New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4099302 | 3 (0.010) | 119 (0.500) +GGG |
65/164 | 5.3 | 97.5% | coding (41/993 nt) | kdgT | 2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate transport system |
? | NC_000913 | 4099303 = | 3 (0.010) | coding (42/993 nt) | kdgT | 2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate transport system | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
ACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGA > NC_000913/4099210‑4099381 | acTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATcc‑‑c > 1:2070346/1‑93 (MQ=255) cTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑g > 2:885555/1‑93 (MQ=255) cTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑g < 2:5968390/93‑1 (MQ=255) cTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑g < 2:5968389/93‑1 (MQ=255) cTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑g < 2:3649915/93‑1 (MQ=255) cTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑g > 1:5089207/1‑93 (MQ=255) cTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTCAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑g > 1:1034867/1‑93 (MQ=255) tGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑gg > 1:1080066/1‑93 (MQ=255) tGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑gg < 1:700399/93‑1 (MQ=255) tGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑gg < 1:2769118/93‑1 (MQ=255) gATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑ggg < 1:3266801/93‑1 (MQ=255) gATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑ggg < 2:3972166/93‑1 (MQ=255) tGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATACAACGCTCGATTGACACACTCC‑‑C‑‑‑‑gggg‑‑‑g > 2:2751251/1‑93 (MQ=255) tGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑gggg‑‑‑g < 1:3969745/93‑1 (MQ=255) gCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑gggg‑‑‑gg > 1:5546183/1‑93 (MQ=255) gCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑gggg‑‑‑gg < 1:1582372/93‑1 (MQ=255) gCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTGAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑gggg‑‑‑gg < 1:5924888/93‑1 (MQ=255) cTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑gggg‑‑‑ggg > 2:2110595/1‑93 (MQ=255) tCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑gggg‑‑‑gggg > 2:3675903/1‑92 (MQ=255) tCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑gggg‑‑‑gggg > 2:4828190/1‑92 (MQ=255) ccATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑gggg‑‑‑ggggg > 2:4040814/1‑91 (MQ=255) ccATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑gggg‑‑‑ggggg > 1:2437961/1‑91 (MQ=255) aTTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑gggg‑‑‑ggggggg > 1:577604/1‑89 (MQ=255) aTTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑gggg‑‑‑ggggggg > 1:4025456/1‑89 (MQ=255) ggAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑GGGG‑‑‑GGGgg‑gatgatg > 1:5957705/1‑90 (MQ=255) aTTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGG‑‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCg > 2:575995/1‑93 (MQ=255) tACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGt > 1:3377216/1‑93 (MQ=255) aTCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGGT‑GATGCTCGTCCCGc > 2:5237352/1‑93 (MQ=255) aTCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGc > 1:3692287/1‑93 (MQ=255) aTCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGc > 1:5292736/1‑93 (MQ=255) tCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCt > 1:2311675/1‑93 (MQ=255) tCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCt > 1:2404844/1‑93 (MQ=255) tCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCt > 1:163227/1‑93 (MQ=255) aGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTAt > 1:1581798/1‑93 (MQ=255) aGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTAt > 2:3741524/1‑93 (MQ=255) aGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGCGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGGT‑GATGCTCGTCCCGCTAt > 1:2184500/1‑93 (MQ=255) gCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGG‑‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTc > 1:748849/1‑93 (MQ=255) ccTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTcc > 1:5053768/1‑93 (MQ=255) ttAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGGT‑GATGCTCGTCCCGCTATTACtt > 2:5217484/1‑93 (MQ=255) ttAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCtt > 1:669827/1‑93 (MQ=255) tAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTg > 2:3817744/1‑93 (MQ=255) aaaaTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTTgc > 1:6191622/1‑93 (MQ=255) aaaTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGG‑‑GGGG‑‑‑GGGGTGGAGGTTCGTCCCCCTATTCCTTgggc > 2:3679801/1‑91 (MQ=255) aaTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGGT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGgcgc > 2:4530144/1‑93 (MQ=255) aaTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGgcgc > 1:4371881/1‑93 (MQ=255) aaTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGgcgc > 1:1493336/1‑93 (MQ=255) atatGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTCTTCCTCTgcgcc > 1:4369150/1‑92 (MQ=255) atGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGGT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACt > 2:1556074/1‑93 (MQ=255) tGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACtg > 1:3289364/1‑93 (MQ=255) ccGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACtgtg > 2:2553865/1‑93 (MQ=255) gACAGGTGATGAAAATGCAGATAAACCGCTCGATGGAGAAACTCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑cc < 1:2936066/93‑1 (MQ=255) gACAGGTGAGGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑cc < 2:6229223/93‑1 (MQ=255) aCAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑Cca > 1:2545740/1‑93 (MQ=255) aCAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑Cca > 1:2271149/1‑93 (MQ=255) aCAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑Cca > 2:197070/1‑93 (MQ=255) aCAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑Cca > 2:835450/1‑93 (MQ=255) cAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAACTCC‑‑C‑‑‑‑GGGGGGTGGGGT‑GCTGCTCGTCCCGCCATTACTCGGGGGTCTGTG‑Ccaa > 1:5654440/1‑92 (MQ=255) cAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑Ccac > 1:3559703/1‑93 (MQ=255) aGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCGCGCTATTCCTTTGCGCACAGTG‑Ccacc > 2:1024185/1‑92 (MQ=255) aGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑Ccaca > 1:1616262/1‑93 (MQ=255) ggTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCacac > 2:2499572/1‑93 (MQ=255) ggTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCacac > 1:1840/1‑93 (MQ=255) gTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACAcc < 1:4169980/93‑1 (MQ=255) gTGATGAAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACAcc < 2:859923/93‑1 (MQ=255) tGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGG‑‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCtt > 1:2573672/1‑93 (MQ=255) gATGGAAATGCAGATAAACCCCTCGATTGAGAAAACCC‑‑CGG‑‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTtc < 1:3880670/93‑1 (MQ=255) aTGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTtc > 2:5373530/1‑93 (MQ=255) tGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTtct > 1:430943/1‑93 (MQ=255) aaaTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCCCACTGTG‑CCACACCTTCTCGc > 2:4974159/1‑93 (MQ=255) aaTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGcc > 1:2907114/1‑93 (MQ=255) aTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCg > 1:914089/1‑93 (MQ=255) aTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCg < 1:880759/93‑1 (MQ=255) tGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCgg > 2:241184/1‑93 (MQ=255) gCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCggg > 1:1457646/1‑93 (MQ=255) gCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCggg > 1:1946035/1‑93 (MQ=255) aGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGGT‑GATGCTCGTGCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCggggg > 2:4350220/1‑93 (MQ=255) aGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCggggg < 1:2110595/93‑1 (MQ=255) gATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCGGGGGc > 1:2005393/1‑93 (MQ=255) gATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCGGGGGc > 2:5860240/1‑93 (MQ=255) gATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCGGGGGc > 1:274609/1‑93 (MQ=255) gATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCGGGGGc > 2:3594462/1‑93 (MQ=255) gATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCGGGGGc > 1:5874601/1‑93 (MQ=255) aaaaaaCCGTCGATGGAAAAAATCC‑‑CGG‑‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCGGGGGCgg < 2:2683780/91‑1 (MQ=255) aTAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGG‑‑GGGG‑‑‑GGGGT‑TATGCTCGTTCCGCCATTTCTTTGCGCACTTTGCCCACACCTT‑TTGCCGGGGGCgg > 2:5002272/1‑93 (MQ=255) tAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCCCTGTG‑CCACACCTTCTCGCCGGGGGCgg > 2:1536516/1‑93 (MQ=255) tAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCGGGGGCgg > 2:5017679/1‑93 (MQ=255) tAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCGGGGGCgg > 1:5544223/1‑93 (MQ=255) aaaaaCGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGG‑‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCGGGGGCggg < 2:1919408/92‑1 (MQ=255) aaaaCGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGGT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCGGGGGCggg > 1:5851627/1‑93 (MQ=255) aaaaCGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGGCCACTGGG‑CCACACCTTCTCGCCGGGGGCggg > 2:1180095/1‑93 (MQ=255) aaaaCGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCGGGGGCggg > 2:5116507/1‑93 (MQ=255) aaaCGCTGGATGGAGAAAAGCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCGGGGGCgggg < 1:5862734/93‑1 (MQ=255) aaaCGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGGGGGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCGGGGGCggg > 2:2898055/1‑93 (MQ=255) agcGCTGGATTGAGAAAATCCGGG‑‑‑‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGaa < 1:2846249/91‑1 (MQ=255) gCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGTT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAat > 2:4980373/1‑93 (MQ=255) gCTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGGAat > 1:3402086/1‑93 (MQ=255) ccTCGATTGAGAAAATCC‑‑CGG‑‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAata < 2:733159/92‑1 (MQ=255) tCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGGAaaat > 2:5299294/1‑93 (MQ=255) tCGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GAGGCGCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACGGTG‑CCACACCTTTTCGCCGGGGGTGGGGAAttat > 2:5815162/1‑93 (MQ=255) cGATTGAGAAAATCC‑‑CGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATAtt > 2:3166942/1‑93 (MQ=255) | ACTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCC‑‑C‑‑‑‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTCGCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGA > NC_000913/4099210‑4099381 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |