| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4099302 | 3 (0.010) | 119 (0.500) +GGG |
65/164 | 5.3 | 97.5% | coding (41/993 nt) | kdgT | 2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate transport system |
| ? | NC_000913 | 4099303 = | 3 (0.010) | coding (42/993 nt) | kdgT | 2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate transport system | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACG > NC_000913/4099211‑4099394 | cTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑g > 2:885555/1‑93 (MQ=255)cTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑g < 2:5968390/93‑1 (MQ=255)cTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑g < 2:5968389/93‑1 (MQ=255)cTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑g < 2:3649915/93‑1 (MQ=255)cTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑g > 1:5089207/1‑93 (MQ=255)cTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTCAGAAAATCCC‑‑‑‑g > 1:1034867/1‑93 (MQ=255) tGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑gg > 1:1080066/1‑93 (MQ=255) tGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑gg < 1:700399/93‑1 (MQ=255) tGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑gg < 1:2769118/93‑1 (MQ=255) gATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGTCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑ggg > 2:3183515/1‑93 (MQ=255) gATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑ggg < 2:3972166/93‑1 (MQ=255) gATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑ggg < 1:3266801/93‑1 (MQ=255) tGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATACAACGCTCGATTGACACACTCCC‑‑‑‑gggg‑‑‑g > 2:2751251/1‑93 (MQ=255) tGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑gggg‑‑‑g < 1:3969745/93‑1 (MQ=255) gCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑gggg‑‑‑gg < 1:1582372/93‑1 (MQ=255) gCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTGAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑gggg‑‑‑gg < 1:5924888/93‑1 (MQ=255) cTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑gggg‑‑‑ggg > 2:2110595/1‑93 (MQ=255) tCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑gggg‑‑‑gggg > 2:3675903/1‑92 (MQ=255) tCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑gggg‑‑‑gggg > 2:4828190/1‑92 (MQ=255) ccATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑gggg‑‑‑ggggg > 1:2437961/1‑91 (MQ=255) ccATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑gggg‑‑‑ggggg > 2:4040814/1‑91 (MQ=255) ccATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑gggg‑‑‑ggggg > 1:5231564/1‑91 (MQ=255) aTTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑gggg‑‑‑ggggggg > 1:577604/1‑89 (MQ=255) aTTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑gggg‑‑‑ggggggg > 1:4025456/1‑89 (MQ=255) ggAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑GGGG‑‑‑GGGgg‑gatgatg > 1:5957705/1‑90 (MQ=255) aTTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGG‑‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCg > 2:575995/1‑93 (MQ=255) tACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGt > 1:3377216/1‑93 (MQ=255) aTCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGGT‑GATGCTCGTCCCGc > 2:5237352/1‑93 (MQ=255) aTCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGc > 1:5292736/1‑93 (MQ=255) aTCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGc > 1:3692287/1‑93 (MQ=255) tCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCt > 1:163227/1‑93 (MQ=255) tCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCt > 1:2311675/1‑93 (MQ=255) aGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTAt > 2:3741524/1‑93 (MQ=255) aGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTAt > 1:1581798/1‑93 (MQ=255) aGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGCGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGGT‑GATGCTCGTCCCGCTAt > 1:2184500/1‑93 (MQ=255) gCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGG‑‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTc > 1:748849/1‑93 (MQ=255) ccTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTcc > 1:5053768/1‑93 (MQ=255) ttAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGGT‑GATGCTCGTCCCGCTATTACtt > 2:5217484/1‑93 (MQ=255) ttAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCtt > 1:669827/1‑93 (MQ=255) tAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTg > 2:3817744/1‑93 (MQ=255) aaaaTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTTgc > 1:6191622/1‑93 (MQ=255) aaaTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGG‑‑GGGG‑‑‑GGGGTGGAGGTTCGTCCCCCTATTCCTTgggc > 2:3679801/1‑91 (MQ=255) aaTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGGT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGgcgc > 2:4530144/1‑93 (MQ=255) aaTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGgcgc > 1:1493336/1‑93 (MQ=255) aaTATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGgcgc > 1:4371881/1‑93 (MQ=255) atatGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTCTTCCTCTgcgcc > 1:4369150/1‑92 (MQ=255) atGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGGT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACt > 2:1556074/1‑93 (MQ=255) tGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACtg > 1:3289364/1‑93 (MQ=255) ccGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACtgtg > 2:2553865/1‑93 (MQ=255) gACAGGTGATGAAAATGCAGATAAACCGCTCGATGGAGAAACTCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑cc < 1:2936066/93‑1 (MQ=255) gACAGGTGAGGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑cc < 2:6229223/93‑1 (MQ=255) aCAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑Cca > 1:2545740/1‑93 (MQ=255) aCAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑Cca > 1:2271149/1‑93 (MQ=255) aCAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑Cca > 2:197070/1‑93 (MQ=255) aCAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑Cca > 2:835450/1‑93 (MQ=255) cAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAACTCCC‑‑‑‑GGGGGGTGGGGT‑GCTGCTCGTCCCGCCATTACTCGGGGGTCTGTG‑Ccaa > 1:5654440/1‑92 (MQ=255) aGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCGCGCTATTCCTTTGCGCACAGTG‑Ccacc > 2:1024185/1‑92 (MQ=255) aGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑Ccaca > 1:1616262/1‑93 (MQ=255) ggTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCacac > 2:2499572/1‑93 (MQ=255) gTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACAcc < 1:4169980/93‑1 (MQ=255) gTGATGAAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACAcc < 2:859923/93‑1 (MQ=255) tGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGG‑‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCtt > 1:2573672/1‑93 (MQ=255) gATGGAAATGCAGATAAACCCCTCGATTGAGAAAACCCCGG‑‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTtc < 1:3880670/93‑1 (MQ=255) aTGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTtc > 2:5373530/1‑93 (MQ=255) aaaTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCCCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑Gc > 2:4974159/1‑93 (MQ=255) aaTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑Gcc > 1:2907114/1‑93 (MQ=255) aTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCg > 1:914089/1‑93 (MQ=255) aTGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCg < 1:880759/93‑1 (MQ=255) gCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCggg > 1:1457646/1‑93 (MQ=255) gCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCggg > 1:1946035/1‑93 (MQ=255) gCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCggg > 1:263907/1‑93 (MQ=255) aGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCggggg < 1:2110595/93‑1 (MQ=255) gATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGc > 1:5874601/1‑93 (MQ=255) gATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGc > 1:274609/1‑93 (MQ=255) gATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGc > 1:2005393/1‑93 (MQ=255) aaaaaaCCGTCGATGGAAAAAATCCCGG‑‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCgg < 2:2683780/91‑1 (MQ=255) aTAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GAGGCTCGTCCCGCTATTCCTGGGCGAACGGGG‑CGACA‑CGTCTCTGCCGGGGGCg > 2:4735481/1‑93 (MQ=255) aTAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGG‑‑GGGG‑‑‑GGGGT‑TATGCTCGTTCCGCCATTTCTTTGCGCACTTTGCCCACACCTT‑TT‑GCCGGGGGCgg > 2:5002272/1‑93 (MQ=255) tAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCCCTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCgg > 2:1536516/1‑93 (MQ=255) tAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCgg > 2:5539059/1‑93 (MQ=255) tAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCgg > 1:5544223/1‑93 (MQ=255) tAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCgg > 2:5017679/1‑93 (MQ=255) aaaaaCGCTCGATTGAGAAAATCCCGG‑‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCggg < 2:1919408/92‑1 (MQ=255) aaaaCGCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGGT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCggg > 1:5851627/1‑93 (MQ=255) aaaCGCTGGATGGAGAAAAGCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCgggg < 1:5862734/93‑1 (MQ=255) aaaCGCTCGATTGAGAAAATCCCGGGGGGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCggg > 2:2898055/1‑93 (MQ=255) gCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGTT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCGGGGAAat > 2:4980373/1‑93 (MQ=255) gCTCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCGGGGGAat > 1:3402086/1‑93 (MQ=255) ccTCGATTGAGAAAATCCCGG‑‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCGGGGAAata < 2:733159/92‑1 (MQ=255) tCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTTCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCGGGGAAatat > 2:182801/1‑93 (MQ=255) tCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCGGGGGAaaat > 2:5299294/1‑93 (MQ=255) tCGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GAGGCGCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACGGTG‑CCACACCTTTTC‑GCCGGGGGTGGGGAAttat > 2:5815162/1‑93 (MQ=255) cGATTGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCGGGGAAATAtt > 2:3166942/1‑93 (MQ=255) ttGAGAAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGGT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCGGGGAAAGATTTTg > 1:1967324/1‑93 (MQ=255) gagaAAATCCCGGG‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGa > 1:3671855/1‑93 (MQ=255) ccgggggg‑‑‑gggAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCa < 2:2070346/89‑1 (MQ=255) ggggggg‑‑‑gggAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCaa < 1:3628958/90‑1 (MQ=255) gggggg‑‑‑gggAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAAc > 1:2512130/3‑93 (MQ=255) gggggg‑‑‑gggAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAAc > 1:5965186/3‑93 (MQ=255) ggggg‑‑‑gggAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACg < 1:3012636/92‑1 (MQ=255) | CTGATGCTCCATTGAGGAATTACGCATCAGCCCTTAAAAATATGCCGACAGGTGATGGAAATGCAGATAAAACGCTCGATTGAGAAAATCCC‑‑‑‑GGGG‑‑‑GGGAT‑GATGCTCGTCCCGCTATTCCTTGGCGCACTGTG‑CCACACCTTCTC‑GCCGGGGGCGGGGAAATATTTTGGATCATTCACCAACG > NC_000913/4099211‑4099394 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |