New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP043523 | = 1704678 | 599 (1.130) | 533 (1.000) | 229/294 | 0.1 | 47.4% | intergenic (+30/+79) | FTN78_chr1737/FTN78_chr1738 | hypothetical protein/Ribonucleotide reductase of class III (anaerobic), activating protein |
? | CP043523 | 1704695 = | 583 (1.100) | intergenic (+47/+62) | FTN78_chr1737/FTN78_chr1738 | hypothetical protein/Ribonucleotide reductase of class III (anaerobic), activating protein |
Only 100 of 1122 total aligned reads displayed.
ATTTAAAAGGAAAAAAGAAACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGTTTTTCCCAAATGACAACTTGTCCTTGTTTTC > CP043523/1704548‑1704842 | attTAAAAGGAAAAAAGAAACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGt < 2:1533629/148‑1 (MQ=255) tttAAAAGGAAAAAAGAAACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTc < 2:2284561/148‑1 (MQ=255) tttAAAAGGAAAAAAGAAACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTc > 1:3385063/1‑148 (MQ=255) ttAAAAGGAAAAAAGAAACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCa > 2:4142391/1‑148 (MQ=255) agaaagtcaaaattatttaaaaggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCa > 2:1179767‑M2/146‑148 (MQ=255) tAAAAGGAAAAAAGAAACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCag > 1:3757392/1‑148 (MQ=255) aagtcaaaattatttaaaaggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCagaa > 2:2768042‑M2/143‑148 (MQ=255) aaaGGAAAAAAGAAACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCagaa < 1:3834668/148‑1 (MQ=255) aaGGAAAAAAGAAACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCagaag > 1:3608121/1‑148 (MQ=255) gtcaaaattatttaaaaggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCagaaga < 1:1416179‑M2/8‑1 (MQ=255) aGGAAAAAAGAAACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCagaaga > 1:54143/1‑148 (MQ=255) aGGAAAAAAGAAACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCagaaga > 2:1830876/1‑148 (MQ=255) aGGAAAAAAGAAACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCagaaga < 1:2122187/148‑1 (MQ=255) ggAAAAAAGAAACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGAt < 2:383698/148‑1 (MQ=255) aaaattatttaaaaggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAg > 1:3218028‑M2/138‑148 (MQ=255) aaattatttaaaaggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGc < 2:4434586‑M2/12‑1 (MQ=255) ttatttaaaaggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGt < 1:882557‑M2/15‑1 (MQ=255) tatttaaaaggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGtt < 2:2113501‑M2/16‑1 (MQ=255) aGAAACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGtt < 1:4631901/148‑1 (MQ=255) aGAAACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGtt > 1:992321/1‑148 (MQ=255) atttaaaaggaaaaaagaaacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTg > 2:2405633‑M2/132‑148 (MQ=255) ttaaaaggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGc > 1:4437678‑M2/130‑148 (MQ=255) aTCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACt > 2:2634005/1‑148 (MQ=255) tctcCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACtt > 2:325707/1‑148 (MQ=255) tctcCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACtt > 1:3996534/1‑148 (MQ=255) tcCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTa > 1:1348861/1‑148 (MQ=255) aaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAgc > 2:630907‑M2/122‑148 (MQ=255) aaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttGCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCt > 2:4200937‑M2/119‑148 (MQ=255) tagaaTCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCtt < 2:2698562/145‑1 (MQ=255) tAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCtt > 1:4708225/1‑148 (MQ=255) atctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGata > 2:806687‑M2/111‑148 (MQ=255) gcgcTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGatat < 1:4188707/148‑1 (MQ=255) ctccctctaaactcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGAtata < 1:4138287‑M2/40‑1 (MQ=255) ctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGAtata > 2:1359768‑M2/109‑148 (MQ=255) ctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGAtata > 2:163261‑M2/109‑148 (MQ=255) cTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACt < 1:3700982/148‑1 (MQ=255) ctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCa > 2:46936‑M2/105‑148 (MQ=255) ctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCa < 1:1744530‑M2/44‑1 (MQ=255) aaGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCaaa < 1:1692153/148‑1 (MQ=255) aTTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGt < 2:3557286/148‑1 (MQ=255) cggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCAt < 1:3176470‑M2/53‑1 (MQ=255) aaaaTTACTGACGACGAGCCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATc < 1:4501696/148‑1 (MQ=255) gcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCa > 2:695824‑M2/94‑148 (MQ=255) gctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGt < 1:620357‑M2/57‑1 (MQ=255) ttACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTa < 1:1203937/148‑1 (MQ=255) ctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTa > 1:274011‑M2/91‑148 (MQ=255) tACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTaa < 2:2346804/148‑1 (MQ=255) tttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTaa < 1:2774713‑M2/66‑1 (MQ=255) 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cgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGTTTTTCCCa > 2:4552623‑M2/24‑148 (MQ=255) gcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGTTTTTCCCaa < 2:2177193‑M2/126‑1 (MQ=255) tttAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGTTTTTCCCAAATg > 1:1086228/1‑148 (MQ=255) ttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGTTTTTCCCAAATGa > 2:1777383‑M2/19‑148 (MQ=255) tAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGTTTTTCCCAAATGAc > 2:3918783/1‑148 (MQ=255) 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tGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGTTTTTCCCAAATGACAACTTGTCCTTGttt > 2:3354162/1‑148 (MQ=255) gTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGTTTTTCCCAAATGACAACTTGTCCTTGtttt > 1:2274550/1‑148 (MQ=255) | ATTTAAAAGGAAAAAAGAAACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGTTTTTCCCAAATGACAACTTGTCCTTGTTTTC > CP043523/1704548‑1704842 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |