| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 526,302 | (G)6→9 | coding (3818/4281 nt) | rhsD → | RhsD |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 526296 | 32 (0.090) | 247 (0.660) +GGG |
111/166 | 0.7 | 87.8% | coding (3812/4281 nt) | rhsD | RhsD |
| ? | NC_000913 | 526297 = | 37 (0.100) | coding (3813/4281 nt) | rhsD | RhsD | |||||
Only 100 of 271 total aligned reads displayed.
AATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/526205‑526296‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGC > NC_000913/526297‑526388 ||| AATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACG < 1:5681158/93‑1AATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACG < 2:2318899/93‑1 ATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGG < 1:3767845/93‑1 TTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCTGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGG > 2:10045697/1‑93 TTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGG > 1:4305593/1‑93 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TAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGGGTT > 2:814670/1‑93 AATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGGG‑GTTTGTGGTGgtt > 2:31205/1‑90 AATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCT > 2:6063646/1‑93 AATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCT > 2:9231514/1‑93 ATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTT > 1:6926885/1‑93 ATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTT < 1:8042597/93‑1 TCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTT > 2:3908788/1‑93 TCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTT > 2:2394923/1‑93 CCACTACAACAAATTGCCCCTATGGTATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTC < 2:2769823/93‑1 CCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTC > 2:3570313/1‑93 CACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGGG‑GTTTGTGGTGTTCTTTC > 2:6120095/1‑93 ACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCAC > 2:2595253/1‑93 ACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCAC > 1:10025382/1‑93 CTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGGTCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACG < 2:6998951/93‑1 TACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGT < 2:5366537/93‑1 CAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTAT < 2:5130067/93‑1 AACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATA > 1:4618375/1‑93 AACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATA < 1:5525186/93‑1 AATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTTACGTATAATAG > 2:5886604/1‑93 ATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGGG‑G‑TTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGG > 2:895589/1‑93 ATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGG > 2:6153155/1‑93 TTGACCCGAGGGAATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGA < 2:3804961/93‑1 ACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGCTCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCA > 1:511718/1‑93 ACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCA > 1:1808518/1‑93 CCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAA > 1:6168695/1‑93 CCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAG > 1:3648831/1‑93 CTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGa > 1:3201204/1‑92 CTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGT < 1:9582826/93‑1 CTATGGGATTATGGCGGACTTGGGATGATGCAAGATCTGGAGCATGTCCGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGT < 1:5876400/93‑1 TATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTA > 2:6717048/1‑93 TGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGGG‑GGTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAA > 2:50544/1‑93 TGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTGTAATAGGACCAAGTAAA > 2:8647793/1‑93 TGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAA > 1:398360/1‑93 GGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGGG‑‑GTTTGGGGGGTTTTTTCACGTATAATAGGCCCAAGTAAAT > 1:905493/1‑93 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1:8648763/93‑1 ||| AATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/526205‑526296‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGC > NC_000913/526297‑526388 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |