| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP043523 | = 1441041 | 568 (1.090) | 336 (0.650) +CTTG |
160/280 | 4.1 | 37.4% | intergenic (‑29/+76) | FTN78_chr1454/FTN78_chr1455 | Oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide‑binding protein OppA/Oligopeptide transport system permease protein OppC |
| ? | CP043523 | 1441042 = | 579 (1.090) | intergenic (‑30/+75) | FTN78_chr1454/FTN78_chr1455 | Oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide‑binding protein OppA/Oligopeptide transport system permease protein OppC | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 883 total aligned reads displayed.
TCCCCGCTTTTAATTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTCCGATAAAGATAATGGCAAGCACCACA > CP043523/1440895‑1441189 | tCCCCGCTTTTAATTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑c > 1:2339471/1‑148 (MQ=255) cGCTTTTAATTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑c < 2:1005857/148‑1 (MQ=255) gCTTTTAATTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑Ct < 2:206622/148‑1 (MQ=255) tttAATTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCa < 1:4460708/148‑1 (MQ=255) aaTTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCaata < 2:165376/148‑1 (MQ=255) ttttttGTACTTGTACTTGAGCTTTGATTAGAACCACAAGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTT‑‑‑‑CTTG‑‑‑‑Cttgcttcaa > 1:2807862/1‑141 (MQ=255) tttttGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCaatataa < 1:1999345/148‑1 (MQ=255) ttGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCaatataatat < 1:3425785/148‑1 (MQ=255) tGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATatt > 1:1603043/1‑148 (MQ=255) gtacttgtacttGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATattta < 2:1969505/148‑1 (MQ=255) gtacttgtacttGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATattta > 1:2989277/1‑148 (MQ=255) ttgtacttgAGCTTTGATTAGAACCACAAGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATattt < 2:191120/148‑1 (MQ=255) tgtacttgAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATatttaattta < 2:4390177/148‑1 (MQ=255) gtacttgAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTAt > 1:1656464/1‑148 (MQ=255) tacttgAGCTTTGATTAGAACCACAAGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATatttaat < 2:4041866/148‑1 (MQ=255) cttgAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCat < 1:926015/148‑1 (MQ=255) tgAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCatat < 2:4214894/148‑1 (MQ=255) aGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATcc < 1:4553663/148‑1 (MQ=255) ttCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCAt > 1:3264649/1‑148 (MQ=255) ctttgattAGAACCACAAGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCata < 1:1380684/142‑1 (MQ=255) tttgattAGAACCACAAGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCatat > 2:3408519/6‑148 (MQ=255) ttgattAGAACCACAAGCACATAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTCTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATc < 2:1403872/144‑1 (MQ=255) cTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCAttt < 1:3360678/148‑1 (MQ=255) tGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCAtttt > 1:1151833/1‑148 (MQ=255) gattAGAACCACAAGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTA‑GTT‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCa > 2:155140/3‑148 (MQ=255) tAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAAt < 1:2294347/148‑1 (MQ=255) tAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAAt > 2:3785901/1‑148 (MQ=255) tAGAACCACAAGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCAttt > 2:893885/1‑148 (MQ=255) tAGAACCACAAGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCAttt > 2:807977/1‑148 (MQ=255) tAGAACCACAAGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCAttt < 1:3161591/148‑1 (MQ=255) agaaccACAAGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTA‑GTT‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCAtttt < 2:2968764/144‑1 (MQ=255) aaccACAAGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTa > 2:2577859/3‑148 (MQ=255) aGCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTT‑‑‑‑CTTGCTTGCTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATa > 1:1113389/1‑148 (MQ=255) gCACTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTA‑G‑TCTCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATAGAATATTTAATTTATCATATCTATTTTTAATAGAtga > 2:4149715/1‑146 (MQ=255) aCTTAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTGCACTACTTGCCAATAAAGTTGCTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTAAATAGATAAAc > 2:1294550/1‑148 (MQ=255) ttAGGAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACAt < 1:2683445/148‑1 (MQ=255) ggAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCa < 1:3946367/148‑1 (MQ=255) gAGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACAttttt < 2:3175241/148‑1 (MQ=255) gAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCAc < 1:219823/148‑1 (MQ=255) aGTGTAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTa > 2:1167822/1‑148 (MQ=255) gtgtAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTAt > 2:3562271/1‑148 (MQ=255) gTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCActc < 1:3084077/148‑1 (MQ=255) gCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCtt > 1:4391721/1‑148 (MQ=255) gctgctAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCActa > 1:2536894/1‑147 (MQ=255) gctgctAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCActa < 1:736738/148‑2 (MQ=255) tgctAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAAtg < 2:4095396/148‑1 (MQ=255) tgctAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTAtt > 2:2395198/1‑148 (MQ=255) gctAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAAtgt > 1:205547/1‑148 (MQ=255) ctAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAAtgtt > 1:1440134/1‑148 (MQ=255) tAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGaa < 1:2414050/148‑1 (MQ=255) tAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGaa > 2:3862552/1‑148 (MQ=255) aaaaCTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAAt > 1:3632651/1‑148 (MQ=255) aaaaCTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCACTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAAt > 2:3666194/1‑148 (MQ=255) aaCTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGttt > 1:674477/1‑148 (MQ=255) acactacTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCt < 1:1879753/148‑1 (MQ=255) actTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCt > 2:1827024/1‑148 (MQ=255) ttGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTg > 1:3739266/1‑148 (MQ=255) tGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCtt > 2:2437027/1‑148 (MQ=255) ccAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAg > 1:832074/1‑148 (MQ=255) cAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTc > 1:555370/1‑148 (MQ=255) cAATAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTT‑‑‑‑CTTGCTTGCTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGc > 2:529569/1‑148 (MQ=255) aaTAAAGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCt > 1:386183/1‑148 (MQ=255) tAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCttt < 2:2773803/148‑1 (MQ=255) tAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCttt > 2:3346313/1‑148 (MQ=255) aGTTACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTT‑‑‑‑CTTGCTTGCTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCt > 1:4007636/1‑148 (MQ=255) tACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAg < 1:26287/148‑1 (MQ=255) tACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAg < 1:1813074/148‑1 (MQ=255) tACTTTTAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTg < 2:63296/148‑1 (MQ=255) aCTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTATTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGc > 1:4256469/1‑148 (MQ=255) cTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGcc > 2:3968773/1‑148 (MQ=255) ttttAATTTTTTTTTTTTT‑T‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCa > 2:4443752/1‑148 (MQ=255) ttttAATTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTc > 1:3763593/1‑148 (MQ=255) tttAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCAc < 1:1049734/148‑1 (MQ=255) ttAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACt < 2:2277617/148‑1 (MQ=255) aaTTTGTTCATCTTAGT‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATATATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGcc > 2:1347321/1‑148 (MQ=255) ttttttCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTc > 2:2900686/1‑148 (MQ=255) ttttttCATCTTA‑A‑T‑TCTACAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTc > 2:1244329/1‑148 (MQ=255) ttttCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCtt > 1:2859744/1‑148 (MQ=255) ttttCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTCAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCtt > 1:4493110/1‑148 (MQ=255) tttCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTa < 2:2202424/148‑1 (MQ=255) tttCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTa < 2:1745050/148‑1 (MQ=255) cATCTTA‑GTT‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCt < 2:3619128/148‑1 (MQ=255) cATCTTA‑GTT‑TCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGGTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCt < 2:2695301/148‑1 (MQ=255) tcttagtt‑tCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTa > 1:4163861/8‑148 (MQ=255) cTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCAt < 2:4530770/148‑1 (MQ=255) cttagtt‑tCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAg > 1:433202/7‑148 (MQ=255) cttagtt‑tCTCCAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAg < 2:3250510/142‑1 (MQ=255) a‑a‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTc < 2:717219/148‑1 (MQ=255) a‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTcc > 1:1256753/1‑148 (MQ=255) t‑tCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTCCg > 1:407641/1‑148 (MQ=255) t‑tCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTCCg > 2:4313105/1‑148 (MQ=255) tctcCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTCCGa > 2:3280450/1‑148 (MQ=255) ccAATAATTTCTTTTTATTTCTTGCTTG‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTATTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGTGCATTTCCg > 2:3064868/1‑148 (MQ=255) cAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTCCGATaaa > 2:46713/1‑148 (MQ=255) tttttAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTCCGATAAAGATAATGGCa > 1:319544/1‑148 (MQ=255) ttttAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTCCGATAAAGATAATGGCaa < 2:1105697/148‑1 (MQ=255) ttttAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACGCGTCTGAGCGCATTTCCGATAAAGATAATTGCaa > 2:2652081/1‑148 (MQ=255) tAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTCCGATAAAGATAATGGCAAGca < 1:3581654/148‑1 (MQ=255) aGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTCCGATAAAGATAATGGCAAGcac < 1:4676257/148‑1 (MQ=255) tt‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTCCGATAAAGATAATGGCAAGcacca < 1:1489669/148‑1 (MQ=255) | TCCCCGCTTTTAATTTTTTGGTACTTGTACTTGAGTTCTGGTTAGAGCCACAAGCACTTAGGAGTGCAGCTGCTAAAACTACACTACTTGCCAATAAAGTTACTTTTAATTTTTTCATCTTA‑A‑T‑TCTCCAATAATTTCTTTTTAGTT‑‑‑‑CTTA‑‑‑‑CTTCAATATAATATTTAATTTATCATATCCATTTTTAATAGATAAACATTTTTATCACTCTTGAATGTTGTTTATCTTGTAGCTTGTCTTTGGTCAGCCACTCGTCTTAGCGCATTTCCGATAAAGATAATGGCAAGCACCACA > CP043523/1440895‑1441189 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |