| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 3,156,257 | (CCA)2→1 | coding (594‑596/930 nt) | yqhG → | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3156256 | 2 (0.010) | 372 (1.120) | 140/178 | 0.2 | 99.5% | coding (593/930 nt) | yqhG | hypothetical protein |
| ? | NC_000913 | 3156260 = | 2 (0.010) | coding (597/930 nt) | yqhG | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 397 total aligned reads displayed.
CAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCACCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATCC > NC_000913/3156168‑3156352 | gagcagccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccag < 2:707025‑M2/1‑1 (MQ=255)gaacagccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccag < 2:5111340‑M2/1‑1 (MQ=255)gaacagccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccag < 2:3720805‑M2/1‑1 (MQ=255) acagccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGc > 1:179451‑M2/91‑93 (MQ=255) acagccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGc > 1:3676647‑M2/91‑93 (MQ=255) acagccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttcagactcttaccgccaGGc > 1:269668‑M2/91‑93 (MQ=255) agccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCgg < 1:7959361‑M2/5‑1 (MQ=255) gccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGt < 1:4403587‑M2/6‑1 (MQ=255) gccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGt > 2:433436‑M2/88‑93 (MQ=255) gccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGt < 1:2117136‑M2/6‑1 (MQ=255) gccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGt < 2:2038898‑M2/6‑1 (MQ=255) gccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGt > 1:5252209‑M2/88‑93 (MQ=255) ccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGtt < 2:5894058‑M2/7‑1 (MQ=255) ggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTaa > 2:2340901‑M2/85‑93 (MQ=255) gaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAAt > 1:4676030‑M2/84‑93 (MQ=255) agcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGc < 2:7186980‑M2/12‑1 (MQ=255) cctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCt < 1:4762371‑M2/14‑1 (MQ=255) ctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCtt < 2:6528066‑M2/15‑1 (MQ=255) tttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTc > 2:5154367‑M2/78‑93 (MQ=255) tttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTc < 2:1409446‑M2/16‑1 (MQ=255) gttgGCCAACTCTTTTAACATCTTGCTGATTATATCTGGTCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGCCTCTGACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCtat < 1:2968435/93‑1 (MQ=255) tgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCta > 1:1018851‑M2/76‑93 (MQ=255) gttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCtat < 1:3122497‑M2/19‑1 (MQ=255) gttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCtat > 2:1560099‑M2/75‑93 (MQ=255) gttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtgggttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCtat > 2:1098497‑M2/75‑93 (MQ=255) ccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATaaaa > 2:4693513‑M2/71‑93 (MQ=255) cgaactcgttgaacatattgctgattatagcgggcggtggacatgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAac < 1:6301496‑M2/24‑1 (MQ=255) gaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAacc > 2:6715548‑M2/69‑93 (MQ=255) aactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAacca > 1:3827038‑M2/68‑93 (MQ=255) aactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAacca < 1:1543199‑M2/26‑1 (MQ=255) actctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAaccac > 1:5481778‑M2/67‑93 (MQ=255) actctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAaccac > 1:682078‑M2/67‑93 (MQ=255) ctctttgaacatattgctgattatagcttgccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTCGTGTCTCATATAAAaccacc > 2:6136426‑M2/66‑93 (MQ=255) ctctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAaccacc < 1:4191064‑M2/28‑1 (MQ=255) ctctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAaccacc > 2:8055870‑M2/66‑93 (MQ=255) tctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCt > 2:3011158‑M2/65‑93 (MQ=255) tctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttacagccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCt > 1:8517608‑M2/65‑93 (MQ=255) ctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCtt > 2:3540860‑M2/64‑93 (MQ=255) ctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCtt > 1:191853‑M2/64‑93 (MQ=255) ctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCtt < 1:7131836‑M2/30‑1 (MQ=255) ttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCa < 2:2814697‑M2/32‑1 (MQ=255) aacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgcctcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCCCCTTCAAGa < 2:5785932‑M2/35‑1 (MQ=255) catattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGCCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACg > 1:8330080‑M2/57‑93 (MQ=255) atattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGAcgc > 1:8466338‑M2/56‑92 (MQ=255) tattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGc > 2:3380938‑M2/55‑93 (MQ=255) tattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGc > 2:1661961‑M2/55‑93 (MQ=255) attgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGcc < 2:5625776‑M2/40‑1 (MQ=255) attgctgattatagcaggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGACGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGcc > 1:4969798‑M2/54‑93 (MQ=255) ctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaata > 2:7956099‑M2/50‑93 (MQ=255) ctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaata > 2:1829508‑M2/50‑93 (MQ=255) tgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaataa > 2:6917542‑M2/49‑93 (MQ=255) attatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCACGACGGCCAatcatc > 1:6660430‑M2/47‑93 (MQ=255) attatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATc > 1:8152117‑M2/47‑93 (MQ=255) ttatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATcc < 2:2628301‑M2/48‑1 (MQ=255) ttatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATcc < 1:1620575‑M2/48‑1 (MQ=255) ttatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATcc < 2:1712131‑M2/48‑1 (MQ=255) tatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATccc < 1:7377043‑M2/49‑1 (MQ=255) atagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAATACGGCCAATAATCCCg > 1:7821887‑M2/44‑93 (MQ=255) atagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCg > 2:2894638‑M2/44‑93 (MQ=255) tagctggccgtgggggtgtgtggtttccgcctcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGa < 1:2520018‑M2/51‑1 (MQ=255) tagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGa > 2:2208185‑M2/43‑93 (MQ=255) gctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATg > 1:4038860‑M2/41‑93 (MQ=255) tggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGaa > 1:4454157‑M2/39‑93 (MQ=255) gccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGa > 1:1176950‑M2/37‑93 (MQ=255) gccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGa < 1:8704404‑M2/57‑1 (MQ=255) ccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGat > 2:3335911‑M2/36‑93 (MQ=255) cgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGata < 1:6127320‑M2/59‑1 (MQ=255) gtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGatat < 1:1987224‑M2/60‑1 (MQ=255) gtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGatat < 2:7303073‑M2/60‑1 (MQ=255) tggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATg > 1:5157045‑M2/33‑93 (MQ=255) cgtgggtggtttccgcctcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCaaa < 2:4130100‑M2/65‑1 (MQ=255) cgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCaaa < 2:7672536‑M2/65‑1 (MQ=255) tgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATa > 2:10049‑M2/27‑93 (MQ=255) gggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAg < 2:4489319‑M2/68‑1 (MQ=255) ggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGa > 2:2461710‑M2/25‑93 (MQ=255) ggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGa < 1:430649‑M2/69‑1 (MQ=255) gtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGaa < 1:6765058‑M2/70‑1 (MQ=255) tggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAAc < 1:8795237‑M2/71‑1 (MQ=255) tggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAAc < 1:6007455‑M2/71‑1 (MQ=255) ggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACg < 1:3210500‑M2/72‑1 (MQ=255) ggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACg > 2:2107117‑M2/22‑93 (MQ=255) ggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACg > 1:6450215‑M2/22‑93 (MQ=255) ggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACg < 1:7441501‑M2/72‑1 (MQ=255) ttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCa < 2:348354‑M2/75‑1 (MQ=255) tccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCaa < 2:4879792‑M2/76‑1 (MQ=255) actcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAattta > 2:6297179‑M2/14‑93 (MQ=255) actcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAattta < 1:7671781‑M2/80‑1 (MQ=255) ctcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAatttat < 2:3648698‑M2/81‑1 (MQ=255) tcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAatttatt > 2:4034545‑M2/12‑93 (MQ=255) cttaccgccaGGGGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAatttattt > 2:1288861‑M2/11‑93 (MQ=255) cttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAACCCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAatttattt < 2:5261463‑M2/83‑1 (MQ=255) taccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTAc < 2:884547‑M2/85‑1 (MQ=255) taccgccaGGCAGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTAc < 1:1512058‑M2/85‑1 (MQ=255) gccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACa < 1:6952580‑M2/89‑1 (MQ=255) gccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACa < 2:8653997‑M2/89‑1 (MQ=255) caGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAt < 1:5738142‑M2/91‑1 (MQ=255) caGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAt < 2:7485533‑M2/91‑1 (MQ=255) caGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAt > 1:6603339‑M2/3‑93 (MQ=255) caGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAAACACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAt > 2:3142252‑M2/3‑93 (MQ=255) ggCGGTTAATGCCTTCTATAAACCCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATcc < 2:8282479/93‑1 (MQ=255) | CAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCACCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATCC > NC_000913/3156168‑3156352 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |