New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP043523 | = 1823877 | 1 (0.000) | 448 (1.030) | 190/242 | 0.1 | 99.9% | intergenic (+12/+1047) | FTN78_chr1865/FTN78_chr1866 | tRNA‑Thr/hypothetical protein |
? | CP043523 | 1897161 = | 0 (0.000) | intergenic (‑295/+481) | FTN78_chr1945/FTN78_chr1946 | hypothetical protein/Collagen adhesion protein |
Only 100 of 539 total aligned reads displayed.
AACTTGAAATGCCCCCAATTTGCCCCATTTTATTTTTCACTTTAAGAGCTTTTCTATAGTGAACACTTTGAGAGCTTTATAGAGCCTGTATTTAACTTTGAAAACTATCTAAACAATCCTGCACTCGGCATAGATAAAAAACCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTAATTATATTTTTATTAGCATTGATGTATCTTTATGCCCATTAACTTTGCCACTACTTTATTATCGATACCTTAACTTAGTAGTACACTATCACAAGTTT > CP043523/1897019‑1897308 | gaaaataggtttaaaaagttgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTa < 1:1718217‑M2/6‑1 (MQ=255) taggtttaaaaagttgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGtt > 2:749052‑M2/138‑148 (MQ=255) taggtttaaaaagttgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGtt < 2:2698527‑M2/11‑1 (MQ=255) aggtttaaaaagttgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTg < 2:2964194‑M2/12‑1 (MQ=255) ttaaaaagttgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGatat < 2:3564145‑M2/16‑1 (MQ=255) aaaaagttgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATAc < 2:1178302‑M2/18‑1 (MQ=255) aaaagttgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACa > 1:4308110‑M2/130‑148 (MQ=255) aaaagttgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcacagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACa > 1:1523796‑M2/130‑148 (MQ=255) aaagttgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACaa > 2:4441818‑M2/129‑148 (MQ=255) aagttgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAg < 2:3095948‑M2/21‑1 (MQ=255) aagttgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAg > 1:2142054‑M2/128‑148 (MQ=255) tgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGttt > 1:2022114‑M2/124‑148 (MQ=255) gtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGtttt > 1:3632107‑M2/123‑148 (MQ=255) atcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGtttttt < 2:4677253‑M2/28‑1 (MQ=255) tcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTtta > 1:1756005‑M2/120‑148 (MQ=255) tcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTAGTATCGTTGATATACAAGGTTTTtta < 2:4581416‑M2/29‑1 (MQ=255) taataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTCTCGTTGATATACAAGGTTTTttatta < 2:3356089‑M2/32‑1 (MQ=255) aataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTtattat < 2:2335986‑M2/33‑1 (MQ=255) aaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTAtttt > 1:3463082‑M2/113‑148 (MQ=255) aaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTa > 1:2441042‑M2/112‑148 (MQ=255) tgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCat < 2:1043268‑M2/41‑1 (MQ=255) tgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCat > 2:1106157‑M2/108‑148 (MQ=255) tgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCat > 2:4329337‑M2/108‑148 (MQ=255) gggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCata > 1:2487904‑M2/107‑148 (MQ=255) gggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCata < 1:60290‑M2/42‑1 (MQ=255) ggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCatat < 2:3649491‑M2/43‑1 (MQ=255) aaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCt > 1:741054‑M2/103‑148 (MQ=255) ccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCttt < 2:4035068‑M2/48‑1 (MQ=255) cactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCtttt < 1:3410065‑M2/49‑1 (MQ=255) ctttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTaa < 2:1644239‑M2/51‑1 (MQ=255) ctttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTaa > 1:520344‑M2/98‑148 (MQ=255) ctttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTaa < 1:2647914‑M2/51‑1 (MQ=255) ctttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTaa > 1:2305159‑M2/98‑148 (MQ=255) ttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTAAtt > 1:3702937‑M2/96‑148 (MQ=255) tcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTAATta > 1:4656256‑M2/95‑148 (MQ=255) tcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTAATta > 2:2933572‑M2/95‑148 (MQ=255) attttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTAATtata < 2:2732866‑M2/56‑1 (MQ=255) ttttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTAATTatat < 2:2817659‑M2/57‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |