New junction evidence | |||||||||||
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? | CP043523 | 1704695 = | 583 (1.100) | intergenic (+47/+62) | FTN78_chr1737/FTN78_chr1738 | hypothetical protein/Ribonucleotide reductase of class III (anaerobic), activating protein |
Only 100 of 1140 total aligned reads displayed.
CAAAGAAAGTCAAAATTATTTAAAAGGAAAAAAGAAACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGTTTTTCCCAAATGAC > CP043523/1704531‑1704825 | aaagaaagTCAAAATTATTTAAAAGGAAAAAAGAAACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTa < 2:4570503/148‑1 (MQ=255) aagaaagTCAAAATTATTTAAAAGGAAAAAAGAAACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAg > 2:464798/1‑148 (MQ=255) gaaagTCAAAATTATTTAAAAGGAAAAAAGAGACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTtcag > 1:689985‑M1/1‑144 (MQ=255) 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tcCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTtcagaagatagccgttggcactttagcgcttacggatatac < 2:514967‑M1/148‑42 (MQ=255) tctAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAgcgc > 2:3708921/1‑148 (MQ=255) tAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCtt > 1:4708225/1‑148 (MQ=255) aaTCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTtcagaagatagccgttggcactttagcgcttacggatatactcaaatgtc > 1:378934‑M1/1‑98 (MQ=255) aaTCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTtcagaagatagccgttggcactttagcgcttacggatatactcaaatgtc < 1:7704‑M1/148‑51 (MQ=255) 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gCATTTGTCAGTGCTTATTTTTtcagaagatagccgttggcactttagcgcttacggatatactcaaatgtccatcagtaacttttaaattaatttttctttatgaatttgttcaaaagttttttcaccatcattgagtttttcccaa > 1:4196591‑M1/1‑22 (MQ=255) aTTTGTCAGTGCTTATTTTTtcagaagatagccgttggcactttagcgcttacggatatactcaaatgtccatcagtaacttttaaattaatttttctttatgaatttgttcaaaagttttttcaccatcattgagtttttcccaaat > 1:889611‑M1/1‑20 (MQ=255) aTTTGTCAGTGCTTATTTTTtcagaagatagccgttggcactttagcgcttacggatatactcaaatgtccatcagtaacttttaaattaatttttctttatgaatttgttcaaaagttttttcaccatcattgagtttttcccaaat > 1:450824‑M1/1‑20 (MQ=255) ttGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTg > 1:2126614/1‑148 (MQ=255) gTCGGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTTTCGGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAg < 2:3939157/148‑1 (MQ=255) 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ttttcagaagatagccgttggcactttagcgcttacggatatactcaaatgtccatcagtaacttttaaattaatttttctttatgaatttgttcaaaagttttttcaccatcattgagtttttcccaaatgacaacttgtccttgtt > 2:639848‑M1/1‑3 (MQ=255) ttAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGTTTTTCCCAAATGa < 1:1735339/148‑1 (MQ=255) | CAAAGAAAGTCAAAATTATTTAAAAGGAAAAAAGAAACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGTTTTTCCCAAATGAC > CP043523/1704531‑1704825 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |