| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 4,099,309 | (G)7→10 | coding (48/993 nt) | kdgT → | 2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate transport system |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4099302 | 37 (0.140) | 173 (0.610) +GGG |
94/164 | 2.0 | 82.1% | coding (41/993 nt) | kdgT | 2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate transport system |
| ? | NC_000913 | 4099303 = | 38 (0.130) | coding (42/993 nt) | kdgT | 2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate transport system | |||||
Only 100 of 224 total aligned reads displayed.
TGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGG > NC_000913/4099212‑4099395 | atgctccattgaggaattacgcatcagcccttaaaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccgggg < 2:2678894‑M2/1‑1 (MQ=255)atgctccattgaggaattacgcatcagcccttaaaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccgggg < 2:7090338‑M2/1‑1 (MQ=255) gctccattgaggaattacgcatcagcccttaaaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccgggggg > 1:3384618‑M2/91‑93 (MQ=255) gctccattgaggaattacgcatcagcccttaaaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccgggggg > 2:4097414‑M2/91‑93 (MQ=255) ctccattgaggaattacgcatcagcccttaaaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggggggg < 1:5320905‑M2/4‑1 (MQ=255) tccattgaggaattacgcatcagcccttaaaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccgggggggg > 1:6223283‑M2/89‑93 (MQ=255) cattgaggaattacgcatcagcccttaaaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggggggggga > 2:684108‑M2/87‑92 (MQ=255) ttgaggaattacgcatcagcccttaaaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggtggggggatg < 1:5123894‑M2/9‑4 (MQ=255) ttGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑GGGGGGgatgat < 1:4464218/93‑1 (MQ=255) tGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGGGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑GGGGGGGatgatg > 1:3491653/1‑93 (MQ=255) ggaattacgcatcagcccttaaaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccgggGGGGGGGatgatg > 2:6632238‑M2/81‑93 (MQ=255) aGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGGGGGGGATGATGc > 2:2616710/1‑93 (MQ=255) gaattacgcatcagcccttaaaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCt < 2:7215698‑M2/15‑1 (MQ=255) ttacgcatcagcccttaaaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccgggGGGGGGGATGATGCTCg < 1:2356442‑M2/17‑1 (MQ=255) attacgcatcagcccttaaaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCg > 1:4972596‑M2/77‑93 (MQ=255) acgcatcagcccttaaaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTcc > 2:7361112‑M2/74‑93 (MQ=255) gCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCt > 2:3486157/1‑93 (MQ=255) tcagcccttaaaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccgggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCt > 1:2704871‑M2/70‑93 (MQ=255) tcagcccttaaaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTa > 1:2972292‑M2/69‑93 (MQ=255) cagcccttaaaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTAt > 1:1384419‑M2/68‑93 (MQ=255) agcccttaaaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTAtt < 2:5507690‑M2/27‑1 (MQ=255) gcccttaaaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTc > 2:577153‑M2/66‑93 (MQ=255) ccttaaaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCt > 2:689900‑M2/64‑93 (MQ=255) cttaaaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCtt > 2:871010‑M2/63‑93 (MQ=255) ttaaaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTg > 2:107634‑M2/62‑93 (MQ=255) ttaaaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTg > 2:4140321‑M2/62‑93 (MQ=255) ttaaaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaaccccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTg < 1:3674631‑M2/32‑1 (MQ=255) cTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTgg > 1:7364392/1‑93 (MQ=255) aaaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGgcg > 2:6435619‑M2/59‑93 (MQ=255) aaatatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGgcgc > 2:1764647‑M2/58‑93 (MQ=255) atatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccgggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCa > 2:1107682‑M2/57‑93 (MQ=255) atatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCAc > 1:3994692‑M2/56‑93 (MQ=255) tatgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACt < 2:4535740‑M2/39‑1 (MQ=255) tgccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACtgt > 2:7333540‑M2/53‑93 (MQ=255) ccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGc > 2:2739937‑M2/51‑93 (MQ=255) ccgacaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGc > 1:3098936‑M2/51‑93 (MQ=255) ccGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCca > 2:2223582/1‑93 (MQ=255) gacaggtgatggaaatgcagaaaaaacgctcgattgaaaaaaccccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCca < 1:5983152‑M2/45‑1 (MQ=255) acaggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCcac > 2:4319771‑M2/48‑93 (MQ=255) caggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCcaca > 2:5998029‑M2/47‑93 (MQ=255) aCATGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCacac > 2:821797/1‑93 (MQ=255) aggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCacac > 2:3075035‑M2/46‑93 (MQ=255) aggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCacac > 2:7133401‑M2/46‑93 (MQ=255) ggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACAcc > 1:4168452‑M2/45‑93 (MQ=255) ggtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACAcc > 1:7305467‑M2/45‑93 (MQ=255) gtgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCt > 1:6673588‑M2/44‑93 (MQ=255) ggTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCt > 2:7427206/1‑93 (MQ=255) ggTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCtt < 1:6348659/93‑1 (MQ=255) tgatggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCtt < 2:2102785‑M2/51‑1 (MQ=255) gatgaaaatgcaaataaaacgctcgattgaaaaaaccccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTtc < 2:6701187‑M2/52‑1 (MQ=255) tggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTtctc > 2:692001‑M2/40‑93 (MQ=255) tggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTtctc > 1:6839078‑M2/40‑93 (MQ=255) tGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGc < 2:3664439/93‑1 (MQ=255) ggaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCg > 1:4353975‑M2/39‑93 (MQ=255) gaaatgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGc > 2:2899506‑M2/38‑93 (MQ=255) gAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGcc > 2:1030001/1‑93 (MQ=255) aaaaTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGcc < 1:1874960/92‑1 (MQ=255) atgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCgg > 1:5628432‑M2/35‑93 (MQ=255) aaTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCggg < 1:125258/93‑1 (MQ=255) tgcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTAGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCggg > 2:4009085‑M2/34‑93 (MQ=255) gcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCgggg > 2:4778461‑M2/33‑93 (MQ=255) gcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCgggg < 2:1793422‑M2/61‑1 (MQ=255) gcagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCCCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCgggg < 1:6212145‑M2/61‑1 (MQ=255) gcagaaaaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCgggg < 1:1943821‑M2/61‑1 (MQ=255) cagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCggggg < 1:6942432‑M2/62‑1 (MQ=255) cagataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCggggg > 2:5659060‑M2/32‑93 (MQ=255) agataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGc > 1:3445401‑M2/31‑93 (MQ=255) gataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCg > 1:5708920‑M2/30‑93 (MQ=255) aGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCgg < 1:2747095/93‑1 (MQ=255) ataaaacgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCgg < 1:3408136‑M2/65‑1 (MQ=255) aacgctcgattgagaaaatcccgggGGGGGGG‑TGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGgcggggtg > 2:6953883‑M2/26‑91 (MQ=255) acgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGaaa > 1:1733011‑M2/24‑93 (MQ=255) acgctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGaaa > 1:2200224‑M2/24‑93 (MQ=255) gctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGGAata > 1:6279376‑M2/22‑93 (MQ=255) gctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAata > 1:3896979‑M2/22‑93 (MQ=255) gctcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAata > 2:5088417‑M2/22‑93 (MQ=255) tcgattgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATAtt > 1:47961‑M2/20‑93 (MQ=255) aTTGAGAAAATCCC‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGa < 2:2418507/93‑1 (MQ=255) ttgagaaatccccgGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGa < 2:2842549‑M2/79‑1 (MQ=255) ttGAGAAAATCCC‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGAt > 2:5275386/1‑93 (MQ=255) tgagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGa < 1:1184845‑M2/79‑1 (MQ=255) gagaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGAt > 1:1781813‑M2/14‑93 (MQ=255) agaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATc < 1:7264610‑M2/81‑1 (MQ=255) aaaaacccccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATc < 1:5154570‑M2/81‑1 (MQ=255) gaaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCa > 2:3288937‑M2/12‑93 (MQ=255) aaaatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCAt > 1:4783063‑M2/11‑93 (MQ=255) aatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTc < 2:4679703‑M2/85‑1 (MQ=255) aatcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTc > 1:5829171‑M2/9‑93 (MQ=255) atcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCa > 2:3914400‑M2/8‑93 (MQ=255) accccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCa < 2:356040‑M2/86‑1 (MQ=255) tcccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCAc > 1:7463503‑M2/7‑93 (MQ=255) cccggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCAcc < 1:5545496‑M2/88‑1 (MQ=255) cc‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAAc < 2:4488317/93‑1 (MQ=255) ggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAAc > 2:1235453‑M2/3‑93 (MQ=255) ggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAAc < 2:1480542‑M2/91‑1 (MQ=255) ggGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAAc > 2:4372214‑M2/3‑93 (MQ=255) gGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACg > 1:922619‑M2/2‑93 (MQ=255) gggggggATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACgg > 2:6983730/1‑93 (MQ=255) gggggggATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACgg < 2:6168213/93‑1 (MQ=255) gggggggATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACgg < 2:3058487/93‑1 (MQ=255) | TGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACGG > NC_000913/4099212‑4099395 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |