| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 498 total aligned reads displayed.
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> 1:562068/1‑148 CTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTA > 1:1909177/1‑148 CTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATG < 1:258575/148‑1 TACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCA < 2:595415/148‑1 ACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAA < 1:2376577/148‑1 GAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATG < 1:796166/148‑1 GTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTT < 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> 1:2768677/1‑148 CCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCT > 2:4188391/1‑148 CAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTA < 1:1597839/148‑1 GTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAA < 2:4674856/148‑1 TCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAAT > 1:707372/1‑148 TTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCT > 1:1515504/1‑148 TCGCCAAGCTCTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCTA < 2:1139303/148‑1 CGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCTAC > 2:1251039/1‑148 GCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCTACAAAGGG > 2:4342318/1‑148 ACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAATGAGTGAGTGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCCTTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCTACAAAGGGAC > 2:2882308/1‑148 |||||||| GTGAAACACTTAAAGCTAAGCACCAATTGGCTCAAAGTTTATTTCCTAATTTCCTAGAATATTCTCGCTTTGTCCGCCGTTGTAATGCCCTCTTACCGAGTATCCAAGTCATTCGCCAAGCACTCGTCTTTAAAGAGGTTGAAGGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP043523/1895050‑1895196‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGAGTGTATCCATTATTGACAGCTTCCCCATTCCTTTGTGTCAGTCGATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCTACAAAGGGAC > CP043523/1895197‑1895310 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |