| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 365527 = | 0 (0.000) | 268 (1.060) | 132/178 | 0.1 | 71.6% | coding (3/3075 nt) | lacZ | beta‑D‑galactosidase |
| ? | NC_000913 | 4589230 = | 213 (0.840) | coding (4/1656 nt) | tsr | methyl‑accepting chemotaxis protein I | |||||
Only 100 of 502 total aligned reads displayed.
ATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTAATGCC > NC_000913/4589138‑4589322 | aTTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGt > 2:6588806/1‑93 (MQ=255) tCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCACCAGGAAGGAGAAACAATGTTa > 1:4328766/1‑93 (MQ=255) aCTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTaaa > 1:1599800/1‑93 (MQ=255) tCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAAc < 2:2756950/93‑1 (MQ=255) accccaggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAAc < 1:523687‑M2/7‑1 (MQ=255) ccccaggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACg > 1:5827189‑M2/86‑93 (MQ=255) ccccaggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACg > 2:2886266‑M2/86‑93 (MQ=255) ccaggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTa > 2:3438061‑M2/84‑93 (MQ=255) caggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTAt > 1:5614169‑M2/83‑93 (MQ=255) caggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTAt > 1:2452230‑M2/83‑93 (MQ=255) tAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCa > 1:4889937/1‑93 (MQ=255) aTCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCaaa > 1:340581/1‑93 (MQ=255) aTCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCaaa > 2:2503741/1‑93 (MQ=255) aTCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCaaa < 1:1801498/93‑1 (MQ=255) tttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCaaaa > 1:2960928‑M2/78‑93 (MQ=255) tttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCaaaa > 2:1654557‑M2/78‑93 (MQ=255) tcCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAAtt > 2:5731402/1‑93 (MQ=255) tacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAAtt < 1:1006034‑M2/18‑1 (MQ=255) gcgGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCGGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCGCTGGAATGAGAAACCATGTGAAAACGTATCAAAATtgtg > 2:2035431/1‑93 (MQ=255) ggATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGAcc > 1:5152069/1‑93 (MQ=255) ggATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGAcc < 1:1995952/93‑1 (MQ=255) gATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCa > 1:2222294/1‑93 (MQ=255) gcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCt < 2:3647799‑M2/28‑1 (MQ=255) gcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCt < 2:6614905‑M2/28‑1 (MQ=255) atTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCt > 1:4820973/1‑93 (MQ=255) tccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTAc < 2:1192120‑M2/31‑1 (MQ=255) aaGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTActgct < 1:1132326/93‑1 (MQ=255) tcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTATAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTgg > 2:471073‑M2/57‑93 (MQ=255) gTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTgg > 1:6711467/1‑93 (MQ=255) gTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTgg > 2:4642436/1‑93 (MQ=255) tatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGttt > 1:4968518‑M2/54‑93 (MQ=255) tatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGttt > 2:4378515‑M2/54‑93 (MQ=255) atgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGtttt > 1:6046683‑M2/53‑93 (MQ=255) tgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTg < 2:6260953‑M2/42‑1 (MQ=255) tgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTg < 2:3545217‑M2/42‑1 (MQ=255) gttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTgg > 1:4449717‑M2/51‑93 (MQ=255) tttccAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGcc > 1:909667/1‑93 (MQ=255) tttccAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGcc > 1:2133301/1‑93 (MQ=255) ttccAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCg < 2:5998178/93‑1 (MQ=255) ttccAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCg > 1:6339485/1‑93 (MQ=255) cAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGttt > 1:2312073/1‑93 (MQ=255) ggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGtttt < 1:4509369‑M2/50‑1 (MQ=255) aGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGtttt > 2:1781923/1‑93 (MQ=255) aGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGtttt < 1:1692856/93‑1 (MQ=255) ggCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGttttt > 2:6515274/1‑93 (MQ=255) attgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTgg > 2:1050311‑M2/41‑93 (MQ=255) ttgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGc > 2:1541844‑M2/40‑93 (MQ=255) gAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGcc > 1:3635406/1‑93 (MQ=255) gAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGcc > 2:4214910/1‑93 (MQ=255) aaaaTCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCt > 1:2767195/1‑93 (MQ=255) tCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTa > 2:4463574/1‑93 (MQ=255) tCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTa > 2:2162671/1‑93 (MQ=255) gcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTa < 1:5322747‑M2/60‑1 (MQ=255) cggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTAc > 2:1923084‑M2/33‑93 (MQ=255) ggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACa < 1:1354523‑M2/62‑1 (MQ=255) ggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACa < 1:3938889‑M2/62‑1 (MQ=255) gataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACaa > 2:5151017‑M2/31‑93 (MQ=255) gataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACaa < 1:6162995‑M2/63‑1 (MQ=255) gataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACaa < 2:238301‑M2/63‑1 (MQ=255) gCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAAc > 2:5219122/1‑93 (MQ=255) ataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAAc < 1:3816118‑M2/64‑1 (MQ=255) cATCTGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACt < 2:74405/93‑1 (MQ=255) 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aacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGtt < 1:6458281‑M2/83‑1 (MQ=255) aacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGtt < 2:3775831‑M2/83‑1 (MQ=255) agctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCtt < 2:5565656‑M2/86‑1 (MQ=255) aaCCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCtt > 1:5729304/1‑93 (MQ=255) aaCCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCtt > 2:2599043/1‑93 (MQ=255) aCCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGAACAGCTTAATGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGGCTGTTCttt > 1:6555059/1‑93 (MQ=255) tatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTaa > 1:741585‑M2/5‑93 (MQ=255) tatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTaa < 1:3124981‑M2/89‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |