| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP025268 | = 3743324 | 0 (0.000) | 163 (0.500) | 62/274 | 1.6 | 100% | intergenic (‑100/‑82) | yiaJ/galK | IclR family transcriptional regulator YiaJ/galactokinase |
| ? | NZ_CP025268 | 3744556 = | 0 (0.000) | intergenic (+2/‑99) | galK/yiaK | galactokinase/3‑dehydro‑L‑gulonate 2‑dehydrogenase | |||||
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
GCTGTATCGTCGCGCTGATCCCGGAAGAGCTGGTGCCTGCCGTACAGCAAGCTGTCGCTGAACAATATGAAGCAAAAACAGGTATTAAAGAGACTTTTTACGTTTGTAAACCATCACAAGGAGCAGGACAGTGCTGACAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTAAT > NZ_CP025268/3744418‑3744693 | tctcgttctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAg > 1:3025118‑M2/139‑140 (MQ=255) ttctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGc > 1:4571486‑M2/134‑140 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 2:4755931‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 2:3060853‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 1:4558034‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 2:2080878‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 2:4897248‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 1:1780205‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 2:5315727‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttagaaccaattgatttttatgtcttttgaaattcataaatcAGATTGcc < 1:1780237‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttttttcacatcgcttcttgccccattttgtcgcgtcctgctggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataagttatagccaattgatttttatgtcttttgaaattaatcaatcAGATTGcc < 2:4756395‑M2/8‑1 (MQ=255) ctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCt > 2:2828576‑M2/132‑140 (MQ=255) tttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGt < 1:5145946‑M2/12‑1 (MQ=255) tttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGt > 2:2639960‑M2/129‑140 (MQ=255) tttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTaaa < 1:5156644‑M2/16‑1 (MQ=255) tttcacatcactcctttccccactgtgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgaaagataatttataacaaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTaaa < 2:4416029‑M2/16‑1 (MQ=255) catcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTg < 2:2797776‑M2/21‑1 (MQ=255) atcacttctttccccattttgtcgcgtcctgctggtagcgccaagtgtgccgtagttcacgcgctcgacagataattgataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcgtcaatcAAATTGCCTTGTTAAAAAGTGa > 2:446964‑M2/119‑140 (MQ=255) atcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGa > 1:4984175‑M2/119‑140 (MQ=255) atcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGa > 1:4288280‑M2/119‑140 (MQ=255) tcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt < 1:478142‑M2/23‑1 (MQ=255) tccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaattgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATAtt > 1:212872‑M2/109‑140 (MQ=255) tccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATAtt > 2:783852‑M2/109‑140 (MQ=255) tccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATAtt > 1:829050‑M2/109‑140 (MQ=255) tccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATAtt > 2:4020126‑M2/109‑140 (MQ=255) tccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATAtt > 1:3658742‑M2/109‑140 (MQ=255) 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> 1:3180505‑M2/93‑140 (MQ=255) cctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgctctcgacagttaatttataaccaattgatttttatgtcttttgaatttcgtcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCACGTTTCGCa < 2:3355400‑M2/49‑1 (MQ=255) ggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGa < 1:5010842‑M2/55‑1 (MQ=255) agcgcaaagtgttccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAAt > 2:5520827‑M2/83‑140 (MQ=255) agcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAAt > 1:2450120‑M2/83‑140 (MQ=255) agcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAAt > 1:2180657‑M2/83‑140 (MQ=255) gcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAAtt > 2:2582797‑M2/82‑140 (MQ=255) caaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTa < 1:1073472‑M2/62‑1 (MQ=255) aagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgattgttaggtcttttgaaatgcatcaatcAGATTGCCTTGTAAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAg > 2:4329586‑M2/77‑140 (MQ=255) agtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGc > 2:2948524‑M2/76‑140 (MQ=255) ggtgccgtagttcactatctcgtcaggtaatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGAGTGCCTTGTGAAAAATTGAACTATATATTTGAAATCAAGTTTCGTATATGGAAATTTTAAGTCa > 2:1738135‑M2/74‑140 (MQ=255) gccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCaaaa > 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acagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAg < 1:1321159‑M2/89‑1 (MQ=255) cagctaatttataactaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGGTTCGCATTTTGAAAGTTTAAGCCAAGAAAGCGATCAAAAAAACAAgg < 2:558255‑M2/90‑1 (MQ=255) cagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATCTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAgg < 2:1613586‑M2/90‑1 (MQ=255) agataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGa < 2:4288280‑M2/91‑1 (MQ=255) agataatgtataaccaacttatctttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTGTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAACGCGATCAAAAAAACAAGGa < 2:4383875‑M2/91‑1 (MQ=255) aatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGcc < 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1:1168253‑M2/34‑140 (MQ=255) ttgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTg > 1:578721‑M2/33‑140 (MQ=255) tgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGa < 1:1359612‑M2/109‑1 (MQ=255) tttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACAt < 2:2625381‑M2/112‑1 (MQ=255) tttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACAttt > 2:5223271‑M2/27‑140 (MQ=255) ttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTg > 2:2716788‑M2/26‑140 (MQ=255) 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2:4790195‑M2/20‑140 (MQ=255) tttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTa > 2:3061409‑M2/18‑140 (MQ=255) aaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAag < 1:5349125‑M2/127‑1 (MQ=255) aaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAag < 1:758‑M2/127‑1 (MQ=255) aaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAag < 1:5058710‑M2/127‑1 (MQ=255) aaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAag < 2:3025118‑M2/127‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTAAt < 1:2828576‑M2/138‑1 (MQ=255) tcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTAAt < 1:5174134‑M2/138‑1 (MQ=255) | GCTGTATCGTCGCGCTGATCCCGGAAGAGCTGGTGCCTGCCGTACAGCAAGCTGTCGCTGAACAATATGAAGCAAAAACAGGTATTAAAGAGACTTTTTACGTTTGTAAACCATCACAAGGAGCAGGACAGTGCTGACAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTAAT > NZ_CP025268/3744418‑3744693 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |