttcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcaATCTTTTGt > 1:1143762‑M2/140‑148 (MQ=255) agacagctgggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgttttttcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcaATCTTTTGt < 1:1064242‑M2/9‑1 (MQ=255) gctgggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgttttttcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcaATCTTTTGtttttt < 1:4424456‑M2/14‑1 (MQ=255) gTTTGCCACAAAAAGACTGGGAAGTGACTTCTTATGCACCTCTTAACCAAATTCATACGCCGCCAATTTTAGTTCTAATCGAAAAAAGAAAATAAATTTACTTGAATAGTTATGAATCTTATGTATTCTTTTATCTCTTGTTTTTTcc > 2:3188514/1‑148 (MQ=255) gggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgttttttcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcaATCTTTTGTTTTTtccc < 1:4677478‑M2/17‑2 (MQ=255) 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tATCTCTTGTTTTTTCCAAAAAAAAGAGTAAAATAGAGAAATGCTTATTTTTTTAAGTAAAAAAATATTTTAAAGAGGTAAATATACACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGGTTCTATCGGATTTGt > 2:2926380/1‑148 (MQ=255) aTCTTTTGTTTTTTCCCGAAAAAAGAGTAATATAGAGATATGTTTAATTTTTTAAGTAAAAAATTATTTTAAGGAGATAAATATAAACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGGTTCTATCGGATTTGTa > 1:1956369/1‑148 (MQ=255) | TTAAGTGGACTTCTAGTTTGCCACAAAAAGACTGGGAAGTGACTTCTTATGCACCTCTTAACCAAATTCATACGCCGCCAATTTTAGTTCTAATCGAAAAAAGAAAATAAATTTACTTGAATAGTTATGAATCTTATGTATTCTTTTATCTCTTGTTTTTTCCAAAAAAAAGAGTAAAATAGAGAAATGCTTATTTTTTTAAGTAAAAAAATATTTTAAAGAGGTAAATATACACATGCAAGGAGTTCTTCTCGCGCTTGTTCCAATGTTTGCTTGGGGTTCTATCGGATTTGTA > CP043523/2058457‑2058751 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |