| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 3,156,257 | (CCA)2→1 | coding (594‑596/930 nt) | yqhG → | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3156256 | 2 (0.010) | 372 (1.120) | 140/178 | 0.2 | 99.5% | coding (593/930 nt) | yqhG | hypothetical protein |
| ? | NC_000913 | 3156260 = | 2 (0.010) | coding (597/930 nt) | yqhG | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 400 total aligned reads displayed.
AAAGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3156162‑3156256‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATC > NC_000913/3156260‑3156351 AAAGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGC < 2:7417725/93‑1 AGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCA < 2:4391540/93‑1 AGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCA > 2:3489714/1‑93 AGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCA < 2:4946252/93‑1 gagCAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAG < 2:707025/90‑1 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AAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATG < 1:5138063/93‑1 AGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGC > 2:2076253/1‑93 CCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCT < 1:2312489/93‑1 CCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCT < 1:1821385/93‑1 CTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTT < 2:6528066/93‑1 CTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTT > 2:8054720/1‑93 TTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTC < 2:1409446/93‑1 TTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCT > 2:4723210/1‑93 TGTTGCCGAGCTCTTTAAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTA < 1:1520755/93‑1 TGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTA > 1:1018851/1‑93 GTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGGTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTAT > 2:1098497/1‑93 CGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAAC < 1:6301495/93‑1 CGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGATTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAAC < 1:7871768/93‑1 GAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACC > 2:2005776/1‑93 GAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACC > 2:6715548/1‑93 GAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACC > 1:4044297/1‑93 AACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCA > 2:4147534/1‑93 ACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCAC > 1:5481778/1‑93 ACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCAC > 1:682078/1‑93 CTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTTGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTCGTGTCTCATATAAAACCACC > 2:6136426/1‑93 TCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCT > 2:3011158/1‑93 TCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCT < 1:815486/93‑1 TCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCT < 2:1665545/93‑1 TCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACAGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCT > 1:8517608/1‑93 CTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTT < 1:7131836/93‑1 CTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTT > 2:3540860/1‑93 TTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCA < 2:2814697/93‑1 TTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCA < 2:4497036/93‑1 TGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAA < 1:3263670/93‑1 TGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAA < 2:3766381/93‑1 CATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGCCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACG > 1:8330080/1‑93 ATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGc > 1:8466338/1‑92 ATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGG > 2:5236017/1‑93 TATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGC > 2:7912868/1‑93 TGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAA > 2:6917542/1‑93 GATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAAT > 2:3338010/1‑93 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TGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATA > 1:655530/1‑93 TGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATA > 1:3134711/1‑93 TGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATA > 2:10049/1‑93 GGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGA > 2:2461710/1‑93 GTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAA < 1:6765058/93‑1 TGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAAC < 2:5742995/93‑1 TGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAAC < 1:8795237/93‑1 TGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAAC < 1:6007455/93‑1 TGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAAC < 2:1768142/93‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |