| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 4,099,309 | (G)7→10 | coding (48/993 nt) | kdgT → | 2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate transport system |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4099302 | 37 (0.140) | 173 (0.610) +GGG |
94/164 | 2.0 | 82.1% | coding (41/993 nt) | kdgT | 2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate transport system |
| ? | NC_000913 | 4099303 = | 38 (0.130) | coding (42/993 nt) | kdgT | 2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate transport system | |||||
Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
ACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAAC > NC_000913/4099210‑4099393 | acTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATccc < 1:5758385/93‑1 (MQ=255)acTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATccc > 2:3118950/1‑93 (MQ=255) cTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCg > 1:6835281‑M1/1‑92 (MQ=255) tGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgg > 2:956748‑M1/1‑91 (MQ=255) tGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgg < 2:7047422‑M1/93‑3 (MQ=255) tGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgg > 2:6401664‑M1/1‑91 (MQ=255) tGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgg < 2:5992337‑M1/93‑3 (MQ=255) tGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgg > 1:2785078‑M1/1‑91 (MQ=255) aTGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgggg < 2:2678894‑M1/93‑5 (MQ=255) tGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCggggg > 1:2466657‑M1/1‑88 (MQ=255) tGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCggggg > 2:4227137‑M1/1‑88 (MQ=255) cTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCggggggg < 1:5320905‑M1/93‑8 (MQ=255) cTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCggggggg < 2:3066503‑M1/93‑8 (MQ=255) cATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCggggggggga > 1:3282102‑M1/1‑83 (MQ=255) cATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCggggggggga > 1:4164826‑M1/1‑83 (MQ=255) cATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCggggggggga > 2:684108‑M1/1‑83 (MQ=255) ttGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCggggggggggat > 2:2243036‑M1/1‑81 (MQ=255) ttGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑GGGGGGgatgat > 2:3442241/1‑93 (MQ=255) ttGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑GGGGGGgatgat < 1:4464218/93‑1 (MQ=255) tGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑GGGGGGGatgatg > 1:7299698/1‑93 (MQ=255) aGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgggggggggatgatg > 2:106735‑M1/1‑78 (MQ=255) aGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGc > 2:2616710/1‑93 (MQ=255) ggAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCggggggggggatgatg > 2:6632238‑M1/1‑77 (MQ=255) gAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgggggggggatgatgct > 1:6409430‑M1/1‑76 (MQ=255) aTTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCG‑GGGGGGGATGATGCTCGt > 1:5990120/1‑93 (MQ=255) ttACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCggggggggggatgatgctcg < 1:2356442‑M1/93‑21 (MQ=255) ttACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgggggggggatgatgctcgt > 2:2898359‑M1/1‑73 (MQ=255) cATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgggggggggatgatgctcgtcccgc < 2:838479‑M1/93‑26 (MQ=255) aTCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgggggggggatgatgctcgtcccgct > 2:1776737‑M1/1‑67 (MQ=255) tCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgggggggggatgatgctcgtcccgcta > 1:2972292‑M1/1‑66 (MQ=255) tCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgggggggggatgatgctcgtcccgcta < 2:7193846‑M1/93‑28 (MQ=255) tCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTAtt > 2:3256565/1‑93 (MQ=255) cAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgggggggggatgatgctcgtcccgctat > 1:1384419‑M1/1‑65 (MQ=255) cAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgggggggggatgatgctcgtcccgctat > 2:5664084‑M1/1‑65 (MQ=255) aGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgggggggggatgatgctcgtcccgctatt < 2:5507690‑M1/93‑30 (MQ=255) cccTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgggggggggatgatgctcgtcccgctattcc > 2:1099230‑M1/1‑62 (MQ=255) ttAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAA‑CCCcgggggggggatgatgctcgtcccgctattccttg < 1:3674631‑M1/93‑36 (MQ=255) aaaaTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgggggggggatgatgctcgtcccgctattccttggcg > 2:6435619‑M1/1‑56 (MQ=255) atatGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgggggggggatgatgctcgtcccgctattccttggcgcac < 2:5562187‑M1/93‑41 (MQ=255) tatGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgggggggggatgatgctcgtcccgctattccttggcgcact < 2:4535740‑M1/93‑42 (MQ=255) atGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgggggggggatgatgctcgtcccgctattccttggcgcactg < 2:7122022‑M1/93‑43 (MQ=255) ccGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgggggggggatgatgctcgtcccgctattccttggcgcactgtgc > 1:3098936‑M1/1‑48 (MQ=255) ccGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgggggggggatgatgctcgtcccgctattccttggcgcactgtgc > 2:2739937‑M1/1‑48 (MQ=255) ccGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgggggggggatgatgctcgtcccgctattccttggcgcactgtgc > 2:392796‑M1/1‑48 (MQ=255) ccGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCca > 2:2223582/1‑93 (MQ=255) cGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCgggggggggatgatgctcgtcccgctattccttggcgcactgtgcc < 2:1001871‑M1/93‑47 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |