New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP043523 | 1867496 = | 0 (0.000) | 455 (0.880) +GTGA |
202/286 | 0.9 | 61.9% | intergenic (‑292/‑29) | FTN78_chr1913/FTN78_chr1914 | hypothetical protein/Site‑specific recombinase, DNA invertase Pin related protein |
? | CP043523 | 1958190 = | 576 (1.080) | intergenic (‑52/‑59) | FTN78_chr2011/FTN78_chr2012 | hypothetical protein/Mobile element protein |
Only 100 of 471 total aligned reads displayed.
CACAAACATCTTTTGTAAAAAGCCTTTTTTCTGTTCTTTCAACAAATCTAACTTACGTTGATGAAGAGAGATAATAAAGAGCTCAAAACTTAACAGTTGTGAGCTCTTTTTTTGTGTGTTAAAATTAAAGGAGAAAGAACGGCTCGTAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAGAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAATTTACGGGGACTACAGT > CP043523/1867349‑1867643 | tttagacagctgggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcaca < 1:444747‑M1/1‑1 (MQ=255) acagctgggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTa < 1:169283‑M1/6‑1 (MQ=255) cagctgggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAg > 2:2965937‑M1/142‑148 (MQ=255) gggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGtta > 2:1296056‑M1/137‑148 (MQ=255) gggtgacggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGtta < 1:3940862‑M1/12‑1 (MQ=255) ggtgtcggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGttat > 2:2351439‑M1/136‑148 (MQ=255) gacggattgaccagaatgatagatggcgataagggtttttttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattacacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacGACTTAGGGTTATTaa > 2:2934977‑M1/133‑148 (MQ=255) acggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAAt > 1:1470874‑M1/132‑148 (MQ=255) ggattgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATag > 1:2753762‑M1/130‑148 (MQ=255) attgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATagag < 2:4633098‑M1/21‑1 (MQ=255) ttgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAgg > 1:2691891‑M1/127‑148 (MQ=255) tgaccagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGt < 2:1534219‑M1/23‑1 (MQ=255) cagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAAt > 1:1226501‑M1/122‑138 (MQ=255) cagaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCaaa < 2:426829‑M1/27‑1 (MQ=255) gaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAat > 1:3088904‑M1/120‑148 (MQ=255) gaatgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAat < 2:3534369‑M1/29‑1 (MQ=255) tgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATg < 1:3596000‑M1/32‑1 (MQ=255) tgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATg > 2:2113741‑M1/117‑148 (MQ=255) tgatagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgttgttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATg > 1:3645726‑M1/117‑148 (MQ=255) atagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGaa < 1:4043009‑M1/34‑1 (MQ=255) atagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtcactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGaa < 1:519401‑M1/34‑1 (MQ=255) tagaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGaaa > 2:3785738‑M1/114‑148 (MQ=255) agaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGaaaa < 1:1015729‑M1/36‑1 (MQ=255) agaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGaaaa < 2:3313408‑M1/36‑1 (MQ=255) gaaggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAAt < 1:186407‑M1/37‑1 (MQ=255) aggcgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTg > 1:1933118‑M1/110‑148 (MQ=255) cgataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGt < 1:4672853‑M1/42‑1 (MQ=255) ataagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTAt < 1:2329791‑M1/44‑1 (MQ=255) taagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATg < 2:4192118‑M1/45‑1 (MQ=255) aagggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGc > 1:2658396‑M1/103‑148 (MQ=255) agggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCa > 1:2846943‑M1/102‑148 (MQ=255) gggtttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCAc < 1:4026604‑M1/48‑1 (MQ=255) tttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACgtg > 2:1158777‑M1/98‑148 (MQ=255) tttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACgtg > 2:3503853‑M1/98‑148 (MQ=255) tttctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACgtg > 2:4063688‑M1/98‑148 (MQ=255) tctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTc > 1:4570427‑M1/96‑148 (MQ=255) tctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTc < 1:4496024‑M1/53‑1 (MQ=255) ctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCa < 2:1706210‑M1/54‑1 (MQ=255) ctttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacaacactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCa > 1:3706937‑M1/95‑148 (MQ=255) tttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAg < 2:669649‑M1/55‑1 (MQ=255) ttaaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGt > 1:1529525‑M1/93‑148 (MQ=255) taaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTa < 1:226411‑M1/57‑1 (MQ=255) taaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTa > 2:1472301‑M1/92‑148 (MQ=255) aaattcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTAc > 2:4458393‑M1/91‑148 (MQ=255) ttcttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACttt < 1:2592153‑M1/61‑1 (MQ=255) cttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTg > 1:2891778‑M1/86‑148 (MQ=255) ttttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGa < 2:781175‑M1/64‑1 (MQ=255) tttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGaa < 2:1967391‑M1/65‑1 (MQ=255) tttgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGaa < 1:2480876‑M1/65‑1 (MQ=255) tgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACa > 2:3118840‑M1/82‑148 (MQ=255) tgagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACa < 1:319995‑M1/67‑1 (MQ=255) gagtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAAcaa > 2:2849258‑M1/81‑147 (MQ=255) gtagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGaacaaaa > 1:1091795‑M1/79‑145 (MQ=255) tagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTgaacaaaaa < 1:2005215‑M1/71‑5 (MQ=255) tagcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTgaacaaaaa < 2:4236877‑M1/71‑5 (MQ=255) agcgtttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAAt < 2:2565143‑M1/72‑1 (MQ=255) tttttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGa < 2:939950‑M1/76‑1 (MQ=255) tttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAAt < 1:330255‑M1/78‑1 (MQ=255) ttgcatgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAAtc > 1:3534369‑M1/70‑148 (MQ=255) atgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCaa < 2:907698‑M1/83‑1 (MQ=255) tgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCaaa > 1:2503694‑M1/65‑148 (MQ=255) tgtttttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCaaa < 1:776932‑M1/84‑1 (MQ=255) tttttttctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTg < 2:2248454‑M1/87‑1 (MQ=255) ttgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGaa < 2:2539715‑M1/89‑1 (MQ=255) tgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAg < 2:4113640‑M1/90‑1 (MQ=255) tgtcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAg > 1:3370102‑M1/59‑148 (MQ=255) tcctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCGCGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGtt > 1:2079749‑M1/57‑148 (MQ=255) cctttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTAAAAAAAAAAAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTc > 2:538557‑M1/56‑148 (MQ=255) ctttgtctaaattatacaatagtgactctaagacttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCt > 1:804412‑M1/55‑148 (MQ=255) ttgtctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGa > 1:1987227‑M1/53‑148 (MQ=255) ctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAaaga > 1:1400150‑M1/49‑148 (MQ=255) ctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAaaga > 1:435785‑M1/49‑148 (MQ=255) ctaaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAaaga < 2:1867425‑M1/100‑1 (MQ=255) aaattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAaagaag < 1:36690‑M1/102‑1 (MQ=255) aattatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGc > 1:2247739‑M1/46‑148 (MQ=255) attatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCa < 2:1668114‑M1/104‑1 (MQ=255) tatacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAgg > 1:2801411‑M1/43‑148 (MQ=255) tacaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAg < 1:2461655‑M1/108‑1 (MQ=255) acaatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGCTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATGGAAGTTCTGAAAGAAGCGGGAGc < 2:2763044‑M1/109‑1 (MQ=255) aatagtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCag > 1:983704‑M1/38‑148 (MQ=255) agtgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCagaag > 1:601900‑M1/35‑148 (MQ=255) tgactctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAgaagaa < 2:4573394‑M1/116‑1 (MQ=255) actctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGt > 1:668506‑M1/31‑148 (MQ=255) ctctaagatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGtt > 1:4151235‑M1/30‑148 (MQ=255) agatttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCa > 2:3684432‑M1/25‑148 (MQ=255) atttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAg < 2:3998485‑M1/126‑1 (MQ=255) ttaaggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGaa > 2:2480876‑M1/21‑148 (MQ=255) ttaaggataacatcactcacAACTTAGGGCTAGTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGTACAACAATTAGAATCTCAAATTAAAGTTCTGCAAGACGCAGGAGCAGAAGAAGTTCTCCAAGaa < 2:3200921‑M1/128‑1 (MQ=255) aggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAgaaaag > 1:3400210‑M1/18‑147 (MQ=255) aggataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAgaaaag < 1:3239703‑M1/131‑2 (MQ=255) ggataatatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAagaaaagt < 1:4394606‑M1/132‑3 (MQ=255) gataacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAAATGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCaagaaaagat < 2:3855516‑M1/133‑4 (MQ=255) aacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTAc < 1:3148976‑M1/136‑1 (MQ=255) aacatcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTAc > 2:3931163‑M1/13‑148 (MQ=255) atcactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTttactgg < 1:3485739‑M1/139‑4 (MQ=255) cactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAgtttactggaa < 1:891712‑M1/141‑6 (MQ=255) cactcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAgtttactggaa < 1:1786157‑M1/141‑6 (MQ=255) actcacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAagtttactggaac > 2:1371066‑M1/7‑142 (MQ=255) cacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTAc > 2:3662820‑M1/4‑148 (MQ=255) cacAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAAAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAGTTTACTGGAACTAc > 1:387827‑M1/4‑148 (MQ=255) | CACAAACATCTTTTGTAAAAAGCCTTTTTTCTGTTCTTTCAACAAATCTAACTTACGTTGATGAAGAGAGATAATAAAGAGCTCAAAACTTAACAGTTGTGAGCTCTTTTTTTGTGTGTTAAAATTAAAGGAGAAAGAACGGCTCGTAACTTAGGGTTATTAATAGAGGTCAAAATATGAAAATTGGGTATGCACGTGTCAGTACTTTTGAACAGAAATTAGAATCTCAAATTGAAGTTCTGAAAGAAGCAGGAGCAGAAGAAGTTTTCCAAGAAAAATTTACGGGGACTACAGT > CP043523/1867349‑1867643 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |