| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP043523 | = 1823877 | 1 (0.000) | 448 (1.030) | 190/242 | 0.1 | 99.9% | intergenic (+12/+1047) | FTN78_chr1865/FTN78_chr1866 | tRNA‑Thr/hypothetical protein |
| ? | CP043523 | 1897161 = | 0 (0.000) | intergenic (‑295/+481) | FTN78_chr1945/FTN78_chr1946 | hypothetical protein/Collagen adhesion protein | |||||
Only 100 of 544 total aligned reads displayed.
GTTCTTGAAAATAGGTTTAAAAAGTTGTATCATAATAAAAGTGGGTAACCACTTTCATTTTGTGCCGAGTTAGCTCAGTCGGTAGAGCACTTCACTCGTAACGAAGGGGTCACAGGTTCGATTCCTGCACTCGGCATAGATAAAAAACTTTATATCGTTGGTATATAAGGTTTTTTTGTTTATCTTTTTTTATTTACCCCTCTTTTTGCCCCATTATTTATTGTTTTAATTAATCTCTAAGAATTAATTATATTAAATTTCATTTAATTAACAAATAAATTACATTTCAAGCT > CP043523/1823730‑1824022 | gTTCTTGAAAATAGGTTTAAAAAGTTGTATCATAATAAAAGTGGGTAACCACTTTCATTTTGTGCCGAGTTAGCTCAGTCGGTAGAGCACTTCACTCGTAACGAAGGGGTCACAGGTTCGATTCCTGCACTCGGCATAGATAAAAAAC > 1:80571‑M1/1‑148 (MQ=255)gTTCTTGAAAATAGGTTTAAAAAGTTGTATCATAATAAAAGTGGGTAACCACTTTCATTTTGTGCCGAGTTAGCTCAGTCGGTAGAGCACTTCACTCGTAACGAAGGGGTCACAGGTTCGATTCCTGCACTCGGCATAGATAAAAAAC < 2:3683510‑M1/148‑1 (MQ=255) tCTTGAAAATAGGTTTAAAAAGTTGTATCATAATAAAAGTGGGTAACCACTTTCATTTTGTGCCGAGTTAGCTCAGTCGGTAGAGCACTTCACTCGTAACGAAGGGGTCACAGGTTCGATTCCTGCACTCGGCATAGATAAAAAACct > 1:3480970‑M1/1‑146 (MQ=255) 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aTCATAATAAAAGTGGGTAACCACTTTCATTTTGTGCCGAGTTAGCTCAGTCGGTAGAGCACTTCACTCGTAACGAAGGGGTCACAGGTTCGATTCCTGCACTCGGCATAGATAAAAAACcttgtatcgttgatatacaaggtttttt > 1:382229‑M1/1‑120 (MQ=255) tCATAATAAAAGTGGGTAACCACTTTCATTTTGTGCCGAGTTAGCTCAGTCGGTAGAGCACTTCACTCGTAACGAAGGGGTCACAGGTTCGATTCCTGCACTCGGCATAGATAAAAAACctagtatcgttgatatacaaggtttttta < 2:4580471‑M1/148‑30 (MQ=255) cATAATAAAAGTGGGTAACCACTTTCATTTTGTGCCGAGTTAGCTCAGTCGGTAGAGCACTTCACTCGTAACGAAGGGGTCACAGGTTCGATTCCTGCACTCGGCATAGATAAAAAACcttgtatcgttgatatacaaggttttttat < 1:3120534‑M1/148‑31 (MQ=255) ataataAAAGTGGGTAACCACTTTCATTTTGTGCCGAGTTAGCTCAGTCGGTAGAGCACTTCACTCGTAACGAAGGGGTCACAGGTTCGATTCCTGCACTCGGCATAGATAAAAAACcttgtatcgttgatatacaaggttttttatt < 1:3413246‑M1/148‑32 (MQ=255) ataataAAAGTGGGTAACCACTTTCATTTTGTGCCGAGTTAGCTCAGTCGGTAGAGCACTTCACTCGTAACGAAGGGGTCACAGGTTCGATTCCTGCACTCGGCATAGATAAAAAACcttgtatcgttgatatacaaggttttttatt > 2:1621941‑M1/1‑117 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |