New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 617 total aligned reads displayed.
ATCAACCCAATGCCAAAGACTTCTAGTTCTTGAAAATAGGTTTAAAAAGTTGTATCATAATAAAAGTGGGTAACCACTTTCATTTTGTGCCGAGTTAGCTCAGTCGGTAGAGCACTTCACTCGTAACGAAGGGGTCACAGGTTCGATTCCTGCACTCGGCATAGATAAAAAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP043523/1823705‑1823877 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTAATTATATTTTTATTAGCATTGATGTATCTTTATGCCCATTAACTTTGCCACTACTTTATTATCGATACCTTAACTTAGTAGTACACTATCACAAGTT > CP043523/1897161‑1897307 TCAACCCAATGCCAAAGACTTCTAGTTCTTGAAAATAGGTTTAAAAAGTTGTATCATAATAAAAGTGGGTAACCACTTTCATTTTGTGCCGAGTTAGCTCAGTCGGTAGAGCACTTCACTCGTAACGAAGGGGTCACAGGTTCGATTC < 2:3059273/148‑1 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1:4514290/148‑1 AAAACCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTAATTATATTTTTATTAGCATTGATGTATCTTTATGCCCATTAACTTTGCCACTACTTTATTATCGATACCTTAACTTAGTAGTACACTATCAaa > 2:3143313/1‑146 AAAACCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTAATTATATTTTTATTAGCATTGATGTATCTTTATGCCCATTAACTTTGCCACTACTTTATTATCGATACCTTAACTTAGTAGTACACTATCACA < 1:1613768/148‑1 ACCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTAATTATATTTTTATTAGCATTGATGTATCTTTATGCCCATTAACTTTGCCACTACTTTATTATCGATACCTTAACTTAGTAGTACACTATCACAAGT < 1:1392476/148‑1 ACCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTAATTATATTTTTATTAGCATTGATGTATCTTTATGCCCATTAACTTTGCCACTACTTTATTATCGATACCTTAACTTAGTAGTACACTATCACAAGT > 2:4565100/1‑148 ATCAACCCAATGCCAAAGACTTCTAGTTCTTGAAAATAGGTTTAAAAAGTTGTATCATAATAAAAGTGGGTAACCACTTTCATTTTGTGCCGAGTTAGCTCAGTCGGTAGAGCACTTCACTCGTAACGAAGGGGTCACAGGTTCGATTCCTGCACTCGGCATAGATAAAAAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP043523/1823705‑1823877 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTAATTATATTTTTATTAGCATTGATGTATCTTTATGCCCATTAACTTTGCCACTACTTTATTATCGATACCTTAACTTAGTAGTACACTATCACAAGTT > CP043523/1897161‑1897307 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |