| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 365527 = | 0 (0.000) | 268 (1.060) | 132/178 | 0.1 | 71.6% | coding (3/3075 nt) | lacZ | beta‑D‑galactosidase |
| ? | NC_000913 | 4589230 = | 213 (0.840) | coding (4/1656 nt) | tsr | methyl‑accepting chemotaxis protein I | |||||
Only 100 of 295 total aligned reads displayed.
TCATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/365621‑365527‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTAATGC > NC_000913/4589230‑4589321 TCATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTA > 2:6283915/1‑93 CATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTAT < 1:1070871/93‑1 ATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATG > 2:6441164/1‑93 TTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGT > 1:4265840/1‑93 TAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTT > 2:2126822/1‑93 AGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTA < 1:858168/93‑1 CCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACG > 1:5827189/1‑93 CCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACG > 2:2479015/1‑93 CCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGT < 2:1874711/93‑1 CCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTA > 1:3530571/1‑93 CAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTAT > 1:5614169/1‑93 AGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTCAAACGTATC > 1:2380616/1‑93 AGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATC < 2:3714774/93‑1 AGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATC > 2:1483848/1‑93 AGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATC > 2:3144853/1‑93 GGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCA > 2:524453/1‑93 TTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACACTTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAA > 2:1998341/1‑93 TTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAA > 1:2960928/1‑93 TTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAA > 1:3250038/1‑93 TTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAA < 1:4407421/93‑1 TTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAA > 2:1654557/1‑93 TACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATT < 1:1006034/93‑1 CACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGT < 2:581575/93‑1 CTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTT > 1:449970/1‑93 TCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTAC < 1:5370272/93‑1 TCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTAC < 2:1192120/93‑1 CGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTG > 2:2568213/1‑93 GGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGC < 1:1103873/93‑1 GCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCT > 2:6602915/1‑93 TCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGG > 1:1819467/1‑93 ATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTT < 2:6563617/93‑1 ATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTT > 2:2712707/1‑93 TGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTG < 2:3545217/93‑1 GTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGG > 1:3822774/1‑93 TTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGC > 1:2776716/1‑93 TGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCC < 2:903671/93‑1 TGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGT > 2:5847876/1‑93 GTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTT > 1:5069019/1‑93 GTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTT < 1:4932196/93‑1 GGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTT < 2:1940800/93‑1 AATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTG > 2:5542824/1‑93 ATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGG > 2:4408033/1‑93 ATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGG > 1:467952/1‑93 ATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGG > 2:1050311/1‑93 TTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGC > 2:1541844/1‑93 TGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTT > 1:6252724/1‑93 TGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTT < 1:5238242/93‑1 TGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTT > 1:5103273/1‑93 GAGCGGGTTACAATTTCACCCAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTCGCCTTT > 1:6547513/1‑93 AGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTT < 2:4330721/93‑1 CGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTAC < 1:2227597/93‑1 GGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACA > 1:3004038/1‑93 GGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACA < 1:1354523/93‑1 GGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACA > 1:6646197/1‑93 GATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAA < 2:238301/93‑1 ATAAGAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAAC < 2:3802085/93‑1 ATAACAATTGCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAAC < 1:5444395/93‑1 TAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACT < 1:6403267/93‑1 TAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACT > 1:5514229/1‑93 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CAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCT < 1:701094/93‑1 AGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTT < 2:5565656/93‑1 AGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTT < 1:393955/93‑1 GCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTT > 1:2554046/1‑93 GCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTT > 1:1980743/1‑93 TATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTAA > 2:1712927/1‑93 TATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTAA > 2:3472255/1‑93 ATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTAAg > 1:6099054/1‑92 ATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTAAT > 2:5141662/1‑93 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |