New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | CP043523 | = 1704678 | 599 (1.130) | 533 (1.000) | 229/294 | 0.1 | 47.4% | intergenic (+30/+79) | FTN78_chr1737/FTN78_chr1738 | hypothetical protein/Ribonucleotide reductase of class III (anaerobic), activating protein |
? | CP043523 | 1704695 = | 583 (1.100) | intergenic (+47/+62) | FTN78_chr1737/FTN78_chr1738 | hypothetical protein/Ribonucleotide reductase of class III (anaerobic), activating protein |
Only 100 of 533 total aligned reads displayed.
AAAGAAAGTCAAAATTATTTAAAAGGAAAAAAGAAACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP043523/1704532‑1704678 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGTTTTTCCCAAATGACAACTTGTCCTTGTTTT > CP043523/1704695‑1704841 AAAGAAAGTCAAAATTATTTAAAAGGAAAAAAGAGACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTT > 2:140492/1‑148 AAAGTCAAAATTATTTAAAAGGAAAAAAGAGACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTTCAGA < 1:3521190/148‑1 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TCAAAATTATTTAAAAGGAAAAAAGAGACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTTCAGAAGAT < 1:4710950/148‑1 AAAATTATTTAAAAGGAAAAAAGAGACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTTCAGAAGATAG < 1:271430/148‑1 AAATTATTTAAAAGGAAAAAAGAGACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTTCAGAAGATAGC > 2:1142559/1‑148 ATTATTTAAAAGGAAAAAAGAGACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTTCAGAAGATAGCCG > 2:2372468/1‑148 TATTTAAAAGGAAAAAAGAGACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTTCAGAAGATAGCCGTT < 1:876945/148‑1 ATTTAAAAGGAAAAAAGAAACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTTCAGAAGATAGCCGTTG > 1:1720527/1‑148 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ATTTGTCAGTGCTTATTTTTTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGTTTTTCCCAAAT > 1:450824/1‑148 TTTGTCAGTGCTTATTTTTTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGTTTTTCCCAAATG > 1:2743017/1‑148 TGTCAGTGCTTATTTTTTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGTTTTTCCCAAATGAC > 1:1806684/1‑148 TCAGTGCTTATTTTTTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAACTTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGTTTTTCCCACATGACAA > 2:3468177/1‑148 CAGTGCTTATTTTTTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGTTTTTCCCAAATGACAAC < 1:4398887/148‑1 CAGTGCTTATTTTTTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGTTTTTCCCAAATGACAAC > 1:3248656/1‑148 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGTTTTTCCCAAATGACAACTTGTCCTTGTTTT > CP043523/1704695‑1704841 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |