| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP025268 | = 3743324 | 0 (0.000) | 163 (0.500) | 62/274 | 1.6 | 100% | intergenic (‑100/‑82) | yiaJ/galK | IclR family transcriptional regulator YiaJ/galactokinase |
| ? | NZ_CP025268 | 3744556 = | 0 (0.000) | intergenic (+2/‑99) | galK/yiaK | galactokinase/3‑dehydro‑L‑gulonate 2‑dehydrogenase | |||||
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
TCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑A‑C‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_CP025268/3743188‑3743324‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTAAT > NZ_CP025268/3744556‑3744693 TCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAG > 1:3025118/1‑140 TTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGC > 1:4571486/1‑140 TCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCC < 2:4755931/140‑1 TCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCC < 2:3060853/140‑1 TCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCC < 1:4558034/140‑1 TCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCC < 2:2080878/140‑1 TCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCC < 2:4897248/140‑1 TCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCC < 1:1780205/140‑1 TCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCC < 2:5315727/140‑1 TCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAGA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATAAATCAGATTGCC < 1:1780237/140‑1 TCTCTTTTTTTCACATCGCTTCTTGCCCCATTTTGTCGCGTCCTGCTGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAAGTTATAGC‑C‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTAATCAATCAGATTGCC < 2:4756395/140‑1 CTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCCT > 2:2828576/1‑140 TTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCCTTGT < 1:5145946/140‑1 TTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCCTTGT > 2:2639960/1‑140 TTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCCTTGTTAAA < 1:5156644/140‑1 TTTCACATCACTCCTTTCCCCACTGTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGAAAGATAATTTATA‑A‑CAAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCCTTGTTAAA < 2:4416029/140‑1 CATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTG < 2:2797776/140‑1 ATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGCTGGTAGCGCCAAGTGTGCCGTAGTTCACGCGCTCGACAGATAATTGATA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCGTCAATCAAATTGCCTTGTTAAAAAGTGA > 2:446964/1‑140 ATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGA > 1:4984175/1‑140 ATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGA > 1:4288280/1‑140 TCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAT < 1:478142/140‑1 TCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAATTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATT > 1:212872/1‑140 TCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATT > 2:783852/1‑140 TCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATT > 1:829050/1‑140 TCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATT > 2:4020126/1‑140 TCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATT > 1:3658742/1‑140 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TTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTG > 2:2716788/1‑140 ATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGACATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAG < 2:1550577/140‑1 ATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAG < 1:2978966/140‑1 ATGTCTTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAG < 2:2453962/140‑1 ATGTCTTTTGAAAGTCATCAATCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAGAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAACCTGGGATGAAATTGACATTTGAG > 2:3368532/1‑140 ATGTATTTTGAAATTCATCAATCAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATAGATATATTTGAAATCAAGTTTCGAATATTGAAATGTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAG < 2:4675928/140‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |