| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 365527 = | 0 (0.000) | 268 (1.060) | 132/178 | 0.1 | 71.6% | coding (3/3075 nt) | lacZ | beta‑D‑galactosidase |
| ? | NC_000913 | 4589230 = | 213 (0.840) | coding (4/1656 nt) | tsr | methyl‑accepting chemotaxis protein I | |||||
Only 100 of 287 total aligned reads displayed.
GGATGTGCTGCAAGGCGATTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAAT > NC_000913/365435‑365619 | gcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaac > 1:2592412‑M1/93‑93 (MQ=255) cattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCa > 2:2423322‑M1/92‑93 (MQ=255) cattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCa < 1:3100405‑M1/2‑1 (MQ=255) cattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCa > 1:5706679‑M1/92‑93 (MQ=255) cattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCa > 2:5732500‑M1/92‑93 (MQ=255) cttaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCAt > 1:6099054‑M1/91‑93 (MQ=255) ttaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATa > 2:1712927‑M1/90‑93 (MQ=255) aaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGc > 2:5170825‑M1/88‑93 (MQ=255) aaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGc > 2:4737392‑M1/88‑93 (MQ=255) aaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGc > 1:6660021‑M1/88‑93 (MQ=255) aagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCt < 1:250613‑M1/7‑1 (MQ=255) agaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTg < 1:701094‑M1/8‑1 (MQ=255) gaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGt < 1:2282821‑M1/9‑1 (MQ=255) aacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGtt < 1:6458281‑M1/10‑1 (MQ=255) acagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccagaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGttt < 2:4690948‑M1/11‑1 (MQ=255) acagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGttt < 2:5280230‑M1/11‑1 (MQ=255) cagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTc < 1:4248523‑M1/12‑1 (MQ=255) agaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTcc > 2:3044135‑M1/81‑93 (MQ=255) agaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTcc < 2:507728‑M1/13‑1 (MQ=255) agaccgcctgacgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTcc > 2:4222320‑M1/81‑93 (MQ=255) gaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCt < 2:6674785‑M1/14‑1 (MQ=255) gaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCt < 2:77751‑M1/14‑1 (MQ=255) accgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtg > 1:2381037‑M1/79‑93 (MQ=255) gcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtgtgt > 1:2188307‑M1/76‑93 (MQ=255) cctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtgtgtg < 1:5973829‑M1/19‑1 (MQ=255) gatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGaaa > 2:1417084‑M1/72‑93 (MQ=255) gatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGaaa > 2:2496302‑M1/72‑93 (MQ=255) tgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAAtt > 1:602024‑M1/70‑93 (MQ=255) gtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAattt < 2:6644260‑M1/25‑2 (MQ=255) tcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGt > 1:734298‑M1/68‑93 (MQ=255) cagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGtt > 2:539927‑M1/67‑93 (MQ=255) cagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGtt < 2:5555538‑M1/27‑1 (MQ=255) cagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGtt > 2:4603638‑M1/67‑93 (MQ=255) agttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTa < 1:1762821‑M1/28‑1 (MQ=255) agttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTa > 1:5514229‑M1/66‑93 (MQ=255) gttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGCAATTGTTAt < 1:5444395‑M1/29‑1 (MQ=255) gttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTAt < 1:3816118‑M1/29‑1 (MQ=255) gttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTAt > 1:3578694‑M1/65‑93 (MQ=255) gttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTCTTAt < 2:3802085‑M1/29‑1 (MQ=255) tgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATcc > 2:5705076‑M1/63‑93 (MQ=255) tgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATcc > 1:3004038‑M1/63‑93 (MQ=255) tgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATcc < 1:3938889‑M1/31‑1 (MQ=255) aaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCt < 2:4330721‑M1/34‑1 (MQ=255) aaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTc > 2:6600424‑M1/59‑93 (MQ=255) aaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTc > 1:1672517‑M1/59‑93 (MQ=255) aaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTca > 1:5103273‑M1/58‑93 (MQ=255) aaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTca > 1:6252724‑M1/58‑93 (MQ=255) aaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTca < 1:5238242‑M1/36‑1 (MQ=255) aaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTca < 1:4146398‑M1/36‑1 (MQ=255) aaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTca > 1:334602‑M1/58‑93 (MQ=255) gccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACaa > 2:1541844‑M1/55‑93 (MQ=255) gccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACaa > 1:1164061‑M1/55‑93 (MQ=255) ccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAt > 2:4408033‑M1/54‑93 (MQ=255) ccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAt > 2:1050311‑M1/54‑93 (MQ=255) ccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAt > 2:2816594‑M1/54‑93 (MQ=255) caaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAtt > 2:5542824‑M1/53‑93 (MQ=255) aaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTc > 1:2825459‑M1/52‑93 (MQ=255) aaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTcc < 2:1940800‑M1/43‑1 (MQ=255) aaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTcc < 2:656092‑M1/43‑1 (MQ=255) aaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTcc > 2:2378761‑M1/51‑93 (MQ=255) aacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCcac < 2:347827‑M1/45‑1 (MQ=255) ggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCcacaca < 2:903671‑M1/48‑1 (MQ=255) ccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaac > 1:4449717‑M1/44‑93 (MQ=255) caaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaaca < 2:3545217‑M1/51‑1 (MQ=255) caaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaaca < 2:6260953‑M1/51‑1 (MQ=255) aaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATa > 1:4968518‑M1/41‑93 (MQ=255) aaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATa > 1:5833562‑M1/41‑93 (MQ=255) aaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATa < 1:2091801‑M1/53‑1 (MQ=255) ccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGa > 2:3064207‑M1/38‑93 (MQ=255) cagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAg > 1:2990435‑M1/37‑93 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |