| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 526,302 | (G)6→9 | coding (3818/4281 nt) | rhsD → | RhsD |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 526296 | 32 (0.090) | 247 (0.660) +GGG |
111/166 | 0.7 | 87.8% | coding (3812/4281 nt) | rhsD | RhsD |
| ? | NC_000913 | 526297 = | 37 (0.100) | coding (3813/4281 nt) | rhsD | RhsD | |||||
Only 100 of 302 total aligned reads displayed.
ATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTAC‑G‑GGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCA > NC_000913/526206‑526389 | ttatatcagtatcctttaaatccactacaacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggg < 1:6242755‑M2/1‑1 (MQ=255) tatatcagtatcctttaaatccactacaacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggg‑g < 2:551411‑M2/2‑1 (MQ=255) atatcagtatcctttaaatccactacaacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggg‑gg > 2:6153115‑M2/91‑93 (MQ=255) atatcagtatcctttaaatccactacaacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggg‑gg > 1:9293978‑M2/91‑93 (MQ=255) tatcagtatcctttaaatccactacaacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggg‑ggg > 1:9703958‑M2/90‑93 (MQ=255) tatcagtatcctttaaatccactacaacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggg‑ggg > 1:2742903‑M2/90‑93 (MQ=255) ataagtatcctttaaatccactacaacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggg‑gggg < 1:3322485‑M2/5‑1 (MQ=255) tcagtatcctttaaatccactacaacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggg‑ggggg > 1:3915409‑M2/88‑93 (MQ=255) agtatcctttaaatccactacaacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggg‑gggggtt > 2:7833391‑M2/86‑91 (MQ=255) agtatcctttaaatccactacaacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggg‑gggggtt > 1:7994528‑M2/86‑91 (MQ=255) tttaaatccactacaacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTgtggtg > 1:4880198‑M2/79‑93 (MQ=255) tAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGG‑GGGGGAGTTTGTGGTGtt < 2:4870038/93‑1 (MQ=255) aatccactacaacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCt > 1:7165314‑M2/75‑93 (MQ=255) atccactacaacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCtt > 1:6926886‑M2/74‑93 (MQ=255) ccactacaacaaattgcccctatggtattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTc < 2:2769823‑M2/22‑1 (MQ=255) cactacaacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCa > 2:7278096‑M2/71‑93 (MQ=255) actacaacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCAc > 1:10025382‑M2/70‑93 (MQ=255) ctacaacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccaggtctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACg < 2:6998951‑M2/25‑1 (MQ=255) tacaacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGt < 2:5366537‑M2/26‑1 (MQ=255) tacaacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgataccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGt > 2:6373163‑M2/68‑93 (MQ=255) acaacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGta > 1:4120207‑M2/67‑93 (MQ=255) tACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTAC‑G‑GGGGGGGTTTGTGGTGTTCTTTCACGta > 2:8729255/1‑93 (MQ=255) caacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGGG‑GGTTGTGGTGTTCTTTCACGta > 2:3795425‑M2/66‑93 (MQ=255) caacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGtat < 2:5130067‑M2/28‑1 (MQ=255) caacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGtat > 1:9614641‑M2/66‑93 (MQ=255) aacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGtata > 1:5107994‑M2/65‑93 (MQ=255) aacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGtata < 1:5525186‑M2/29‑1 (MQ=255) aacaaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGtata > 1:4618375‑M2/65‑93 (MQ=255) caaattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTTTTTCAAGTataat > 2:2801555‑M2/63‑93 (MQ=255) aacaaATTGACCTTATGGGATTATTGCAGACTTGGTATGATCCCAGATCTGGAGCATGTCCGG‑GGGGGGGTTTGTGGTGTTCTTTCACGtata < 2:7468873/93‑1 (MQ=255) aacaaATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTTGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTAC‑GAGGGGGGGTTTTTGGTGTTCTGTCACGtata > 1:4250559/1‑93 (MQ=255) aattgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTTACGTATAATAg > 2:5886604‑M2/61‑93 (MQ=255) attgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAgg > 2:6224891‑M2/60‑93 (MQ=255) ttgaccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGa < 1:9563022‑M2/35‑1 (MQ=255) accctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCa > 1:1808518‑M2/56‑93 (MQ=255) accctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCa > 1:5651772‑M2/56‑93 (MQ=255) ccctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCaa > 1:6168695‑M2/55‑93 (MQ=255) cctatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAg < 1:8785129‑M2/40‑1 (MQ=255) aCCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTAC‑G‑GGGGGGGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCaa > 2:1659131/1‑93 (MQ=255) cccTATGGGATTATGGCAGACTTGGGATGATGCTAGATGGGAAGAATGGCCGG‑GGGGGGGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCaa < 1:9141218/93‑1 (MQ=255) tatgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTa > 2:6717048‑M2/52‑93 (MQ=255) tgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGGG‑G‑TTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTaaa > 2:3121368‑M2/50‑93 (MQ=255) tgggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTaaa < 2:2595736‑M2/44‑1 (MQ=255) gggattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAAt > 1:5800894‑M2/49‑93 (MQ=255) aTGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGG‑GGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTaa > 1:2310714/1‑93 (MQ=255) gattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAAttt > 1:9945410‑M2/47‑93 (MQ=255) gattattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAAttt > 1:4709139‑M2/47‑93 (MQ=255) ttattgcaggcttgggatgatgccagatctggagcatttacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGa < 2:8206070‑M2/49‑1 (MQ=255) ttattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGGGGGTTTGTGGTGTTTTTTTACGTTTATAAGGACCCAGTAAAttt > 2:189873‑M2/45‑93 (MQ=255) ttattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGGG‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTg > 1:5856257‑M2/45‑93 (MQ=255) tattgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGAt > 1:3240681‑M2/44‑93 (MQ=255) attgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGGGA‑‑TTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATa > 2:3546639‑M2/43‑93 (MQ=255) attgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATa < 1:2995415‑M2/51‑1 (MQ=255) attgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATa < 2:8495944‑M2/51‑1 (MQ=255) ttgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAg < 2:9777316‑M2/52‑1 (MQ=255) tgcagacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGt < 2:4761916‑M2/53‑1 (MQ=255) tgacgacttgggatggtgccagatgtggcgcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGt < 1:6042736‑M2/53‑1 (MQ=255) agacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACt < 2:4528431‑M2/56‑1 (MQ=255) agacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACt < 2:2508880‑M2/56‑1 (MQ=255) gacttgggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTg < 1:1459340‑M2/57‑1 (MQ=255) tggggatgatggcagctgtggcgcatgtcggggG‑GGGGGGGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGc < 1:6604444‑M2/60‑1 (MQ=255) cTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTAC‑G‑GGGGGGGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAg < 1:4475990/93‑1 (MQ=255) ttGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTAC‑G‑GGGGGGGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGa > 1:7515629/1‑93 (MQ=255) gggatgatgccagatctggggcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGAt < 2:4645852‑M2/62‑1 (MQ=255) ggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGAtg > 1:2101447‑M2/31‑93 (MQ=255) ggatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGAtg > 1:2525029‑M2/31‑93 (MQ=255) gatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGAtgc > 2:2456008‑M2/30‑93 (MQ=255) gatgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGAtgc > 1:8240376‑M2/30‑93 (MQ=255) tgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGAtgctg < 1:1185932‑M2/66‑1 (MQ=255) tgatgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGAtgctg > 1:8473794‑M2/28‑93 (MQ=255) gaggccagatctggagcatgcacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGAtgctgc < 2:203088‑M2/67‑1 (MQ=255) atgccagatctggagcatgtacgggG‑GGGGG‑GTTTGGGGGGTTCTTTCACGGATAATAGAACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGAtgctgc > 2:4266160‑M2/26‑93 (MQ=255) gatgCCAGATCTGGAGCATGTAC‑GAGGGGGGGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGAtgctgc > 2:9651887/1‑93 (MQ=255) gccagatctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGtt < 2:9363967‑M2/70‑1 (MQ=255) ccAGATCTGGAGCATGTAC‑G‑GGGGGGGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAg > 2:9091626/1‑93 (MQ=255) gttctggagcatgtgcgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGAt < 2:7214006‑M2/74‑1 (MQ=255) atctggagcatgtacgggG‑GGGGG‑GCTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTtagct > 2:10014589‑M2/19‑91 (MQ=255) tctggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGc > 2:6069843‑M2/18‑93 (MQ=255) tggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCtt < 2:1806481‑M2/78‑1 (MQ=255) ggagcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCttt > 2:2580388‑M2/15‑93 (MQ=255) cTGGAGCATGTAC‑G‑GGGGGGGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCtt < 1:5361089/93‑1 (MQ=255) gcatgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTgaa > 2:3276778‑M2/12‑93 (MQ=255) gCATGTAC‑G‑GGGGGGGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTgaaa < 2:8297005/93‑1 (MQ=255) atgtacgggG‑GGGG‑‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTgaaag > 2:2392019‑M2/10‑93 (MQ=255) tgtacgggG‑GGGGG‑GTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTtgaaaa > 1:1426325‑M2/9‑92 (MQ=255) tGTAC‑G‑GGGGGGGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTgaaagaa > 2:4015327/1‑93 (MQ=255) gttgggG‑GGGGGGGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTgaaaga < 2:4450521‑M2/87‑1 (MQ=255) gtaggG‑GGGGGGGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTgaaagaa < 1:6806644‑M2/88‑1 (MQ=255) gtacgG‑GGGGGGGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTgaaagaa > 2:6794023‑M2/6‑93 (MQ=255) gtacgG‑GGGGGGGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTgaaagaa < 1:7411748‑M2/88‑1 (MQ=255) tacgG‑GGGGGGGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTgaaagaaa < 2:6542042‑M2/89‑1 (MQ=255) tacgG‑GGGGGGGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTgaaagaaa < 2:762709‑M2/89‑1 (MQ=255) tacgG‑GGGGGGGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTgaaagaaa > 2:1153999‑M2/5‑93 (MQ=255) tacgG‑GGGGGGGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTgaaagaaa > 2:5462112‑M2/5‑93 (MQ=255) tacgG‑GGGGGGGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTgaaagaaa < 2:8785229‑M2/89‑1 (MQ=255) gaggG‑GGGGGGGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTgaaagaaa < 1:306216‑M2/89‑1 (MQ=255) acgG‑GGGGGGGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAAc < 2:3049011‑M2/90‑1 (MQ=255) g‑gggggggTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCa > 1:3656460/1‑93 (MQ=255) g‑gggggggTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCa < 1:3523825/93‑1 (MQ=255) g‑gggggggTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCa < 2:3877487/93‑1 (MQ=255) | ATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTAC‑G‑GGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCA > NC_000913/526206‑526389 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |