New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4099302 | 3 (0.010) | 119 (0.500) +GGG |
65/164 | 5.3 | 97.5% | coding (41/993 nt) | kdgT | 2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate transport system |
? | NC_000913 | 4099303 = | 3 (0.010) | coding (42/993 nt) | kdgT | 2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate transport system | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
CTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4099211‑4099302 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACG > NC_000913/4099303‑4099394 |||| CTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CGC‑G > 1:5961850/1‑93 CTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑G > 2:885555/1‑93 CTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑G < 2:5968389/93‑1 CTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑G > 1:5089207/1‑93 CTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑G < 2:3649915/93‑1 CTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTCAGAAAAT‑CCC‑G > 1:1034867/1‑93 TGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GG > 1:1080066/1‑93 TGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GG < 1:2769118/93‑1 TGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GG < 1:700399/93‑1 GATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGG < 2:3972166/93‑1 TGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATACAACGCTCGATTGACACACT‑CCC‑GGGGG > 2:2751251/1‑93 TGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGG < 1:3969745/93‑1 GCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGG < 1:1582372/93‑1 GCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGG > 1:5546183/1‑93 TCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGG > 2:3675903/1‑93 CCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGG > 2:4040814/1‑93 CCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGG > 1:2437961/1‑93 CCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGG > 1:5231564/1‑93 ATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGg > 1:577604/1‑92 TTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGatg > 2:1791845/1‑90 TTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGAT > 1:3205491/1‑93 AGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGG‑TGATG > 2:5399566/1‑93 GGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATG > 1:5957705/1‑93 ATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTC > 1:322923/1‑93 TACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGT > 1:3377216/1‑93 GCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGAGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGCTGATGCTCGTCac > 1:433138/1‑91 ATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGGTGGTGCTTGTCCCcc > 1:1622996/1‑91 ATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGGTGATGCTCGTCCCGC > 2:5237352/1‑93 ATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGC > 1:3692287/1‑93 TCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCT > 1:2404844/1‑93 AGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTAT > 2:3741524/1‑93 AGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGCGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGGTGATGCTCGTCCCGCTAT > 1:2184500/1‑93 GCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑‑GGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTC > 1:748849/1‑93 CCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCC > 1:5053768/1‑93 TTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGGTGATGCTCGTCCCGCTATTACTT > 2:5217484/1‑93 TAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTG > 2:3817744/1‑93 AAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTTGC > 1:6191622/1‑93 AATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGGTGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGC > 2:4530144/1‑93 AATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGC > 1:4371881/1‑93 AATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGC > 1:1493336/1‑93 ATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGGTGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACT > 2:1556074/1‑93 TGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTG > 1:3289364/1‑93 CCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG > 2:2553865/1‑93 GACAGGTGAGGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCC < 2:6229223/93‑1 ACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCA > 2:197070/1‑93 ACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCA > 1:2545740/1‑93 ACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCA > 1:2271149/1‑93 AGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCGCGCTATTCCTTTGCGCACAGTGCCACc > 2:1024185/1‑92 AGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACA > 1:1616262/1‑93 GGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACAC > 1:1840/1‑93 GGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACAC > 2:2499572/1‑93 GTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACC < 1:4169980/93‑1 GTGATGAAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACC < 2:859923/93‑1 TGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑‑GGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTT > 1:2573672/1‑93 GATGGAAATGCAGATAAACCCCTCGATTGAGAAAA‑‑CCC‑CGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTC < 1:3880670/93‑1 TGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCT > 1:430943/1‑93 AAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCCCACTGTGCCACACCTTCTCGC > 2:4974159/1‑93 AATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCC > 1:2907114/1‑93 ATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCG > 1:914089/1‑93 TGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGG > 2:241184/1‑93 GCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGG > 1:1946035/1‑93 GCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGG > 1:263907/1‑93 GCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGG > 1:1457646/1‑93 aaaaAAAGCGCCCGAGTGAGAAATC‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGG < 1:3917253/89‑1 AGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGGTGATGCTCGTGCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGG > 2:4350220/1‑93 AGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGG < 1:2110595/93‑1 aaaAAACCGCTCAATGAAAAAAAC‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGC < 2:5992939/90‑1 GATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGC > 2:5860240/1‑93 GATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGC > 2:3594462/1‑93 GATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGC > 1:5874601/1‑93 aAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑‑GGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGG < 2:1919408/92‑1 TAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCCCTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGG > 2:1536516/1‑93 TAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGG > 2:5539059/1‑93 TAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGG > 2:5017679/1‑93 TAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGG > 1:5544223/1‑93 AAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGGTGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGG > 1:5851627/1‑93 AAACGCTGGATGGAGAAAAG‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGG < 1:5862734/93‑1 AAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCCGGGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGG > 2:2898055/1‑93 agCGCTGGATTGAGAAAAT‑‑CC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAA < 1:2846249/91‑1 cCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑‑GGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATA < 2:733159/92‑1 GCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGTTGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAAT > 2:4980373/1‑93 GCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGGAAT > 1:3402086/1‑93 cgCGATTGAAAAAAC‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATA < 1:680294/91‑1 TCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGGAAAAT > 2:5299294/1‑93 TCGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGAGGCGCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACGGTGCCACACCTTTTCGCCGGGGGTGGGGAATTAT > 2:5815162/1‑93 CGATTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATT > 2:3166942/1‑93 TTGAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGGTGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAAGATTTTG > 1:1967324/1‑93 gaaaAAAAC‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGG < 1:4670882/89‑1 agaaAAAAC‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGG < 1:3534990/89‑1 GAGAAAAT‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGA > 1:3671855/1‑93 gaAAAATCCCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGA < 2:932571/91‑1 aAAAAC‑CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATC < 1:2413457/92‑1 AT‑CCC‑‑GGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCA < 1:908015/93‑1 cgggGGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCA < 2:5456370/89‑1 CCC‑GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGTTAATTCAC > 1:4711069/1‑93 gC‑GGGGGGGGGCATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACTCCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACC < 2:45999/92‑1 ccGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCA < 2:2070346/91‑1 GGGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAA < 1:3628958/93‑1 GGGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAAC > 1:5965186/1‑93 GGGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACG < 1:3012636/93‑1 |||| CTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAAT‑CCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4099211‑4099302 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGGGGGATGATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTGCCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACG > NC_000913/4099303‑4099394 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |