| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP043523 | = 2060261 | 624 (1.170) | coding (700/1308 nt) | FTN78_chr2133 | D‑alanyl‑D‑alanine carboxypeptidase | |||||
Only 100 of 654 total aligned reads displayed.
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< 1:2020422/148‑1 ATTCGGGTTAACTAATACCAATCAAATGCTTAGTGGTTTTTCTACTTCAAGAACTGGTGTGGATGGCTTGAAAACAGGTTCAACAAGTTTTCAAATTGACTGTTTTGCTGGAACAACAAATCAAAACGGCTTTAGAATCATTACGGTT > 1:1039572/1‑148 ATTCGGGTTAACTAATACCAATCAAATGCTTAGTGGTTTTTCTACTTCAAGAACTGGTGTGGATGGCTTGAAAACAGGTTCAACAAGTTTTCAAATTGACTGTTTTGCTGGAACAACAAATCAAAACGGCTTTAGAATCATTACGGTT < 2:4260194/148‑1 TTCGGGTTAACTAATACCAATCAAATGCTTAGTGGTTTTTCTACTTCAAGAACTGGTGTGGATGGCTTGAAAACAGGTTCAACAAGTTTTCAAATTGACTGTTTTGCTGGAACAACAAATCAAAACGGCTTTAGAATCATTACGGTTG > 1:607267/1‑148 CGGGTTAACTAATACCAATCAAATGCTTAGTGGTTTTTCTACTTCAAGAACTGGTGTGGATGGCTTGAAAACAGGTTCAACAAGTTTTCAAATTGACTGTTTTGCTGGAACAACAAATCAAAACGGCTTTAGAATCATTACGGTTGTT < 1:3826187/148‑1 GGTTAACTAATACCAATCAAATGCTTAGTGGTTTTTCTACTTCAAGAACTGGTGTGGATGGCTTGAAAACAGGTTCAACAAGTTTTCAAATTGACTGTTTTGCTGGAACAACAAATCAAAACGGCTTTAGAATCATTACGGTTGTTTT < 1:3084531/148‑1 GGTTAACTAATACCAATCAAATGCTTAGTGGTTTTTCTACTTCAAGAACTGGTGTGGATGGCTTGAAAACAGGTTCAACAAGTTTTCAAATTGACTGTTTTGCTGGAACAACAAATCAAAACGGCTTTAGAATCATTACGGTTGTTTT < 1:1538040/148‑1 GGTTAACTAATACCAATCAAATGCTTAGTGGTTTTTCTACTTCAAGAACTGGTGTGGATGGCTTGAAAACAGGTTCAACAAGTTTTCAAATTGACTGTTTTGCTGGAACAACAAATCAAAACGGCTTTAGAATCATTACGGTTGTTTT < 2:2775118/148‑1 TTAACTAATACCAATCAAATGCTTAGTGGTTTTTCTACTTCAAGAACTGGTGTAGATGGCTTGAAAACAGGTTCAACAAGTTTTCAAATTGACTGTTTTGCTGGAACAACAAATCAAAACGGTTTTAGAATCATTACGGTTGTTTTAG > 1:1618291/1‑148 TTAACTAATACCAATCAAATGCTTAGTGGTTTTTCTACTTCAAGAACTGGTGTAGATGGCTTGAAAACAGGTTCAACAAGTTTTCAAATTGACTGTTTTGCTGGAACAACAAATCAAAACGGTTTTAGAATCATTACGGTTGTTTTAG > 1:53030/1‑148 GTTCGCCTCAAGGTTTTCAATTGAAATTAGAGATGATACTTTTAGCGTATTCTTTACTGTTAAAATCAGCTAAATCACTGGAACCAGAGACTTTAAGATATTCTATCGGGTATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGt‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP043523/1895641‑1895788‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAACTAATACCAATCAAATGCTTAGTGGTTTTTCTACTTCAAGAACTGGTGTAGATGGCTTGAAAACAGGTTCAACAAGTTTTCAAATTGACTGTTTTGCTGGAACAACAAATCAAAACGGTTTTAGAATCATTACGGTTGTTTTAG < CP043523/2060261‑2060114 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |