| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP043523 | = 1441041 | 568 (1.090) | 336 (0.650) +CTTG |
160/280 | 4.1 | 37.4% | intergenic (‑29/+76) | FTN78_chr1454/FTN78_chr1455 | Oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide‑binding protein OppA/Oligopeptide transport system permease protein OppC |
| ? | CP043523 | 1441042 = | 579 (1.090) | intergenic (‑30/+75) | FTN78_chr1454/FTN78_chr1455 | Oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide‑binding protein OppA/Oligopeptide transport system permease protein OppC | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 882 total aligned reads displayed.
TTCCCCGCTTTTAATTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTCCGATAAAGATAATGGCAAGCACCAC > CP043523/1440894‑1441188 | tCCCCGCTTTTAATTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑c > 1:2339471/1‑148 (MQ=255) tCCCCGCTTTTAATTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑c < 2:4452145/148‑1 (MQ=255) ccccGCTTTTAATTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑Ct < 2:1655299/148‑1 (MQ=255) cGCTTTTAATTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑c < 2:3818568/148‑1 (MQ=255) tttAATTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑TTTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCa > 2:531780/1‑148 (MQ=255) tttAATTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCa < 2:2587602/148‑1 (MQ=255) tttAATTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCa < 1:4460708/148‑1 (MQ=255) ttAATTTTTTTGTACTTGTACTTGAGCTTTGATTAGAACCACAAGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTT‑‑‑‑CTTG‑‑‑‑Cttgc < 2:2656462/148‑3 (MQ=255) aaTTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCaata < 1:954592/148‑1 (MQ=255) aaTTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCaata < 2:1996707/148‑1 (MQ=255) tttttGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCaatataa < 1:1999345/148‑1 (MQ=255) ttttCGTACTTGTACTTGAGTTCTCGTTAGGGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATACAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTG‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCaatataat < 2:3177640/148‑1 (MQ=255) ttGGTACTTGTACTTGATTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCaatataatat < 1:4494029/148‑1 (MQ=255) ttGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCaatataatat < 1:3425785/148‑1 (MQ=255) tGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATatt > 1:1603043/1‑148 (MQ=255) gtacttgAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTAt > 1:1656464/1‑148 (MQ=255) tacttgAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATc < 1:83562/148‑1 (MQ=255) tacttgAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATc < 2:3119263/148‑1 (MQ=255) tacttgAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATc < 1:2872961/148‑1 (MQ=255) tacttgAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATc > 2:4101597/1‑148 (MQ=255) tacttgAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATc < 2:4567596/148‑1 (MQ=255) cttgAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCat > 1:3952548/1‑148 (MQ=255) ttgAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCata < 2:3893742/148‑1 (MQ=255) tgAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCatat < 2:4215692/148‑1 (MQ=255) gctttgattAGAACCACAAGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCat > 1:4557035/8‑148 (MQ=255) gctttgattAGAACCACAAGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCat > 2:4395242/8‑148 (MQ=255) ctttgattAGAACCACAAGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCata < 1:1380684/142‑1 (MQ=255) ttgattAGAACCACAAGCACATAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTCTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATc < 2:1403872/144‑1 (MQ=255) tGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCAtttt > 1:1151833/1‑148 (MQ=255) tAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAAt < 1:2294347/148‑1 (MQ=255) tAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAAt < 2:4313717/148‑1 (MQ=255) tAGAACCACAAGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCAttt > 2:893885/1‑148 (MQ=255) tAGAACCACAAGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCAttt > 2:807977/1‑148 (MQ=255) tAGAACCACAAGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCAttt < 1:3768656/148‑1 (MQ=255) tAGAACCACAAGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCAttt > 2:2299884/1‑148 (MQ=255) agagCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATa > 2:3565246/1‑148 (MQ=255) ccACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATa < 2:2989277/148‑1 (MQ=255) cacaAGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATa > 1:3921095/1‑148 (MQ=255) cacaAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATaa < 1:337305/148‑1 (MQ=255) acaAGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAg > 2:3255005/1‑148 (MQ=255) acaAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATaaa < 1:4191872/148‑1 (MQ=255) aGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTT‑‑‑‑CTTGCTTGCTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATa > 1:1113389/1‑148 (MQ=255) gCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATaa < 2:362030/148‑1 (MQ=255) gCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACAtt > 2:415081/1‑148 (MQ=255) cTTATGAGTGCAGCTGCTAAAACTACCCTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATCTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATCATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACAttttt < 1:3183513/148‑1 (MQ=255) ttAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACAt < 1:2683445/148‑1 (MQ=255) ttAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTa < 1:4093938/148‑1 (MQ=255) aGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACAttt < 1:3000821/148‑1 (MQ=255) gAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCAc < 1:219823/148‑1 (MQ=255) aGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTa > 2:1167822/1‑148 (MQ=255) gtgtaGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTAt > 1:4271231/5‑148 (MQ=255) gTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCActc < 1:3084077/148‑1 (MQ=255) tGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCTTC‑TTT‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCActct > 2:2920280/1‑148 (MQ=255) gCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCtt > 1:4391721/1‑148 (MQ=255) gctgctAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGaa < 2:1862551/148‑1 (MQ=255) gctgctAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGaa > 2:634615/1‑148 (MQ=255) gctgctAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCActa < 1:736738/148‑2 (MQ=255) gctAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAAtgt > 1:205547/1‑148 (MQ=255) gctAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAAtgt > 1:3198248/1‑148 (MQ=255) gctAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTg > 1:3584502/1‑148 (MQ=255) ctAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAAtgtt > 1:1440134/1‑148 (MQ=255) tAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGaa < 1:2414050/148‑1 (MQ=255) aaaCTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATgttgtt < 2:4042705/148‑1 (MQ=255) aaaCTACACTACTTGCCAATAAAGTAACTTTTAATTTGATCATCTTTG‑TTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATGACTATTGAAtg > 2:1295140/1‑148 (MQ=255) aaCTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGttt > 1:674477/1‑148 (MQ=255) tacactacTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATc < 2:3452413/148‑1 (MQ=255) tacactacTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAAtgttgt > 2:3670930/1‑148 (MQ=255) acactacTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCt < 1:3285803/148‑1 (MQ=255) acactacTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCt < 1:1879753/148‑1 (MQ=255) acactacTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCt < 2:1244443/148‑1 (MQ=255) ttGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTg > 1:3747032/1‑148 (MQ=255) ttGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTg < 1:2810619/148‑1 (MQ=255) cAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTc > 1:555370/1‑148 (MQ=255) aaTAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCt < 2:3358301/148‑1 (MQ=255) tAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTg < 2:1553870/148‑1 (MQ=255) aaaGTTACTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGt > 2:271209/1‑148 (MQ=255) tACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAg < 1:26287/148‑1 (MQ=255) tACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAg < 1:1813074/148‑1 (MQ=255) aCTTTTAATTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTT‑‑‑‑CTTGCTTGCTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTgg < 2:2833047/148‑1 (MQ=255) cTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGcc > 2:3969770/1‑148 (MQ=255) tttAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCAc < 1:1049734/148‑1 (MQ=255) ttAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACt > 2:1758056/1‑148 (MQ=255) tAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTc > 1:4012963/1‑148 (MQ=255) aaTTTGTTCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGcc > 2:1348565/1‑148 (MQ=255) tttCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTa < 1:3651668/148‑1 (MQ=255) gttCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCg > 1:4689865/2‑148 (MQ=255) ttCATC‑TTAGTTTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGt > 2:2091389/1‑148 (MQ=255) tcttagtttCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTa > 1:2506993/8‑148 (MQ=255) cttagtttCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAg > 1:433202/7‑148 (MQ=255) ttA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCAtt > 2:2409423/1‑148 (MQ=255) a‑aTTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTc < 2:717219/148‑1 (MQ=255) aTTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTcc > 1:1256753/1‑148 (MQ=255) tctcCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTCCGa > 2:3318134/1‑148 (MQ=255) ataatTTCTTGTTAGTA‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATACAATATGTACTTTATCATATCCATTTTTAATCGATGAACATTCTTATCGCTCTTCAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGTCATTCGTCTTAGGGCATTTTCGATAAAGa < 2:1013959/148‑1 (MQ=255) taatTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTCCGATAAAGAt > 2:1921429/1‑148 (MQ=255) ttttAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTCCGATAAAGATAATGGCaa < 2:1105697/148‑1 (MQ=255) tttAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTCCGATAAAGATAATGGCAAg < 2:2230561/148‑1 (MQ=255) ttAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTCCGATAAAGATAATGGCAAGc < 2:2454128/148‑1 (MQ=255) tt‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTCCGATAAAGATAATGGCAAGcacca < 1:1489669/148‑1 (MQ=255) tt‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTCCGATAAAGATAATGGCAAGcacca > 2:4687595/1‑148 (MQ=255) | TTCCCCGCTTTTAATTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATC‑TTA‑ATTCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTCCGATAAAGATAATGGCAAGCACCAC > CP043523/1440894‑1441188 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |