| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP043523 | 1867496 = | 0 (0.000) | 455 (0.880) +GTGA |
202/286 | 0.9 | 61.9% | intergenic (‑292/‑29) | FTN78_chr1913/FTN78_chr1914 | hypothetical protein/Site‑specific recombinase, DNA invertase Pin related protein |
| ? | CP043523 | 1958190 = | 576 (1.080) | intergenic (‑52/‑59) | FTN78_chr2011/FTN78_chr2012 | hypothetical protein/Mobile element protein | |||||
Only 100 of 474 total aligned reads displayed.
CTGTAGTCCCCGTAAATTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTCTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP043523/1867642‑1867496‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACCCAGCTGTCTAAAGAAT > CP043523/1958190‑1958336 |||| CTGTAGTTCCAGTAAACTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTG > 1:1700197/1‑148 TGTAGTTCCAGTAAACTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGT > 2:1402807/1‑148 TGTAGTTCCAGTAAACTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGT < 2:2965272/148‑1 agttccaGTAAACTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAG > 2:2470789/8‑148 agttccaGTAAACTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAG > 1:2466440/8‑148 ttccaGTAAACTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTG < 1:891712/143‑1 ttccaGTAAACTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTG > 1:3485776/6‑148 tccaGTAAACTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGA < 1:4211493/144‑1 ccaGTAAACTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGAT < 1:179743/145‑1 caGTAAACTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATG < 1:3413879/146‑1 aGTAAACTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGT < 2:1528809/147‑1 GTAAACTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTT < 2:1874294/148‑1 atcTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCATTTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATC < 2:3855516/145‑1 acTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATATTATCC < 1:4394606/146‑1 cTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCT < 1:3239703/147‑1 TCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAA < 1:2842978/148‑1 TTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATC > 2:3155363/1‑148 TGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCT > 2:397211/1‑148 TGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCT > 2:3684430/1‑148 TGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCT > 2:2859644/1‑148 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2:158681/148‑1 GAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTTTTTTTTTTTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGG > 2:538557/1‑148 AACTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGA > 2:2523807/1‑148 CTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACA > 1:3370102/1‑148 CTTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACA < 2:4113640/148‑1 TTCAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAA < 1:789316/148‑1 CAATTTGAGATTCTAATTTTTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAA < 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2:3312771/148‑1 ATAACCATAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACC > 2:4178523/1‑148 TAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACCC < 1:3941763/148‑1 TAACCCTAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTATGGTCAATCCGTCACCC > 1:4488233/1‑148 TAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACCCAGCTGT > 2:2544283/1‑148 TAAGTTGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACCCAGCTGT < 2:1052818/148‑1 TGTGAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACCCAGCTGTCTAAA < 1:444747/148‑1 GAGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTGTTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACCCAGCTGTCTAAAGAA < 2:2012914/148‑1 AGTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACCCAGCTGTCTAAAGAAT < 1:4344045/148‑1 |||| CTGTAGTCCCCGTAAATTTTTCTTGGAAAACTTCTTCTGCTCCTGCTTCTTTCAGAACTTCAATTTGAGATTCTAATTTCTGTTCAAAAGTACTGACACGTGCATACCCAATTTTCATATTTTGACCTCTATTAATAACCCTAAGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP043523/1867642‑1867496‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGATGTTATCCTTAAATCTTAGAGTCACTATTGTATAATTTAGACAAAGGACAAAAACATGCAAAAACGCTACTCAAAAGAATTTAAAGAAACCCTTATCGCCTTCTATCATTCTGGTCAATCCGTCACCCAGCTGTCTAAAGAAT > CP043523/1958190‑1958336 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |