| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AM406671 | 778852 = | 1170 (0.970) | 130 (0.190) +GTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCA |
11/172 | 22.8 | 15.7% | intergenic (+11/+180) | rbsB/ps301 | ribose ABC transporter substrate binding protein RbsB/putative integrase |
| ? | AM406671 | 2063454 = | 1243 (1.030) | intergenic (‑244/+964) | sunL/ps461 | Ribosomal RNA small subunit methyltransferase B/bacteriophage lysin | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
TGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AM406671/778988‑778852‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACATATCTT > AM406671/2063454‑2063546 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTA > 2:2760086/1‑149 TAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACAT > 2:6729234/1‑149 AATTATCTTGTATAACTTTTAAACACACCATTACTACTCAACACCTTTATTTTCCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTTTATTAACCTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATT < 2:676869/149‑1 TTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGA > 1:8787373/1‑149 ATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTA < 2:2310260/149‑1 TAACTTTTAAAGACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTAT > 2:8510366/1‑149 ACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTT > 2:6159670/1‑149 CTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTT < 2:2973383/149‑1 AAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACAAAAATATAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGC > 2:1575276/1‑149 ACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGC > 1:3760481/1‑149 TTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGA > 1:10097121/1‑149 AATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGA < 1:6729234/149‑1 ATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTATATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAA < 1:9716498/149‑1 AAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTT > 2:1849585/1‑149 CCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGAC < 1:3196412/149‑1 CCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGAC > 2:925749/1‑149 CTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACA < 1:9904002/149‑1 CTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACA < 1:7184020/149‑1 CTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATANGACA < 1:3261648/149‑1 TAGCGACGGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACGGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAA < 2:5689042/149‑1 TAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAA > 2:2253834/1‑149 TAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAA < 2:6651118/149‑1 TAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAA < 1:9057776/149‑1 TAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAA < 1:1535360/149‑1 TAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGCCTACAAAGGGGCATCATGGTCCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAA > 1:1874174/1‑149 AGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAAT > 2:5453023/1‑149 AGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAAT < 1:7302808/149‑1 GCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATC > 1:3558315/1‑149 GCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATC > 1:8235585/1‑149 GCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATC < 2:4746646/149‑1 GCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATC < 1:6108252/149‑1 GCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATC < 1:5015319/149‑1 CGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCT < 2:7912051/149‑1 CGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCT > 2:10153183/1‑149 CGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCT > 2:5044288/1‑149 CGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCT > 2:8916148/1‑149 CGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCT < 1:2051280/149‑1 CGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCT < 2:6476157/149‑1 GACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTG < 1:2969061/149‑1 ACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGNGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGC < 1:5842692/149‑1 ACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGC < 1:748721/149‑1 ACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGC < 1:7625348/149‑1 ACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGC < 2:4059554/149‑1 ACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGC > 2:4345425/1‑149 CAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCA > 1:4600639/1‑149 CAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCA > 2:106958/1‑149 CAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCA > 2:286518/1‑149 CAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCA > 1:8712956/1‑149 CAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCA > 1:4264504/1‑149 CAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCA > 1:7853324/1‑149 CAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCA < 1:4672819/149‑1 AGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAG < 2:3866903/149‑1 AGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAG < 1:2462651/149‑1 AGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCG > 1:4160571/1‑99 AGAGGTAAATACTTTAAAACTAACACTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAGCGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAG > 2:5739954/1‑149 GAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGC < 2:9566672/149‑1 GAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGC > 1:4455903/1‑149 GAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGC < 1:5348697/149‑1 AGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAACGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCA > 2:3239892/1‑149 AGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCA > 1:9884895/1‑149 AGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCA > 1:7770157/1‑149 AGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCA > 2:2843177/1‑149 AGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCA > 1:1691358/1‑149 AGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCA > 1:2824804/1‑149 AGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCA > 2:7170492/1‑149 AGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCA > 2:9217097/1‑149 AGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATAGTTCTTGCTAGACTAGAACCAGCGACCGAAAGGTTAGCTACCAAATGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCA > 2:647042/1‑149 GGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCAC < 1:9200560/149‑1 GGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCAC > 2:8712711/1‑149 GGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCAC < 1:6223080/149‑1 GGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCAC < 1:6412991/149‑1 GTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACA < 1:3621439/149‑1 GTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACA > 2:466810/1‑149 GTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCGACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACA < 1:6720264/149‑1 GTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATCATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACA < 2:7651978/149‑1 TAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACAT < 2:9495308/149‑1 TAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACAT > 2:1979774/1‑149 TAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCGAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACAT > 2:4972889/1‑149 TAAATACGTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACAT < 1:9097245/149‑1 AAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAACAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACATA > 1:10014913/1‑149 AAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACATA < 1:4792490/149‑1 AAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACATA < 1:1197830/149‑1 AATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAACAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACATAT < 2:1652947/149‑1 AATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAANCNGCGACNGAACGGTTAGCTNCCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACATAT > 1:802140/1‑149 AATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACATAT > 1:950594/1‑149 AATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACATAT > 1:8412435/1‑149 AATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACATAT > 1:1057438/1‑149 AATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACATAT > 1:3352137/1‑149 AATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACATAT < 1:2774959/149‑1 AATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACATAT > 2:5162360/1‑149 ATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACATATC > 2:8153147/1‑149 ATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACATATC > 2:5977727/1‑149 TACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACATATCT < 1:5466607/149‑1 ACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTTTTTTATAAAAATGGTCTACAAAAGGGCATTATGGTACTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCGACCAACTGAGCGAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACATATCTT < 1:2574501/149‑1 ACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACATATCTT < 1:2913216/149‑1 ACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACATATCTT > 2:351008/1‑149 ACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACATATCTT > 1:6924880/1‑149 ACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACATATCTT > 1:3984289/1‑149 ACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACATATCTT < 1:7306471/149‑1 ACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACATATCTT > 1:3979410/1‑149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AM406671/778988‑778852‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCACATATCTT > AM406671/2063454‑2063546 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |